223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_1118 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_1118  3'-5' exonuclease  100 
 
 
210 aa  437  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1147  3'-5' exonuclease  99.52 
 
 
210 aa  436  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.546163 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3799  3'-5' exonuclease  77.29 
 
 
209 aa  340  5.999999999999999e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.954695 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1621  3'-5' exonuclease  71.01 
 
 
207 aa  323  2e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.169628  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1914  3'-5' exonuclease  71.01 
 
 
209 aa  320  7e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.194823 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2509  3'-5' exonuclease  69.08 
 
 
209 aa  303  1.0000000000000001e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2246  3'-5' exonuclease  65.37 
 
 
217 aa  289  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.520239  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0678  3'-5' exonuclease  62.44 
 
 
211 aa  279  2e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0407  3'-5' exonuclease  58.82 
 
 
214 aa  249  1e-65  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.23143  normal  0.475558 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17051  putative ribonuclease D  56.31 
 
 
214 aa  250  1e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20321  putative ribonuclease D  56.86 
 
 
214 aa  244  6e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1157  putative ribonuclease D  56.37 
 
 
214 aa  243  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1922  3'-5' exonuclease  56.86 
 
 
214 aa  240  1e-62  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0431536  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1676  putative ribonuclease D  54.55 
 
 
211 aa  230  1e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.137272  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17761  putative ribonuclease D  52.91 
 
 
211 aa  230  1e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17921  putative ribonuclease D  54.55 
 
 
211 aa  226  1e-58  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17711  putative ribonuclease D  51.94 
 
 
213 aa  226  2e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.606229  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22631  putative ribonuclease D  60.57 
 
 
212 aa  220  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.528712 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0179  3'-5' exonuclease  54 
 
 
206 aa  209  3e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00803697  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0047  3'-5' exonuclease  52.5 
 
 
204 aa  205  4e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0125  putative 3'-5' exonuclease family protein  53 
 
 
204 aa  204  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00602859  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3589  3'-5' exonuclease  54.05 
 
 
203 aa  202  2e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0174  3'-5' exonuclease  52 
 
 
204 aa  202  4e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0327  3'-5' exonuclease  51 
 
 
213 aa  200  9.999999999999999e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0171  3'-5' exonuclease  51.5 
 
 
206 aa  197  7e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0659  3'-5' exonuclease  51 
 
 
204 aa  197  9e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.265112 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0419  3'-5' exonuclease  50.5 
 
 
204 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0196  3'-5' exonuclease  53.23 
 
 
203 aa  196  2.0000000000000003e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.950897 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0228  3'-5' exonuclease  51.35 
 
 
203 aa  195  5.000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0572  3'-5' exonuclease  52.69 
 
 
204 aa  194  8.000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4954  3'-5' exonuclease  47.85 
 
 
205 aa  193  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.332898  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0155  3'-5' exonuclease  54.3 
 
 
204 aa  192  3e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.299764 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0120  ribonuclease D  50 
 
 
208 aa  192  3e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.818192  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2609  3'-5' exonuclease  51.08 
 
 
204 aa  192  4e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4028  3'-5' exonuclease  50 
 
 
208 aa  191  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5125  3'-5' exonuclease  51.31 
 
 
207 aa  190  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0268839  normal  0.933758 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2775  3'-5' exonuclease  50 
 
 
204 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3464  3'-5' exonuclease  48.5 
 
 
208 aa  188  4e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2425  3'-5' exonuclease  48.69 
 
 
209 aa  188  5e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2813  3'-5' exonuclease  48.68 
 
 
204 aa  188  5e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1152  ribonuclease D  48.68 
 
 
204 aa  188  5.999999999999999e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2343  3'-5' exonuclease  53.4 
 
 
205 aa  188  5.999999999999999e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.151538 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0816  3'-5' exonuclease  51.61 
 
 
216 aa  187  7e-47  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00362431  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2720  3'-5' exonuclease  48.17 
 
 
209 aa  186  3e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.149721  normal  0.0609935 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2497  3'-5' exonuclease  47.64 
 
 
209 aa  185  4e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.325432  normal  0.308179 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4358  3'-5' exonuclease  49 
 
 
208 aa  184  7e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00583903 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1011  3'-5' exonuclease family protein  49.73 
 
 
204 aa  184  7e-46  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0881939  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5275  3'-5' exonuclease  49 
 
 
204 aa  184  9e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.28449  normal  0.0567423 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0529  3'-5' exonuclease family protein  48.69 
 
 
206 aa  184  1.0000000000000001e-45  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5922  3'-5' exonuclease  48 
 
 
204 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0068  3'-5' exonuclease  48.7 
 
 
206 aa  181  5.0000000000000004e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0135  3'-5' exonuclease  51.08 
 
 
205 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0117  3'-5' exonuclease family protein  50.54 
 
 
205 aa  180  1e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3251  3'-5' exonuclease  49.21 
 
 
205 aa  179  2e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0878  3'-5' exonuclease  50.54 
 
 
206 aa  177  7e-44  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0120  3'-5' exonuclease family protein  50 
 
 
205 aa  177  1e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.328382  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0027  3'-5' exonuclease  46.49 
 
 
204 aa  175  4e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.189554  normal  0.37885 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3984  3'-5' exonuclease  48 
 
 
205 aa  175  5e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0109  3'-5' exonuclease  48.11 
 
 
204 aa  175  5e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.378562  normal  0.35649 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2903  3'-5' exonuclease  48.69 
 
 
205 aa  174  6e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.865613  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0015  3'-5' exonuclease  47.85 
 
 
206 aa  175  6e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1669  3'-5' exonuclease  48.95 
 
 
218 aa  171  6.999999999999999e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.335885  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1219  3'-5' exonuclease domain-containing protein  50 
 
 
206 aa  167  1e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000485799  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0333  3'-5' exonuclease  45.5 
 
 
210 aa  165  5e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.273167  normal  0.287022 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1164  3'-5' exonuclease  33.33 
 
 
550 aa  83.2  0.000000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0638405  normal  0.521406 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1121  ribonuclease D  34.84 
 
 
392 aa  74.3  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.441992  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4526  ribonuclease D  34.62 
 
 
394 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.780043  normal  0.636279 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2365  ribonuclease D  35.19 
 
 
392 aa  74.7  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3166  DNA-directed DNA polymerase  30.68 
 
 
582 aa  73.6  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5131  ribonuclease D  33.55 
 
 
389 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3039  ribonuclease D  33.12 
 
 
384 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.178838  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1310  ribonuclease D  34.84 
 
 
393 aa  72.8  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0761558  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3636  3'-5' exonuclease  31.41 
 
 
381 aa  72.4  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.172491  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0506  ribonuclease D  33.75 
 
 
395 aa  72  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.967739 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3141  ribonuclease D  31.76 
 
 
384 aa  72  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.579669 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2915  ribonuclease D  31.76 
 
 
384 aa  72  0.000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.71174 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0414  3'-5' exonuclease  34.66 
 
 
295 aa  72  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1588  ribonuclease D  34.62 
 
 
384 aa  71.6  0.000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0971  DNA-directed DNA polymerase  30 
 
 
583 aa  70.9  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06230  ribonuclease D  31.58 
 
 
399 aa  70.1  0.00000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.000000184069  hitchhiker  0.0058155 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2949  ribonuclease D  31.9 
 
 
392 aa  69.3  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.967436  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2546  ribonuclease D  35.25 
 
 
389 aa  68.6  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3138  ribonuclease D  32.9 
 
 
382 aa  67.4  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.340789 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12160  ribonuclease D  34.27 
 
 
392 aa  67.4  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2542  ribonuclease D  32.24 
 
 
385 aa  67.4  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0443  ribonuclease D, putative  31.1 
 
 
381 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1589  ribonuclease D  31.52 
 
 
382 aa  66.6  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2334  ribonuclease D  33.54 
 
 
384 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.323596 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2112  ribonuclease D  33.81 
 
 
396 aa  67.4  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1102  ribonuclease D  32.26 
 
 
381 aa  67  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.447104 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3324  ribonuclease D  33.33 
 
 
427 aa  67  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.342463  normal  0.392849 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0744  ribonuclease D  32.74 
 
 
385 aa  67  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0750  ribonuclease D  33.97 
 
 
385 aa  66.6  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1249  ribonuclease D  32.26 
 
 
381 aa  66.2  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.606694  normal  0.0871939 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01380  ribonuclease D  28.65 
 
 
382 aa  66.6  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004089  ribonuclease D  29.19 
 
 
388 aa  66.2  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000003136  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1887  putative ribonuclease D  32.73 
 
 
385 aa  65.9  0.0000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0137487  normal  0.150443 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3191  3'-5' exonuclease  31.98 
 
 
382 aa  65.5  0.0000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2378  ribonuclease D  32.28 
 
 
388 aa  65.1  0.0000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0306951  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2494  ribonuclease D  32.65 
 
 
382 aa  65.1  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.121397  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>