232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3799 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3799  3'-5' exonuclease  100 
 
 		 209 aa  436  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.954695 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1118  3'-5' exonuclease  77.29 
 
 		 210 aa  340  5.999999999999999e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1147  3'-5' exonuclease  76.81 
 
 		 210 aa  339  1e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.546163 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1621  3'-5' exonuclease  70.05 
 
 		 207 aa  310  9e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.169628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1914  3'-5' exonuclease  67.46 
 
 		 209 aa  300  8.000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.194823 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2509  3'-5' exonuclease  67.46 
 
 		 209 aa  289  2e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2246  3'-5' exonuclease  63.41 
 
 		 217 aa  280  8.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.520239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0678  3'-5' exonuclease  61.46 
 
 		 211 aa  276  2e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0407  3'-5' exonuclease  56.59 
 
 		 214 aa  244  6.999999999999999e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.23143  normal  0.475558 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1922  3'-5' exonuclease  54.9 
 
 		 214 aa  235  4e-61  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0431536  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17051  putative ribonuclease D  54.15 
 
 		 214 aa  235  4e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20321  putative ribonuclease D  55.88 
 
 		 214 aa  232  3e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1157  putative ribonuclease D  55.39 
 
 		 214 aa  231  6e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1676  putative ribonuclease D  52.68 
 
 		 211 aa  222  3e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.137272  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22631  putative ribonuclease D  58.43 
 
 		 212 aa  221  6e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.528712 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0125  putative 3'-5' exonuclease family protein  56 
 
 		 204 aa  216  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00602859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17761  putative ribonuclease D  51.22 
 
 		 211 aa  216  1e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17921  putative ribonuclease D  51.71 
 
 		 211 aa  216  2e-55  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0179  3'-5' exonuclease  53.5 
 
 		 206 aa  214  5.9999999999999996e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00803697  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0419  3'-5' exonuclease  51.69 
 
 		 204 aa  214  9e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0228  3'-5' exonuclease  56.22 
 
 		 203 aa  212  2.9999999999999995e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0047  3'-5' exonuclease  50.24 
 
 		 204 aa  211  5.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0659  3'-5' exonuclease  51.46 
 
 		 204 aa  210  1e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.265112 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0174  3'-5' exonuclease  50.97 
 
 		 204 aa  209  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0327  3'-5' exonuclease  51.74 
 
 		 213 aa  209  2e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17711  putative ribonuclease D  50 
 
 		 213 aa  206  3e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.606229  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0572  3'-5' exonuclease  54.84 
 
 		 204 aa  205  4e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3589  3'-5' exonuclease  52.97 
 
 		 203 aa  198  5e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0196  3'-5' exonuclease  51.6 
 
 		 203 aa  197  7.999999999999999e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.950897 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2343  3'-5' exonuclease  52.22 
 
 		 205 aa  197  9e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.151538 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0171  3'-5' exonuclease  47.34 
 
 		 206 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2425  3'-5' exonuclease  49.21 
 
 		 209 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3984  3'-5' exonuclease  50.99 
 
 		 205 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0529  3'-5' exonuclease family protein  51.02 
 
 		 206 aa  196  2.0000000000000003e-49  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5125  3'-5' exonuclease  49.49 
 
 		 207 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0268839  normal  0.933758 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0120  ribonuclease D  49.5 
 
 		 208 aa  196  2.0000000000000003e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.818192  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2609  3'-5' exonuclease  51.08 
 
 		 204 aa  195  4.0000000000000005e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0816  3'-5' exonuclease  53.48 
 
 		 216 aa  195  5.000000000000001e-49  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00362431  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2497  3'-5' exonuclease  48.69 
 
 		 209 aa  194  7e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.325432  normal  0.308179 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4954  3'-5' exonuclease  49.01 
 
 		 205 aa  194  7e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.332898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0155  3'-5' exonuclease  53.23 
 
 		 204 aa  194  9e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.299764 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1011  3'-5' exonuclease family protein  52.41 
 
 		 204 aa  194  9e-49  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0881939  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3464  3'-5' exonuclease  49.01 
 
 		 208 aa  193  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2720  3'-5' exonuclease  48.69 
 
 		 209 aa  194  1e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.149721  normal  0.0609935 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5275  3'-5' exonuclease  49.23 
 
 		 204 aa  192  3e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.28449  normal  0.0567423 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5922  3'-5' exonuclease  48.72 
 
 		 204 aa  192  4e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2775  3'-5' exonuclease  49.46 
 
 		 204 aa  192  4e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0068  3'-5' exonuclease  48.99 
 
 		 206 aa  191  5e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2813  3'-5' exonuclease  48.92 
 
 		 204 aa  191  9e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1152  ribonuclease D  48.92 
 
 		 204 aa  190  1e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0117  3'-5' exonuclease family protein  50.26 
 
 		 205 aa  189  2.9999999999999997e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4028  3'-5' exonuclease  48.02 
 
 		 208 aa  187  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0333  3'-5' exonuclease  48.5 
 
 		 210 aa  186  2e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.273167  normal  0.287022 
 
 
-
 
NC_002978  WD0878  3'-5' exonuclease  52.69 
 
 		 206 aa  186  2e-46  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0120  3'-5' exonuclease family protein  49.74 
 
 		 205 aa  186  2e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.328382  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0135  3'-5' exonuclease  50.26 
 
 		 205 aa  186  3e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4358  3'-5' exonuclease  47.52 
 
 		 208 aa  183  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583903 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0015  3'-5' exonuclease  50 
 
 		 206 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1669  3'-5' exonuclease  49.47 
 
 		 218 aa  181  5.0000000000000004e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.335885  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1219  3'-5' exonuclease domain-containing protein  49.28 
 
 		 206 aa  181  7e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000485799  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0027  3'-5' exonuclease  45.95 
 
 		 204 aa  181  8.000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.189554  normal  0.37885 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0109  3'-5' exonuclease  48.11 
 
 		 204 aa  180  2e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.378562  normal  0.35649 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3251  3'-5' exonuclease  46.8 
 
 		 205 aa  177  9e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2903  3'-5' exonuclease  47.78 
 
 		 205 aa  177  9e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.865613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1164  3'-5' exonuclease  31.87 
 
 		 550 aa  87.8  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0638405  normal  0.521406 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1310  ribonuclease D  33.53 
 
 		 393 aa  82.8  0.000000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0761558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2365  ribonuclease D  36.02 
 
 		 392 aa  81.3  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1337  ribonuclease D  32.74 
 
 		 405 aa  80.1  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.118451  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3166  DNA-directed DNA polymerase  31.25 
 
 		 582 aa  78.2  0.00000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1249  ribonuclease D  33.96 
 
 		 381 aa  77.8  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.606694  normal  0.0871939 
 
 
-
 
NC_002978  WD0186  ribonuclease D, putative  34.86 
 
 		 392 aa  77.4  0.0000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2949  ribonuclease D  33.33 
 
 		 392 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.967436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1588  ribonuclease D  33.96 
 
 		 384 aa  77.8  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0744  ribonuclease D  31.18 
 
 		 385 aa  77.4  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12160  ribonuclease D  34.34 
 
 		 392 aa  77  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0326  ribonuclease D  33.69 
 
 		 392 aa  76.6  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0491656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1121  ribonuclease D  34.18 
 
 		 392 aa  77  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.441992  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1102  ribonuclease D  32.02 
 
 		 381 aa  76.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.447104 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2402  ribonuclease D  33.93 
 
 		 373 aa  75.9  0.0000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000137804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2124  ribonuclease D  33.93 
 
 		 373 aa  75.9  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0137564  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2013  ribonuclease D  33.93 
 
 		 373 aa  75.9  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000328628  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2334  ribonuclease D  33.33 
 
 		 384 aa  75.9  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.323596 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0971  DNA-directed DNA polymerase  31 
 
 		 583 aa  75.5  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0750  ribonuclease D  31.46 
 
 		 385 aa  75.1  0.0000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0506  ribonuclease D  31.33 
 
 		 395 aa  75.5  0.0000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.967739 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2542  ribonuclease D  31.36 
 
 		 385 aa  75.1  0.0000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1752  ribonuclease D  33.13 
 
 		 395 aa  74.3  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00607213  normal  0.281233 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3324  ribonuclease D  33.95 
 
 		 427 aa  73.9  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.342463  normal  0.392849 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3191  3'-5' exonuclease  31.87 
 
 		 382 aa  73.6  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2016  ribonuclease D  34.12 
 
 		 375 aa  73.2  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00169692  normal  0.221518 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1956  ribonuclease D  34.12 
 
 		 375 aa  73.2  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000740588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4526  ribonuclease D  33.33 
 
 		 394 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.780043  normal  0.636279 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0221  3'-5' exonuclease  31.25 
 
 		 377 aa  72.8  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5131  ribonuclease D  32.26 
 
 		 389 aa  72.8  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0237  3'-5' exonuclease  31.25 
 
 		 377 aa  72.8  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000118749  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1887  putative ribonuclease D  32.34 
 
 		 385 aa  72.4  0.000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0137487  normal  0.150443 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1316  ribonuclease D  33.53 
 
 		 375 aa  72  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000119147  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1959  ribonuclease D  33.53 
 
 		 375 aa  72  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000313579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3636  3'-5' exonuclease  30.3 
 
 		 381 aa  72  0.000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.172491  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2546  ribonuclease D  32.05 
 
 		 389 aa  72  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>