265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2720 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_2720  3'-5' exonuclease  100 
 
 		 209 aa  425  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.149721  normal  0.0609935 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2497  3'-5' exonuclease  98.09 
 
 		 209 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.325432  normal  0.308179 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2425  3'-5' exonuclease  91.83 
 
 		 209 aa  390  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5125  3'-5' exonuclease  80.6 
 
 		 207 aa  335  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0268839  normal  0.933758 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5275  3'-5' exonuclease  73.63 
 
 		 204 aa  312  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.28449  normal  0.0567423 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5922  3'-5' exonuclease  74.63 
 
 		 204 aa  310  1e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0419  3'-5' exonuclease  73.76 
 
 		 204 aa  307  8e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0174  3'-5' exonuclease  73.27 
 
 		 204 aa  301  6.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0659  3'-5' exonuclease  71.78 
 
 		 204 aa  296  2e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.265112 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0179  3'-5' exonuclease  73.04 
 
 		 206 aa  296  2e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00803697  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0572  3'-5' exonuclease  68.81 
 
 		 204 aa  295  3e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0047  3'-5' exonuclease  70.79 
 
 		 204 aa  292  2e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0228  3'-5' exonuclease  64.82 
 
 		 203 aa  288  4e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0155  3'-5' exonuclease  68.66 
 
 		 204 aa  286  1e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.299764 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0125  putative 3'-5' exonuclease family protein  69.8 
 
 		 204 aa  286  1e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00602859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0171  3'-5' exonuclease  70.87 
 
 		 206 aa  283  2.0000000000000002e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0196  3'-5' exonuclease  66.34 
 
 		 203 aa  278  3e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.950897 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2343  3'-5' exonuclease  67.65 
 
 		 205 aa  275  4e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.151538 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0109  3'-5' exonuclease  67.33 
 
 		 204 aa  275  4e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.378562  normal  0.35649 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3589  3'-5' exonuclease  66.33 
 
 		 203 aa  270  9e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0068  3'-5' exonuclease  64.71 
 
 		 206 aa  270  1e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0027  3'-5' exonuclease  62.5 
 
 		 204 aa  269  2e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.189554  normal  0.37885 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0117  3'-5' exonuclease family protein  64.53 
 
 		 205 aa  269  2e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0120  3'-5' exonuclease family protein  64.53 
 
 		 205 aa  269  2.9999999999999997e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.328382  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0135  3'-5' exonuclease  64.53 
 
 		 205 aa  268  4e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4954  3'-5' exonuclease  69.15 
 
 		 205 aa  266  1e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.332898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3464  3'-5' exonuclease  64.22 
 
 		 208 aa  262  3e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0120  ribonuclease D  62.14 
 
 		 208 aa  256  1e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.818192  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2903  3'-5' exonuclease  64.36 
 
 		 205 aa  256  2e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.865613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1219  3'-5' exonuclease domain-containing protein  62.56 
 
 		 206 aa  255  3e-67  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000485799  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2813  3'-5' exonuclease  62.87 
 
 		 204 aa  255  3e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2775  3'-5' exonuclease  62.87 
 
 		 204 aa  254  7e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1152  ribonuclease D  62.38 
 
 		 204 aa  254  8e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2609  3'-5' exonuclease  62.38 
 
 		 204 aa  253  1.0000000000000001e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0333  3'-5' exonuclease  61.17 
 
 		 210 aa  252  3e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.273167  normal  0.287022 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3984  3'-5' exonuclease  62.25 
 
 		 205 aa  252  3e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0015  3'-5' exonuclease  59.62 
 
 		 206 aa  246  1e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4028  3'-5' exonuclease  61.27 
 
 		 208 aa  245  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1669  3'-5' exonuclease  59.72 
 
 		 218 aa  246  3e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.335885  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3251  3'-5' exonuclease  63.55 
 
 		 205 aa  245  3e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4358  3'-5' exonuclease  60.29 
 
 		 208 aa  245  4e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583903 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0529  3'-5' exonuclease family protein  55.67 
 
 		 206 aa  244  4.9999999999999997e-64  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1011  3'-5' exonuclease family protein  54.46 
 
 		 204 aa  236  2e-61  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0881939  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0816  3'-5' exonuclease  53.96 
 
 		 216 aa  234  9e-61  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00362431  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0878  3'-5' exonuclease  52.71 
 
 		 206 aa  223  2e-57  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0327  3'-5' exonuclease  58.92 
 
 		 213 aa  207  9e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3799  3'-5' exonuclease  48.69 
 
 		 209 aa  194  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.954695 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1914  3'-5' exonuclease  51.31 
 
 		 209 aa  192  3e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.194823 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2509  3'-5' exonuclease  50 
 
 		 209 aa  191  5e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0678  3'-5' exonuclease  49.49 
 
 		 211 aa  188  5.999999999999999e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1621  3'-5' exonuclease  46.94 
 
 		 207 aa  187  7e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.169628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1147  3'-5' exonuclease  48.17 
 
 		 210 aa  186  3e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.546163 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1118  3'-5' exonuclease  48.17 
 
 		 210 aa  186  3e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2246  3'-5' exonuclease  48.5 
 
 		 217 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.520239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17711  putative ribonuclease D  41.55 
 
 		 213 aa  179  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.606229  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1676  putative ribonuclease D  42.25 
 
 		 211 aa  178  4.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.137272  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17921  putative ribonuclease D  41.78 
 
 		 211 aa  178  5.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17761  putative ribonuclease D  41.78 
 
 		 211 aa  178  5.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17051  putative ribonuclease D  46.88 
 
 		 214 aa  177  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20321  putative ribonuclease D  45.21 
 
 		 214 aa  167  7e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1157  putative ribonuclease D  44.68 
 
 		 214 aa  167  1e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0407  3'-5' exonuclease  49.71 
 
 		 214 aa  164  8e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.23143  normal  0.475558 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1922  3'-5' exonuclease  47.4 
 
 		 214 aa  159  2e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0431536  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22631  putative ribonuclease D  47.25 
 
 		 212 aa  158  7e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.528712 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1164  3'-5' exonuclease  40 
 
 		 550 aa  107  2e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0638405  normal  0.521406 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1310  ribonuclease D  39.35 
 
 		 393 aa  94  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0761558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2365  ribonuclease D  38.06 
 
 		 392 aa  92.8  3e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2378  ribonuclease D  34.81 
 
 		 388 aa  90.1  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0306951  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1474  ribonuclease D  33.54 
 
 		 385 aa  87.8  9e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.366853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1838  ribonuclease D  35.33 
 
 		 386 aa  85.9  4e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.529278  normal  0.0732716 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1249  ribonuclease D  30.94 
 
 		 381 aa  85.5  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.606694  normal  0.0871939 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1588  ribonuclease D  29.89 
 
 		 384 aa  85.5  5e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0186  ribonuclease D, putative  32.05 
 
 		 392 aa  84.7  8e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1102  ribonuclease D  31.49 
 
 		 381 aa  84.7  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.447104 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0326  ribonuclease D  35.17 
 
 		 392 aa  84.3  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0491656  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0750  ribonuclease D  31.03 
 
 		 385 aa  84.3  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2762  ribonuclease D  36.31 
 
 		 358 aa  84.3  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.713242 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0744  ribonuclease D  31.03 
 
 		 385 aa  84  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1956  ribonuclease D  38.57 
 
 		 375 aa  83.6  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000740588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2016  ribonuclease D  38.57 
 
 		 375 aa  83.6  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00169692  normal  0.221518 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3636  3'-5' exonuclease  32.1 
 
 		 381 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.172491  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1734  ribonuclease D  35.4 
 
 		 381 aa  83.2  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.312389  decreased coverage  0.00186691 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2546  ribonuclease D  33.33 
 
 		 389 aa  83.2  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0323  RNase D  33.53 
 
 		 375 aa  82.8  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.85777e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1316  ribonuclease D  38.57 
 
 		 375 aa  82.8  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000119147  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1959  ribonuclease D  38.57 
 
 		 375 aa  82.8  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000313579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1500  ribonuclease D  38.57 
 
 		 375 aa  82.8  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000854063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2073  ribonuclease D  32.69 
 
 		 386 aa  82.4  0.000000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2542  ribonuclease D  29.31 
 
 		 385 aa  82  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0208  ribonuclease D  34.16 
 
 		 405 aa  82  0.000000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.790947 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0703  3'-5' exonuclease  31.03 
 
 		 386 aa  81.6  0.000000000000007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.807909  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4526  ribonuclease D  32.65 
 
 		 394 aa  81.6  0.000000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.780043  normal  0.636279 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0506  ribonuclease D  32.69 
 
 		 395 aa  81.3  0.000000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.967739 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3455  ribonuclease D  29.61 
 
 		 392 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0111852  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1887  putative ribonuclease D  32.75 
 
 		 385 aa  80.9  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0137487  normal  0.150443 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1582  3'-5' exonuclease  34.13 
 
 		 385 aa  79.7  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5131  ribonuclease D  32.03 
 
 		 389 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2374  ribonuclease D  31.37 
 
 		 384 aa  80.5  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.307592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1337  ribonuclease D  27.98 
 
 		 405 aa  79.3  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.118451  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2334  ribonuclease D  29.73 
 
 		 384 aa  79.3  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.323596 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>