253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1676 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1676  putative ribonuclease D  100 
 
 		 211 aa  429  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.137272  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17921  putative ribonuclease D  92.89 
 
 		 211 aa  402  1e-111  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17761  putative ribonuclease D  91.94 
 
 		 211 aa  400  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17711  putative ribonuclease D  74.29 
 
 		 213 aa  329  2e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.606229  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1157  putative ribonuclease D  57.62 
 
 		 214 aa  253  1.0000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20321  putative ribonuclease D  57.14 
 
 		 214 aa  253  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0407  3'-5' exonuclease  58.08 
 
 		 214 aa  249  2e-65  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.23143  normal  0.475558 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17051  putative ribonuclease D  58.25 
 
 		 214 aa  249  2e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1922  3'-5' exonuclease  56.78 
 
 		 214 aa  249  3e-65  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0431536  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0678  3'-5' exonuclease  56.57 
 
 		 211 aa  244  6.999999999999999e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1621  3'-5' exonuclease  58.08 
 
 		 207 aa  241  7.999999999999999e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.169628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1914  3'-5' exonuclease  55.56 
 
 		 209 aa  234  5.0000000000000005e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.194823 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2509  3'-5' exonuclease  54.63 
 
 		 209 aa  232  2.0000000000000002e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1118  3'-5' exonuclease  54.55 
 
 		 210 aa  230  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1147  3'-5' exonuclease  54.55 
 
 		 210 aa  229  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.546163 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2246  3'-5' exonuclease  55.05 
 
 		 217 aa  224  7e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.520239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3799  3'-5' exonuclease  52.68 
 
 		 209 aa  222  3e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.954695 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22631  putative ribonuclease D  54.05 
 
 		 212 aa  217  8.999999999999998e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.528712 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0419  3'-5' exonuclease  49.24 
 
 		 204 aa  191  5e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3589  3'-5' exonuclease  48.98 
 
 		 203 aa  190  1e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0125  putative 3'-5' exonuclease family protein  49.75 
 
 		 204 aa  189  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00602859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0327  3'-5' exonuclease  49 
 
 		 213 aa  189  2e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0659  3'-5' exonuclease  50.25 
 
 		 204 aa  187  7e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.265112 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0155  3'-5' exonuclease  48.73 
 
 		 204 aa  187  1e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.299764 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0047  3'-5' exonuclease  47.72 
 
 		 204 aa  185  3e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1011  3'-5' exonuclease family protein  50.51 
 
 		 204 aa  185  5e-46  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0881939  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0174  3'-5' exonuclease  48.73 
 
 		 204 aa  184  6e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0529  3'-5' exonuclease family protein  48.76 
 
 		 206 aa  184  1.0000000000000001e-45  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0816  3'-5' exonuclease  51.02 
 
 		 216 aa  182  2.0000000000000003e-45  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00362431  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2425  3'-5' exonuclease  43.66 
 
 		 209 aa  182  3e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0228  3'-5' exonuclease  46.43 
 
 		 203 aa  181  1e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0572  3'-5' exonuclease  49.19 
 
 		 204 aa  180  1e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1152  ribonuclease D  46.19 
 
 		 204 aa  179  2e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2813  3'-5' exonuclease  46.19 
 
 		 204 aa  180  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2343  3'-5' exonuclease  47.17 
 
 		 205 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.151538 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0179  3'-5' exonuclease  50 
 
 		 206 aa  179  4e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00803697  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2720  3'-5' exonuclease  42.25 
 
 		 209 aa  178  4.999999999999999e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.149721  normal  0.0609935 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5922  3'-5' exonuclease  46.35 
 
 		 204 aa  178  5.999999999999999e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2609  3'-5' exonuclease  46.19 
 
 		 204 aa  178  5.999999999999999e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2497  3'-5' exonuclease  41.78 
 
 		 209 aa  177  1e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.325432  normal  0.308179 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3251  3'-5' exonuclease  46.6 
 
 		 205 aa  177  1e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2903  3'-5' exonuclease  45.37 
 
 		 205 aa  176  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.865613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5125  3'-5' exonuclease  47.21 
 
 		 207 aa  176  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0268839  normal  0.933758 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2775  3'-5' exonuclease  45.18 
 
 		 204 aa  176  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0878  3'-5' exonuclease  48.78 
 
 		 206 aa  175  4e-43  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0171  3'-5' exonuclease  45.54 
 
 		 206 aa  174  6e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4954  3'-5' exonuclease  44.56 
 
 		 205 aa  174  7e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.332898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1669  3'-5' exonuclease  46.27 
 
 		 218 aa  174  8e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.335885  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5275  3'-5' exonuclease  44.79 
 
 		 204 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.28449  normal  0.0567423 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0333  3'-5' exonuclease  48.65 
 
 		 210 aa  174  9.999999999999999e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.273167  normal  0.287022 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0120  ribonuclease D  48.11 
 
 		 208 aa  173  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.818192  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0068  3'-5' exonuclease  45.32 
 
 		 206 aa  172  3.9999999999999995e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0135  3'-5' exonuclease  48.15 
 
 		 205 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3984  3'-5' exonuclease  48.11 
 
 		 205 aa  171  5.999999999999999e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0196  3'-5' exonuclease  47.57 
 
 		 203 aa  171  6.999999999999999e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.950897 
 
 
-
 
NC_004310  BR0120  3'-5' exonuclease family protein  47.62 
 
 		 205 aa  170  1e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.328382  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4028  3'-5' exonuclease  46.32 
 
 		 208 aa  170  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0117  3'-5' exonuclease family protein  47.62 
 
 		 205 aa  170  1e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3464  3'-5' exonuclease  46.49 
 
 		 208 aa  168  5e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0109  3'-5' exonuclease  43.78 
 
 		 204 aa  167  1e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.378562  normal  0.35649 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4358  3'-5' exonuclease  45.79 
 
 		 208 aa  165  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583903 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0027  3'-5' exonuclease  44 
 
 		 204 aa  165  5e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.189554  normal  0.37885 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1219  3'-5' exonuclease domain-containing protein  47.62 
 
 		 206 aa  160  1e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000485799  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0015  3'-5' exonuclease  43.43 
 
 		 206 aa  154  7e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3191  3'-5' exonuclease  31.43 
 
 		 382 aa  86.3  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3636  3'-5' exonuclease  33.13 
 
 		 381 aa  85.5  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.172491  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12160  ribonuclease D  35.93 
 
 		 392 aa  83.2  0.000000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1164  3'-5' exonuclease  31.32 
 
 		 550 aa  82.8  0.000000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0638405  normal  0.521406 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0237  3'-5' exonuclease  32.75 
 
 		 377 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000118749  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0221  3'-5' exonuclease  32.75 
 
 		 377 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0414  3'-5' exonuclease  34.12 
 
 		 295 aa  79.3  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3389  3'-5' exonuclease  30.41 
 
 		 382 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0326  ribonuclease D  34.18 
 
 		 392 aa  75.9  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0491656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1337  ribonuclease D  31.36 
 
 		 405 aa  74.7  0.0000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.118451  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2378  ribonuclease D  32.4 
 
 		 388 aa  74.3  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0306951  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0443  ribonuclease D, putative  32.9 
 
 		 381 aa  73.2  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2546  ribonuclease D  29.67 
 
 		 389 aa  73.2  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5131  ribonuclease D  29.81 
 
 		 389 aa  72  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1249  ribonuclease D  33.53 
 
 		 381 aa  72  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.606694  normal  0.0871939 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0042  ribonuclease D  31.14 
 
 		 395 aa  70.9  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00728921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1102  ribonuclease D  31.58 
 
 		 381 aa  70.9  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.447104 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5400  Ribonuclease D  28.73 
 
 		 396 aa  70.1  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1752  ribonuclease D  31.94 
 
 		 395 aa  70.5  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00607213  normal  0.281233 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4287  3'-5' exonuclease  33.57 
 
 		 409 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.276505  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4526  ribonuclease D  31.54 
 
 		 394 aa  69.3  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.780043  normal  0.636279 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2365  ribonuclease D  29.56 
 
 		 392 aa  68.9  0.00000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1310  ribonuclease D  28.22 
 
 		 393 aa  68.9  0.00000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0761558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06230  ribonuclease D  32.28 
 
 		 399 aa  68.6  0.00000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.000000184069  hitchhiker  0.0058155 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0703  3'-5' exonuclease  32.69 
 
 		 386 aa  67  0.0000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.807909  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2762  ribonuclease D  32.89 
 
 		 358 aa  67  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.713242 
 
 
-
 
NC_004310  BR0750  ribonuclease D  31.48 
 
 		 385 aa  66.6  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0323  RNase D  31.9 
 
 		 375 aa  66.6  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.85777e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0509  ribonuclease D  30.59 
 
 		 396 aa  66.2  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0744  ribonuclease D  31.48 
 
 		 385 aa  66.2  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0601  DNA-directed DNA polymerase  30.43 
 
 		 587 aa  65.9  0.0000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2542  ribonuclease D  30.25 
 
 		 385 aa  65.1  0.0000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0506  ribonuclease D  30.49 
 
 		 395 aa  65.1  0.0000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.967739 
 
 
-
 
NC_002978  WD0186  ribonuclease D, putative  28.98 
 
 		 392 aa  64.7  0.000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2211  3'-5' exonuclease  31.21 
 
 		 296 aa  64.3  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.493178  normal  0.0213505 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2111  ribonuclease D  27.5 
 
 		 369 aa  63.5  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000446325  normal  0.381908 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>