276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5922 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5922  3'-5' exonuclease  100 
 
 		 204 aa  413  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5275  3'-5' exonuclease  91.67 
 
 		 204 aa  385  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.28449  normal  0.0567423 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5125  3'-5' exonuclease  78.11 
 
 		 207 aa  325  3e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0268839  normal  0.933758 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2425  3'-5' exonuclease  76.12 
 
 		 209 aa  313  9e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2497  3'-5' exonuclease  74.63 
 
 		 209 aa  310  9e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.325432  normal  0.308179 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2720  3'-5' exonuclease  74.63 
 
 		 209 aa  310  1e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.149721  normal  0.0609935 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0047  3'-5' exonuclease  73.04 
 
 		 204 aa  304  7e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0419  3'-5' exonuclease  72.06 
 
 		 204 aa  301  5.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0174  3'-5' exonuclease  72.06 
 
 		 204 aa  301  6.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0659  3'-5' exonuclease  72.55 
 
 		 204 aa  300  9e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.265112 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0125  putative 3'-5' exonuclease family protein  70.59 
 
 		 204 aa  290  1e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00602859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0179  3'-5' exonuclease  69.9 
 
 		 206 aa  289  2e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00803697  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0572  3'-5' exonuclease  68.14 
 
 		 204 aa  286  1e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0155  3'-5' exonuclease  67.98 
 
 		 204 aa  286  1e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.299764 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0068  3'-5' exonuclease  66.18 
 
 		 206 aa  283  1.0000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0171  3'-5' exonuclease  66.5 
 
 		 206 aa  275  2e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0109  3'-5' exonuclease  67.34 
 
 		 204 aa  270  7e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.378562  normal  0.35649 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0228  3'-5' exonuclease  61.08 
 
 		 203 aa  269  2e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0027  3'-5' exonuclease  63.73 
 
 		 204 aa  269  2e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.189554  normal  0.37885 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3589  3'-5' exonuclease  64.04 
 
 		 203 aa  268  5e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3464  3'-5' exonuclease  65.02 
 
 		 208 aa  267  8e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0196  3'-5' exonuclease  62.07 
 
 		 203 aa  262  2e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.950897 
 
 
-
 
NC_004310  BR0120  3'-5' exonuclease family protein  61.95 
 
 		 205 aa  260  1e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.328382  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4954  3'-5' exonuclease  62.93 
 
 		 205 aa  259  1e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.332898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0117  3'-5' exonuclease family protein  61.95 
 
 		 205 aa  260  1e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0135  3'-5' exonuclease  61.95 
 
 		 205 aa  258  6e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1219  3'-5' exonuclease domain-containing protein  62.87 
 
 		 206 aa  257  9e-68  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000485799  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0333  3'-5' exonuclease  64.82 
 
 		 210 aa  256  2e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.273167  normal  0.287022 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4028  3'-5' exonuclease  63.55 
 
 		 208 aa  254  6e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3984  3'-5' exonuclease  63.41 
 
 		 205 aa  254  7e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0120  ribonuclease D  62.56 
 
 		 208 aa  253  1.0000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.818192  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2343  3'-5' exonuclease  62.93 
 
 		 205 aa  250  8.000000000000001e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.151538 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4358  3'-5' exonuclease  62.07 
 
 		 208 aa  248  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583903 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2609  3'-5' exonuclease  60.29 
 
 		 204 aa  248  4e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1669  3'-5' exonuclease  60.29 
 
 		 218 aa  248  6e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.335885  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1152  ribonuclease D  59.61 
 
 		 204 aa  246  1e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0015  3'-5' exonuclease  61.62 
 
 		 206 aa  245  3e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2813  3'-5' exonuclease  59.11 
 
 		 204 aa  245  4e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2775  3'-5' exonuclease  58.62 
 
 		 204 aa  241  5e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1011  3'-5' exonuclease family protein  56.37 
 
 		 204 aa  241  6e-63  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0881939  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0529  3'-5' exonuclease family protein  56.44 
 
 		 206 aa  241  7e-63  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2903  3'-5' exonuclease  62.93 
 
 		 205 aa  238  2.9999999999999997e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.865613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0816  3'-5' exonuclease  54.9 
 
 		 216 aa  237  6.999999999999999e-62  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00362431  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3251  3'-5' exonuclease  62.5 
 
 		 205 aa  236  1e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0878  3'-5' exonuclease  53.73 
 
 		 206 aa  223  1e-57  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0327  3'-5' exonuclease  56.02 
 
 		 213 aa  213  9.999999999999999e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1914  3'-5' exonuclease  52.13 
 
 		 209 aa  195  5.000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.194823 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1621  3'-5' exonuclease  48.98 
 
 		 207 aa  194  9e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.169628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3799  3'-5' exonuclease  48.72 
 
 		 209 aa  192  4e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.954695 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2246  3'-5' exonuclease  50.77 
 
 		 217 aa  189  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.520239  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2509  3'-5' exonuclease  50 
 
 		 209 aa  188  4e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0678  3'-5' exonuclease  49.74 
 
 		 211 aa  186  2e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1118  3'-5' exonuclease  48 
 
 		 210 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1147  3'-5' exonuclease  48 
 
 		 210 aa  182  3e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.546163 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17761  putative ribonuclease D  46.07 
 
 		 211 aa  180  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17921  putative ribonuclease D  46.07 
 
 		 211 aa  179  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1676  putative ribonuclease D  46.35 
 
 		 211 aa  178  4.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.137272  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0407  3'-5' exonuclease  51.61 
 
 		 214 aa  177  1e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.23143  normal  0.475558 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17711  putative ribonuclease D  43.98 
 
 		 213 aa  175  4e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.606229  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1922  3'-5' exonuclease  49.46 
 
 		 214 aa  172  3.9999999999999995e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0431536  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17051  putative ribonuclease D  42.78 
 
 		 214 aa  164  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20321  putative ribonuclease D  45.2 
 
 		 214 aa  159  2e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1157  putative ribonuclease D  44.63 
 
 		 214 aa  159  4e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22631  putative ribonuclease D  50 
 
 		 212 aa  148  5e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.528712 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1164  3'-5' exonuclease  40 
 
 		 550 aa  93.2  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0638405  normal  0.521406 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2365  ribonuclease D  36.71 
 
 		 392 aa  93.2  3e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2378  ribonuclease D  34.62 
 
 		 388 aa  92  5e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0306951  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1310  ribonuclease D  36.53 
 
 		 393 aa  92  5e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0761558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1582  3'-5' exonuclease  34.13 
 
 		 385 aa  89.7  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2949  ribonuclease D  34.91 
 
 		 392 aa  89.4  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.967436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2546  ribonuclease D  36.11 
 
 		 389 aa  87.4  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2494  ribonuclease D  36.71 
 
 		 382 aa  87.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.121397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0208  ribonuclease D  36.55 
 
 		 405 aa  87.4  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.790947 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2334  ribonuclease D  36.08 
 
 		 384 aa  86.7  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.323596 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3455  ribonuclease D  33.14 
 
 		 392 aa  85.9  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0111852  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0326  ribonuclease D  35.57 
 
 		 392 aa  85.9  4e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0491656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3861  ribonuclease D (RNase D)  34.18 
 
 		 384 aa  85.5  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.623671  normal  0.66998 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0509  ribonuclease D  35.47 
 
 		 396 aa  85.5  5e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1589  ribonuclease D  34.81 
 
 		 382 aa  85.5  5e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1474  ribonuclease D  33.33 
 
 		 385 aa  83.6  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.366853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1838  ribonuclease D  32.64 
 
 		 386 aa  82.8  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.529278  normal  0.0732716 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2112  ribonuclease D  34.81 
 
 		 396 aa  82.8  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1588  ribonuclease D  29.48 
 
 		 384 aa  80.5  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1102  ribonuclease D  30.64 
 
 		 381 aa  80.9  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.447104 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1389  ribonuclease D  34.21 
 
 		 388 aa  79.7  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.465016 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0506  ribonuclease D  32.28 
 
 		 395 aa  79.3  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.967739 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0414  3'-5' exonuclease  34.76 
 
 		 295 aa  78.2  0.00000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5131  ribonuclease D  32.19 
 
 		 389 aa  77.8  0.00000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0971  DNA-directed DNA polymerase  32.64 
 
 		 583 aa  78.2  0.00000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0186  ribonuclease D, putative  31.85 
 
 		 392 aa  77.4  0.0000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0750  ribonuclease D  29.89 
 
 		 385 aa  77.8  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0703  3'-5' exonuclease  31.47 
 
 		 386 aa  77.4  0.0000000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.807909  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0323  RNase D  33.33 
 
 		 375 aa  77.4  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.85777e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0744  ribonuclease D  29.89 
 
 		 385 aa  77.8  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3138  ribonuclease D  33.33 
 
 		 382 aa  77.8  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.340789 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1249  ribonuclease D  29.48 
 
 		 381 aa  77.8  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.606694  normal  0.0871939 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3636  3'-5' exonuclease  29.89 
 
 		 381 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.172491  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4526  ribonuclease D  32.14 
 
 		 394 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.780043  normal  0.636279 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2531  ribonuclease D  36.42 
 
 		 384 aa  77.4  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.159051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1887  putative ribonuclease D  31.85 
 
 		 385 aa  77  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0137487  normal  0.150443 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>