200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0668 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_0668  3'-5' exonuclease  100 
 
 		 302 aa  617  1e-176  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.562548  normal  0.0558608 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2964  3'-5' exonuclease  48.66 
 
 		 308 aa  300  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5140  cell divisionFtsK/SpoIIIE  46.34 
 
 		 648 aa  193  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.76274e-16 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2176  ribonuclease D  29.89 
 
 		 384 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000267525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2253  ribonuclease D  29.89 
 
 		 384 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000377901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2385  ribonuclease D  29.89 
 
 		 388 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000005746  normal  0.331881 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22631  putative ribonuclease D  33.33 
 
 		 212 aa  70.1  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.528712 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2580  ribonuclease D  29.07 
 
 		 367 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1865  ribonuclease D  29.07 
 
 		 369 aa  67  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000800647  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2427  ribonuclease D  29.07 
 
 		 369 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000162598  normal  0.100948 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1899  ribonuclease D  29.07 
 
 		 369 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000359973  normal  0.61142 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1892  ribonuclease D  29.07 
 
 		 369 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000212189  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1762  ribonuclease D  28.9 
 
 		 367 aa  65.5  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000618336  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0186  ribonuclease D, putative  26.77 
 
 		 392 aa  63.2  0.000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3799  3'-5' exonuclease  32.54 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.954695 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2803  ribonuclease D  27.47 
 
 		 400 aa  63.5  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2111  ribonuclease D  26.67 
 
 		 369 aa  62  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000446325  normal  0.381908 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0816  3'-5' exonuclease  29.95 
 
 		 216 aa  61.6  0.00000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00362431  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01380  ribonuclease D  26.92 
 
 		 382 aa  61.6  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1933  ribonuclease D  29.55 
 
 		 371 aa  62  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000115292  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3518  ribonuclease D  28.57 
 
 		 379 aa  61.2  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2522  ribonuclease D  27.37 
 
 		 369 aa  61.6  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000280385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0327  3'-5' exonuclease  28.66 
 
 		 213 aa  61.6  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06230  ribonuclease D  28.25 
 
 		 399 aa  60.8  0.00000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.000000184069  hitchhiker  0.0058155 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3324  ribonuclease D  26.88 
 
 		 427 aa  59.7  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.342463  normal  0.392849 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0407  3'-5' exonuclease  30.25 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.23143  normal  0.475558 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1157  putative ribonuclease D  32.7 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1621  3'-5' exonuclease  28.16 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.169628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20321  putative ribonuclease D  32.7 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1011  3'-5' exonuclease family protein  28.57 
 
 		 204 aa  58.5  0.0000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0881939  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0414  3'-5' exonuclease  31.79 
 
 		 295 aa  58.5  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17051  putative ribonuclease D  30.25 
 
 		 214 aa  58.5  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0120  3'-5' exonuclease family protein  27.27 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.328382  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0171  3'-5' exonuclease  30.95 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004089  ribonuclease D  25.82 
 
 		 388 aa  58.2  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000003136  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0529  3'-5' exonuclease family protein  29.27 
 
 		 206 aa  58.2  0.0000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2542  ribonuclease D  27.81 
 
 		 385 aa  57.8  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1249  ribonuclease D  28.22 
 
 		 381 aa  57.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.606694  normal  0.0871939 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1914  3'-5' exonuclease  29.14 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.194823 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0736  ribonuclease D  29.75 
 
 		 381 aa  57.4  0.0000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0989413  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2609  3'-5' exonuclease  31.87 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0869  ribonuclease D  25.4 
 
 		 391 aa  57.4  0.0000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0942058  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0744  ribonuclease D  27.37 
 
 		 385 aa  57.4  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0125  putative 3'-5' exonuclease family protein  31.01 
 
 		 204 aa  57  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00602859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2016  ribonuclease D  26 
 
 		 375 aa  56.6  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00169692  normal  0.221518 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1337  ribonuclease D  25.79 
 
 		 405 aa  56.6  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.118451  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1588  ribonuclease D  27.16 
 
 		 384 aa  56.6  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17711  putative ribonuclease D  32.72 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.606229  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1956  ribonuclease D  26 
 
 		 375 aa  56.6  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000740588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2187  ribonuclease D  26.77 
 
 		 368 aa  56.6  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000120269  hitchhiker  0.0000305333 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1959  ribonuclease D  26 
 
 		 375 aa  56.2  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000313579  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0750  ribonuclease D  29.52 
 
 		 385 aa  56.2  0.0000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1316  ribonuclease D  26 
 
 		 375 aa  56.2  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000119147  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1500  ribonuclease D  26 
 
 		 375 aa  56.2  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000854063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1102  ribonuclease D  27.16 
 
 		 381 aa  56.2  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.447104 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1569  ribonuclease D  28.57 
 
 		 381 aa  56.2  0.0000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000054851  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0068  3'-5' exonuclease  28.81 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0878  3'-5' exonuclease  32.08 
 
 		 206 aa  55.1  0.000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1615  3'-5' exonuclease  31.82 
 
 		 396 aa  55.1  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.47386  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0639  ribonuclease D  27.27 
 
 		 379 aa  55.5  0.000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.706315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0135  3'-5' exonuclease  27.36 
 
 		 205 aa  55.5  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0572  3'-5' exonuclease  29.41 
 
 		 204 aa  55.5  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0179  3'-5' exonuclease  28.57 
 
 		 206 aa  55.5  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00803697  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2720  3'-5' exonuclease  28.4 
 
 		 209 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.149721  normal  0.0609935 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1219  3'-5' exonuclease domain-containing protein  30.67 
 
 		 206 aa  55.5  0.000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000485799  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5275  3'-5' exonuclease  26.71 
 
 		 204 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.28449  normal  0.0567423 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1669  3'-5' exonuclease  28.92 
 
 		 218 aa  55.1  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.335885  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0333  3'-5' exonuclease  30.2 
 
 		 210 aa  55.5  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.273167  normal  0.287022 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0117  3'-5' exonuclease family protein  28.85 
 
 		 205 aa  55.5  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0208  ribonuclease D  27.38 
 
 		 405 aa  54.7  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.790947 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5400  Ribonuclease D  27.12 
 
 		 396 aa  54.7  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2497  3'-5' exonuclease  28.4 
 
 		 209 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.325432  normal  0.308179 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1922  3'-5' exonuclease  30.32 
 
 		 214 aa  54.7  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0431536  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0678  3'-5' exonuclease  31.36 
 
 		 211 aa  55.1  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5125  3'-5' exonuclease  27.61 
 
 		 207 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0268839  normal  0.933758 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1389  ribonuclease D  22.22 
 
 		 388 aa  54.3  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.465016 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1734  ribonuclease D  26.16 
 
 		 370 aa  54.3  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17761  putative ribonuclease D  30.86 
 
 		 211 aa  54.3  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0799  ribonuclease D  25.9 
 
 		 383 aa  54.3  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.42118  normal  0.945444 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2447  ribonuclease D  28.33 
 
 		 369 aa  53.9  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000149434  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0659  3'-5' exonuclease  30.57 
 
 		 204 aa  54.3  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.265112 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0196  3'-5' exonuclease  30.06 
 
 		 203 aa  54.3  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.950897 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0155  3'-5' exonuclease  31.87 
 
 		 204 aa  53.5  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.299764 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2073  ribonuclease D  23.28 
 
 		 386 aa  53.5  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2378  ribonuclease D  26.16 
 
 		 388 aa  53.1  0.000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0306951  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01138  ribonuclease D  26.56 
 
 		 385 aa  52.8  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000796428  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1384  ribonuclease D  26.06 
 
 		 375 aa  52.8  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0737977  normal  0.865883 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01774  ribonuclease D  26.06 
 
 		 375 aa  52.8  0.000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1839  ribonuclease D  26.06 
 
 		 371 aa  52.8  0.000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0204908  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2530  ribonuclease D  26.06 
 
 		 375 aa  52.8  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00950185  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01762  hypothetical protein  26.06 
 
 		 375 aa  52.8  0.000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2064  ribonuclease D  26.06 
 
 		 375 aa  52.8  0.000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1829  ribonuclease D  26.06 
 
 		 371 aa  52.8  0.000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.299724 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17921  putative ribonuclease D  30.86 
 
 		 211 aa  52.8  0.000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1892  ribonuclease D  26.06 
 
 		 375 aa  52.8  0.000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2030  ribonuclease D  26.06 
 
 		 375 aa  52.8  0.000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.793256  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1118  3'-5' exonuclease  30.3 
 
 		 210 aa  52.8  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0419  3'-5' exonuclease  29.87 
 
 		 204 aa  52.8  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1147  3'-5' exonuclease  30.3 
 
 		 210 aa  52.8  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.546163 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39090  predicted protein  26.22 
 
 		 176 aa  52.4  0.000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.967738  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>