22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_24216 on replicon NC_009357
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009357  OSTLU_24216  predicted protein  100 
 
 		 614 aa  1270    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00000105574  normal  0.257182 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30755  predicted protein  27.65 
 
 		 497 aa  62  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.213052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1912  3'-5' exonuclease  27.65 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.254298  normal  0.272354 
 
 
-
 
NC_002950  PG0365  3'-5' exonuclease domain-containing protein  24.21 
 
 		 188 aa  54.7  0.000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.628059 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2211  3'-5' exonuclease  42.47 
 
 		 296 aa  51.6  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.493178  normal  0.0213505 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_93442  predicted protein  27.48 
 
 		 389 aa  50.4  0.00009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0733722 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2266  3'-5' exonuclease  50 
 
 		 403 aa  47.8  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.859295  normal  0.0322428 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1397  3'-5' exonuclease  26.67 
 
 		 195 aa  46.6  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.937954  normal  0.609265 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0604  3'-5' exonuclease  51.06 
 
 		 925 aa  46.6  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06230  ribonuclease D  26.37 
 
 		 399 aa  46.2  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.000000184069  hitchhiker  0.0058155 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1838  ribonuclease D  42.86 
 
 		 386 aa  44.7  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.529278  normal  0.0732716 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2073  ribonuclease D  50 
 
 		 386 aa  44.7  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1238  3'-5' exonuclease  51.06 
 
 		 925 aa  44.7  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.138795  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2378  ribonuclease D  38.81 
 
 		 388 aa  44.7  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0306951  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1474  ribonuclease D  41.18 
 
 		 385 aa  44.3  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.366853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0883  3'-5' exonuclease  24.73 
 
 		 201 aa  44.7  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0280341 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6723  Ribonuclease D-like protein  51.02 
 
 		 408 aa  44.3  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.449964  normal  0.591917 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0679  ribonuclease D  47.5 
 
 		 385 aa  43.9  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1971  ribonuclease D  47.5 
 
 		 385 aa  43.9  0.009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1338  ribonuclease D  52.5 
 
 		 386 aa  43.9  0.01  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3068  ribonuclease D  47.5 
 
 		 385 aa  43.5  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.439907  normal  0.252562 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2365  ribonuclease D  43.4 
 
 		 392 aa  43.9  0.01  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>