103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_30755 on replicon NC_009357
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009357  OSTLU_30755  predicted protein  100 
 
 		 497 aa  1016    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.213052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_24216  predicted protein  29.21 
 
 		 614 aa  61.6  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00000105574  normal  0.257182 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2211  3'-5' exonuclease  30.39 
 
 		 296 aa  58.9  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.493178  normal  0.0213505 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1959  ribonuclease D  32.77 
 
 		 375 aa  57.4  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000313579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1316  ribonuclease D  32.77 
 
 		 375 aa  57.4  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000119147  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1500  ribonuclease D  32.77 
 
 		 375 aa  57.8  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000854063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1602  3'-5' exonuclease  29.45 
 
 		 294 aa  57  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1384  ribonuclease D  30.6 
 
 		 375 aa  57  0.0000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0737977  normal  0.865883 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1956  ribonuclease D  32.77 
 
 		 375 aa  57  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000740588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2016  ribonuclease D  32.77 
 
 		 375 aa  56.6  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00169692  normal  0.221518 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01774  ribonuclease D  30.6 
 
 		 375 aa  56.6  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1839  ribonuclease D  30.6 
 
 		 371 aa  56.6  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0204908  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1892  ribonuclease D  30.6 
 
 		 375 aa  56.6  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2030  ribonuclease D  30.6 
 
 		 375 aa  56.6  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.793256  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1829  ribonuclease D  30.6 
 
 		 371 aa  56.6  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.299724 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2261  3'-5' exonuclease  29.45 
 
 		 288 aa  56.2  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.726603  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2530  ribonuclease D  30.6 
 
 		 375 aa  56.6  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00950185  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01762  hypothetical protein  30.6 
 
 		 375 aa  56.6  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2064  ribonuclease D  30.05 
 
 		 375 aa  55.5  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2349  3'-5' exonuclease  28.77 
 
 		 288 aa  55.1  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1310  ribonuclease D  27.75 
 
 		 393 aa  53.9  0.000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0761558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3900  ribonuclease D  30.2 
 
 		 377 aa  53.5  0.000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.946881 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2447  ribonuclease D  39.06 
 
 		 369 aa  52.4  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000149434  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4591  ribonuclease D  37.62 
 
 		 377 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01380  ribonuclease D  40.68 
 
 		 382 aa  52  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0047  3'-5' exonuclease  44.07 
 
 		 204 aa  51.6  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0542  DNA-directed DNA polymerase  28.41 
 
 		 585 aa  51.6  0.00003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00481022  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4287  3'-5' exonuclease  27.93 
 
 		 409 aa  51.2  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.276505  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1297  ribonuclease D  38 
 
 		 377 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1397  3'-5' exonuclease  30.86 
 
 		 195 aa  51.2  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.937954  normal  0.609265 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1937  ribonuclease D  25.94 
 
 		 374 aa  51.2  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004089  ribonuclease D  44.44 
 
 		 388 aa  50.4  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000003136  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3617  3'-5' exonuclease  30.72 
 
 		 382 aa  50.4  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4121  ribonuclease D  39.24 
 
 		 377 aa  50.1  0.00008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.636005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0155  3'-5' exonuclease  44.07 
 
 		 204 aa  50.4  0.00008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.299764 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0888  3'-5' exonuclease  25.77 
 
 		 238 aa  50.1  0.00009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.329161  normal  0.376556 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1388  ribonuclease D  29.26 
 
 		 377 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3518  ribonuclease D  27.23 
 
 		 379 aa  48.9  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0179  3'-5' exonuclease  40.68 
 
 		 206 aa  48.9  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00803697  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2374  ribonuclease D  48 
 
 		 384 aa  48.9  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.307592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2522  ribonuclease D  40.35 
 
 		 369 aa  49.3  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000280385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2759  ribonuclease D  48.94 
 
 		 390 aa  48.5  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000108089  hitchhiker  0.00170183 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00420  ribonuclease D  33.33 
 
 		 363 aa  49.3  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.966086  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2232  ribonuclease D  26.2 
 
 		 374 aa  48.9  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.0000142967  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0419  3'-5' exonuclease  48.89 
 
 		 204 aa  48.5  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2111  ribonuclease D  36.92 
 
 		 369 aa  48.5  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000446325  normal  0.381908 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3636  3'-5' exonuclease  26.74 
 
 		 381 aa  48.5  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.172491  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0365  3'-5' exonuclease domain-containing protein  25.88 
 
 		 188 aa  48.1  0.0004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.628059 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2013  ribonuclease D  28.14 
 
 		 373 aa  48.1  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000328628  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2402  ribonuclease D  28.14 
 
 		 373 aa  48.1  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000137804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2124  ribonuclease D  28.14 
 
 		 373 aa  48.1  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0137564  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3922  ribonuclease D  25.87 
 
 		 377 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0659  3'-5' exonuclease  40.68 
 
 		 204 aa  47.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.265112 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0327  3'-5' exonuclease  36.84 
 
 		 213 aa  47.4  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0859  3'-5' exonuclease  29.08 
 
 		 391 aa  47.4  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2388  3'-5' exonuclease  28.07 
 
 		 201 aa  47  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000109184  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0333  3'-5' exonuclease  42.37 
 
 		 210 aa  47  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.273167  normal  0.287022 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68661  ribosomal RNA processing 3'-5' exonuclease  25.58 
 
 		 792 aa  47  0.0008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0460468 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1563  ribonuclease D  27.97 
 
 		 377 aa  47  0.0009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.459041  hitchhiker  0.00529979 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2187  ribonuclease D  35.94 
 
 		 368 aa  47  0.0009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000120269  hitchhiker  0.0000305333 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1064  ribonuclease D (rnase d)  43.4 
 
 		 374 aa  47  0.0009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00409138  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0109  3'-5' exonuclease  38.98 
 
 		 204 aa  46.2  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.378562  normal  0.35649 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1912  3'-5' exonuclease  26.54 
 
 		 202 aa  46.2  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.254298  normal  0.272354 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1528  3'-5' exonuclease  44 
 
 		 451 aa  46.2  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.104904  normal  0.219047 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0125  putative 3'-5' exonuclease family protein  38.71 
 
 		 204 aa  46.6  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00602859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3138  ribonuclease D  28.86 
 
 		 382 aa  46.2  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.340789 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1470  3'-5' exonuclease  40.62 
 
 		 451 aa  46.6  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000176999 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0572  3'-5' exonuclease  40.68 
 
 		 204 aa  46.6  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0601  DNA-directed DNA polymerase  24.31 
 
 		 587 aa  46.6  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05001  exosome complex exonuclease Rrp6, putative (Eurofung)  25.68 
 
 		 1297 aa  45.8  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.333756  normal  0.453331 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05310  hypothetical protein  27.04 
 
 		 912 aa  45.4  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.153123  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0174  3'-5' exonuclease  38.98 
 
 		 204 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47460  ribonuclease D  28.94 
 
 		 374 aa  45.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1569  ribonuclease D  36.84 
 
 		 381 aa  45.4  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000054851  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2088  ribonuclease D  31.49 
 
 		 362 aa  45.8  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.227904  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1349  DNA-directed DNA polymerase  28.49 
 
 		 682 aa  45.4  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.201208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_45013  predicted protein  25.33 
 
 		 655 aa  45.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.326245  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1964  3'-5' exonuclease  30.77 
 
 		 214 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1734  ribonuclease D  25.38 
 
 		 381 aa  46.2  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.312389  decreased coverage  0.00186691 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0171  3'-5' exonuclease  43.14 
 
 		 206 aa  45.4  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1890  ribonuclease D  28.29 
 
 		 401 aa  45.1  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.239057  normal  0.792489 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1933  ribonuclease D  43.75 
 
 		 371 aa  45.1  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000115292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4097  ribonuclease D  31.54 
 
 		 393 aa  45.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0068  3'-5' exonuclease  38.98 
 
 		 206 aa  45.1  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2720  3'-5' exonuclease  30.09 
 
 		 209 aa  45.1  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.149721  normal  0.0609935 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2009  ribonuclease D  48.94 
 
 		 403 aa  45.1  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1337  ribonuclease D  39.62 
 
 		 405 aa  44.7  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.118451  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0976  3'-5' exonuclease  27.98 
 
 		 299 aa  44.7  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0707907 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1391  3'-5' exonuclease  33.75 
 
 		 416 aa  44.7  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2929  3'-5' exonuclease  25.69 
 
 		 298 aa  44.7  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00209751  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2546  ribonuclease D  41.86 
 
 		 389 aa  44.7  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4954  3'-5' exonuclease  37.1 
 
 		 205 aa  44.7  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.332898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2246  3'-5' exonuclease  33.61 
 
 		 217 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.520239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5125  3'-5' exonuclease  33.33 
 
 		 207 aa  44.3  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0268839  normal  0.933758 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0228  3'-5' exonuclease  40.68 
 
 		 203 aa  43.9  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0604  3'-5' exonuclease  42.86 
 
 		 925 aa  43.9  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0668  3'-5' exonuclease  24.65 
 
 		 302 aa  43.5  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.562548  normal  0.0558608 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1238  3'-5' exonuclease  42.86 
 
 		 925 aa  43.5  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.138795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0027  3'-5' exonuclease  46.67 
 
 		 204 aa  43.5  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.189554  normal  0.37885 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2009  ribonuclease D  31.49 
 
 		 362 aa  43.5  0.009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.815664  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>