27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2827 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2827  3'-5' exonuclease  100 
 
 		 198 aa  407  1e-113  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0393048  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2621  3'-5' exonuclease  63.64 
 
 		 198 aa  256  2e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2737  3'-5' exonuclease  62.24 
 
 		 198 aa  254  8e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.196603 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1697  3'-5' exonuclease  55.85 
 
 		 203 aa  196  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4830  3'-5' exonuclease  50 
 
 		 294 aa  162  4.0000000000000004e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0991293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2470  3'-5' exonuclease  44.21 
 
 		 217 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.774502  normal  0.494629 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1397  3'-5' exonuclease  39.15 
 
 		 195 aa  132  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.937954  normal  0.609265 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2929  3'-5' exonuclease  33.67 
 
 		 298 aa  91.3  9e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00209751  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1153  exonuclease, putative  39.04 
 
 		 261 aa  89.4  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3433  3'-5' exonuclease  33.33 
 
 		 292 aa  89.4  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.271229  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0365  3'-5' exonuclease domain-containing protein  33.14 
 
 		 188 aa  88.2  7e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.628059 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1014  3'-5' exonuclease  37.85 
 
 		 303 aa  87.4  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0976  3'-5' exonuclease  37.85 
 
 		 299 aa  87  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0707907 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1912  3'-5' exonuclease  33.85 
 
 		 202 aa  84.3  9e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.254298  normal  0.272354 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1964  3'-5' exonuclease  33.15 
 
 		 214 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1066  3'-5' exonuclease  36.42 
 
 		 320 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0869717  normal  0.0179577 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0888  3'-5' exonuclease  32.8 
 
 		 238 aa  75.9  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.329161  normal  0.376556 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3512  3'-5' exonuclease  36.42 
 
 		 315 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.643646  normal  0.0140367 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3291  3'-5' exonuclease  36.42 
 
 		 315 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000349721  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0883  3'-5' exonuclease  31.25 
 
 		 201 aa  75.9  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0280341 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3387  3'-5' exonuclease  36.42 
 
 		 315 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.395277  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0980  3'-5' exonuclease  39.24 
 
 		 303 aa  75.1  0.0000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2388  3'-5' exonuclease  30.73 
 
 		 201 aa  73.9  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000109184  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46734  predicted protein  29.94 
 
 		 894 aa  55.1  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27893  predicted protein  26.09 
 
 		 389 aa  45.8  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.70309 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_93442  predicted protein  26.13 
 
 		 389 aa  44.7  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0733722 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2903  3'-5' exonuclease  32.85 
 
 		 205 aa  41.2  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.865613  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>