110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_3512 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_3512  3'-5' exonuclease  100 
 
 		 315 aa  645    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.643646  normal  0.0140367 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3291  3'-5' exonuclease  96.51 
 
 		 315 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000349721  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3387  3'-5' exonuclease  97.14 
 
 		 315 aa  565  1e-160  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.395277  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1066  3'-5' exonuclease  93.75 
 
 		 320 aa  544  1e-154  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0869717  normal  0.0179577 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2929  3'-5' exonuclease  59.29 
 
 		 298 aa  359  4e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00209751  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1014  3'-5' exonuclease  53.56 
 
 		 303 aa  328  5.0000000000000004e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0976  3'-5' exonuclease  53.92 
 
 		 299 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0707907 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0980  3'-5' exonuclease  52.94 
 
 		 303 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1153  exonuclease, putative  54.26 
 
 		 261 aa  289  5.0000000000000004e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3433  3'-5' exonuclease  38.76 
 
 		 292 aa  188  1e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.271229  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0365  3'-5' exonuclease domain-containing protein  34.66 
 
 		 188 aa  97.4  2e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.628059 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2737  3'-5' exonuclease  34.27 
 
 		 198 aa  94.4  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.196603 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0883  3'-5' exonuclease  42.57 
 
 		 201 aa  94  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0280341 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2621  3'-5' exonuclease  32.45 
 
 		 198 aa  92.8  6e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1397  3'-5' exonuclease  36.21 
 
 		 195 aa  90.1  4e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.937954  normal  0.609265 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2470  3'-5' exonuclease  34.52 
 
 		 217 aa  89  9e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.774502  normal  0.494629 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1912  3'-5' exonuclease  40 
 
 		 202 aa  87  4e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.254298  normal  0.272354 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2388  3'-5' exonuclease  38.16 
 
 		 201 aa  86.7  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000109184  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2827  3'-5' exonuclease  36.25 
 
 		 198 aa  86.7  5e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0393048  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1964  3'-5' exonuclease  33.51 
 
 		 214 aa  84  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4830  3'-5' exonuclease  35.68 
 
 		 294 aa  83.6  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0991293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0888  3'-5' exonuclease  33.33 
 
 		 238 aa  80.1  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.329161  normal  0.376556 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1697  3'-5' exonuclease  32.45 
 
 		 203 aa  77.8  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46734  predicted protein  34.71 
 
 		 894 aa  73.2  0.000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27893  predicted protein  30.72 
 
 		 389 aa  71.2  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.70309 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1310  ribonuclease D  31.52 
 
 		 393 aa  65.1  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0761558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_93442  predicted protein  28.65 
 
 		 389 aa  62.4  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0733722 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1773  ribonuclease D  31.03 
 
 		 377 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.148789  normal  0.31629 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1589  ribonuclease D  27.91 
 
 		 382 aa  58.9  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3861  ribonuclease D (RNase D)  28.07 
 
 		 384 aa  57.4  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.623671  normal  0.66998 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1338  ribonuclease D  29.21 
 
 		 386 aa  56.6  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2949  ribonuclease D  28.4 
 
 		 392 aa  56.6  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.967436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12160  ribonuclease D  27.65 
 
 		 392 aa  56.6  0.0000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1563  ribonuclease D  30.86 
 
 		 377 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.459041  hitchhiker  0.00529979 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3922  ribonuclease D  31.48 
 
 		 377 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0326  ribonuclease D  33.08 
 
 		 392 aa  55.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0491656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2365  ribonuclease D  29.45 
 
 		 392 aa  55.5  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2494  ribonuclease D  28.3 
 
 		 382 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.121397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2112  ribonuclease D  28.74 
 
 		 396 aa  54.3  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0042  ribonuclease D  28.18 
 
 		 395 aa  54.3  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00728921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1297  ribonuclease D  31.08 
 
 		 377 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4121  ribonuclease D  32.33 
 
 		 377 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.636005  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32970  ribonuclease D protein  31.46 
 
 		 375 aa  54.3  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.789666  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4591  ribonuclease D  31.08 
 
 		 377 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3191  3'-5' exonuclease  28.41 
 
 		 382 aa  53.9  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3900  ribonuclease D  31.08 
 
 		 377 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.946881 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2211  3'-5' exonuclease  31.21 
 
 		 296 aa  52.8  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.493178  normal  0.0213505 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1388  ribonuclease D  32.1 
 
 		 377 aa  52.4  0.000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4526  ribonuclease D  27.75 
 
 		 394 aa  52.4  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.780043  normal  0.636279 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2803  ribonuclease D  28.99 
 
 		 400 aa  52.4  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0414  3'-5' exonuclease  28.12 
 
 		 295 aa  52  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06230  ribonuclease D  25.27 
 
 		 399 aa  52.4  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.000000184069  hitchhiker  0.0058155 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1064  ribonuclease D (rnase d)  29.78 
 
 		 374 aa  52  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00409138  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5131  ribonuclease D  29.7 
 
 		 389 aa  52  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1121  ribonuclease D  27.71 
 
 		 392 aa  51.2  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.441992  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2176  ribonuclease D  27.57 
 
 		 384 aa  51.2  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000267525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2253  ribonuclease D  27.57 
 
 		 384 aa  51.2  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000377901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47460  ribonuclease D  30.19 
 
 		 374 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2385  ribonuclease D  27.57 
 
 		 388 aa  51.6  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000005746  normal  0.331881 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1569  ribonuclease D  30.13 
 
 		 381 aa  51.2  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000054851  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3455  ribonuclease D  29.19 
 
 		 392 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0111852  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2580  ribonuclease D  28.32 
 
 		 367 aa  50.8  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1734  ribonuclease D  29.27 
 
 		 381 aa  51.2  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.312389  decreased coverage  0.00186691 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2334  ribonuclease D  26.99 
 
 		 384 aa  50.4  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.323596 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4287  3'-5' exonuclease  26.55 
 
 		 409 aa  50.1  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.276505  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2762  ribonuclease D  32.05 
 
 		 358 aa  49.7  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.713242 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30755  predicted protein  26.74 
 
 		 497 aa  49.7  0.00007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.213052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1892  ribonuclease D  27.42 
 
 		 369 aa  49.7  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000212189  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1899  ribonuclease D  27.42 
 
 		 369 aa  49.7  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000359973  normal  0.61142 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2427  ribonuclease D  27.42 
 
 		 369 aa  49.7  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000162598  normal  0.100948 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5400  Ribonuclease D  31.01 
 
 		 396 aa  49.3  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0443  ribonuclease D, putative  25.95 
 
 		 381 aa  48.9  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0221  3'-5' exonuclease  27.44 
 
 		 377 aa  48.5  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1865  ribonuclease D  27.42 
 
 		 369 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000800647  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2378  ribonuclease D  27.49 
 
 		 388 aa  47.8  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0306951  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3389  3'-5' exonuclease  27.1 
 
 		 382 aa  48.5  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1582  3'-5' exonuclease  27.91 
 
 		 385 aa  48.5  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4097  ribonuclease D  29.56 
 
 		 393 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2088  ribonuclease D  30.92 
 
 		 362 aa  48.1  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.227904  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2009  ribonuclease D  30.92 
 
 		 362 aa  48.1  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.815664  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2542  ribonuclease D  30.51 
 
 		 385 aa  47.4  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004089  ribonuclease D  29.1 
 
 		 388 aa  47.4  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000003136  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01380  ribonuclease D  26.06 
 
 		 382 aa  47  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0506  ribonuclease D  26.83 
 
 		 395 aa  47  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.967739 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0237  3'-5' exonuclease  26.83 
 
 		 377 aa  47  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000118749  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0750  ribonuclease D  29.66 
 
 		 385 aa  47  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0744  ribonuclease D  29.66 
 
 		 385 aa  46.6  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49621  predicted protein  25 
 
 		 311 aa  47  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2546  ribonuclease D  28.57 
 
 		 389 aa  46.6  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3138  ribonuclease D  27.44 
 
 		 382 aa  45.8  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.340789 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2073  ribonuclease D  28.97 
 
 		 386 aa  44.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0672  Ribonuclease D  27.1 
 
 		 423 aa  44.7  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2232  ribonuclease D  28.4 
 
 		 374 aa  44.7  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.0000142967  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3589  3'-5' exonuclease  27.45 
 
 		 203 aa  44.3  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1252  ribonuclease D  32.39 
 
 		 386 aa  43.9  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000481962 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2609  3'-5' exonuclease  29.53 
 
 		 204 aa  44.3  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2531  ribonuclease D  27.27 
 
 		 384 aa  43.9  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.159051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5125  3'-5' exonuclease  31.01 
 
 		 207 aa  43.9  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0268839  normal  0.933758 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0509  ribonuclease D  30.51 
 
 		 396 aa  43.5  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1676  putative ribonuclease D  36.08 
 
 		 211 aa  43.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.137272  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>