32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_27893 on replicon NC_009369
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009369  OSTLU_27893  predicted protein  100 
 
 		 389 aa  794    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.70309 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0888  3'-5' exonuclease  34.36 
 
 		 238 aa  84  0.000000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.329161  normal  0.376556 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0883  3'-5' exonuclease  34.67 
 
 		 201 aa  79  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0280341 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1964  3'-5' exonuclease  34.51 
 
 		 214 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1912  3'-5' exonuclease  34.67 
 
 		 202 aa  76.6  0.0000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.254298  normal  0.272354 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2388  3'-5' exonuclease  28.85 
 
 		 201 aa  67.8  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000109184  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46734  predicted protein  32.91 
 
 		 894 aa  67  0.0000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3291  3'-5' exonuclease  30.94 
 
 		 315 aa  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000349721  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3512  3'-5' exonuclease  31.11 
 
 		 315 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.643646  normal  0.0140367 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3387  3'-5' exonuclease  31.11 
 
 		 315 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.395277  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2929  3'-5' exonuclease  32.39 
 
 		 298 aa  64.3  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00209751  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1066  3'-5' exonuclease  30.22 
 
 		 320 aa  63.9  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0869717  normal  0.0179577 
 
 
-
 
NC_002950  PG0365  3'-5' exonuclease domain-containing protein  29.88 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.628059 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2470  3'-5' exonuclease  33.77 
 
 		 217 aa  60.8  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.774502  normal  0.494629 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2737  3'-5' exonuclease  29.33 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.196603 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1014  3'-5' exonuclease  31.69 
 
 		 303 aa  58.9  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2621  3'-5' exonuclease  28.67 
 
 		 198 aa  58.9  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0976  3'-5' exonuclease  32.24 
 
 		 299 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0707907 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1153  exonuclease, putative  31.69 
 
 		 261 aa  57.4  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3636  3'-5' exonuclease  29.84 
 
 		 381 aa  57.4  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.172491  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0980  3'-5' exonuclease  30.66 
 
 		 303 aa  53.9  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0221  3'-5' exonuclease  32.26 
 
 		 377 aa  53.1  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0237  3'-5' exonuclease  32.26 
 
 		 377 aa  53.1  0.000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000118749  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0443  ribonuclease D, putative  30.11 
 
 		 381 aa  51.2  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3433  3'-5' exonuclease  30 
 
 		 292 aa  51.2  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.271229  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3389  3'-5' exonuclease  31.18 
 
 		 382 aa  50.4  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1697  3'-5' exonuclease  27.63 
 
 		 203 aa  49.7  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4287  3'-5' exonuclease  32.26 
 
 		 409 aa  49.3  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.276505  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2827  3'-5' exonuclease  26.09 
 
 		 198 aa  45.4  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0393048  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0323  RNase D  32.88 
 
 		 375 aa  44.3  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.85777e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1615  3'-5' exonuclease  29.07 
 
 		 396 aa  43.9  0.005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.47386  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3191  3'-5' exonuclease  25 
 
 		 382 aa  43.5  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>