54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_13915 on replicon NC_009355
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009355  OSTLU_13915  predicted protein  100 
 
 
330 aa  682    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0963407  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03035  5'-3' exonuclease and flap-endonuclease (Eurofung)  41.99 
 
 
761 aa  248  1e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.799677 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33450  5'-3' exonuclease  34.56 
 
 
676 aa  206  5e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.167856 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_5620  predicted protein  36.69 
 
 
333 aa  172  1e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.469951  normal  0.0101798 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00080  exonuclease, putative  32.32 
 
 
1012 aa  139  8.999999999999999e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.008122  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42373  predicted protein  29.37 
 
 
389 aa  112  7.000000000000001e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.159065  normal 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48206  predicted protein  28.09 
 
 
794 aa  96.7  5e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.32747  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48638  predicted protein  27.31 
 
 
421 aa  92.8  8e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02764  5' to 3' exonuclease, 5' flap endonuclease (Eurofung)  26.83 
 
 
395 aa  91.3  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2117  flap endonuclease-1  25.93 
 
 
346 aa  91.7  2e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46734  predicted protein  27.08 
 
 
894 aa  85.1  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01190  flap endonuclease, putative  26.34 
 
 
453 aa  84.7  0.000000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33791  predicted protein  25.21 
 
 
381 aa  84.3  0.000000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.561665  normal  0.280438 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0490  flap structure-specific endonuclease  24.1 
 
 
339 aa  82  0.00000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0040  flap endonuclease-1  25.69 
 
 
350 aa  80.1  0.00000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1913  flap endonuclease-1  24.4 
 
 
338 aa  79.7  0.00000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2348  flap endonuclease-1  25.09 
 
 
346 aa  78.6  0.0000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0196172 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0681  flap endonuclease-1  24.44 
 
 
346 aa  78.2  0.0000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.387412 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1158  flap structure-specific endonuclease  25.62 
 
 
351 aa  78.2  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.146438  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0302  flap endonuclease-1  23.03 
 
 
346 aa  77  0.0000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0356  flap endonuclease-1  23.99 
 
 
333 aa  74.7  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1985  flap endonuclease-1  25.35 
 
 
349 aa  73.9  0.000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0057  flap endonuclease-1  25.71 
 
 
333 aa  70.5  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0212  flap endonuclease-1  27.54 
 
 
300 aa  70.5  0.00000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.022826  decreased coverage  0.0048464 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0426  flap endonuclease-1  27.13 
 
 
341 aa  69.7  0.00000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0280  flap endonuclease-1  28.33 
 
 
324 aa  68.9  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.969351  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2521  flap endonuclease-1  22.67 
 
 
333 aa  67.8  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.239531  normal  0.701303 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1360  flap endonuclease-1  28.32 
 
 
324 aa  67  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.880498  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35911  predicted protein  33.33 
 
 
992 aa  66.2  0.0000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.3407  normal  0.878994 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0558  flap endonuclease-1  27.75 
 
 
324 aa  65.9  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1926  flap endonuclease-1  26.13 
 
 
333 aa  65.1  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2512  flap endonuclease-1  26.2 
 
 
326 aa  65.1  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0703  flap endonuclease-1  23.69 
 
 
340 aa  64.3  0.000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2779  flap endonuclease-1  26.38 
 
 
326 aa  63.5  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1492  flap endonuclease-1  24.58 
 
 
326 aa  63.5  0.000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.36701  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_3874  predicted protein  32.77 
 
 
271 aa  63.5  0.000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.301307  normal  0.764914 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2106  flap endonuclease-1  25.51 
 
 
333 aa  63.5  0.000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0623  flap endonuclease-1  26.26 
 
 
324 aa  62.8  0.000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1613  flap endonuclease-1  25.9 
 
 
325 aa  62.4  0.000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.817409  normal  0.647176 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1212  flap endonuclease-1  23.32 
 
 
338 aa  62  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119559  Exodeoxyribonuclease I  25.13 
 
 
701 aa  60.8  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1081  flap structure-specific endonuclease  24.03 
 
 
325 aa  57.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1634  flap endonuclease-1  26.32 
 
 
336 aa  57.4  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3231  flap structure-specific endonuclease  24.3 
 
 
325 aa  57.8  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.151547  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02340  viral life cycle-related protein, putative  24.89 
 
 
768 aa  50.1  0.00005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1220  ribonuclease H  28.87 
 
 
484 aa  49.7  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05216  single-stranded DNA endonuclease (Eurofung)  29.85 
 
 
1141 aa  49.3  0.00008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03100  single-stranded DNA specific endodeoxyribonuclease, putative  30.09 
 
 
1323 aa  47.4  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00076  posttranscriptional regulation nuclease (Mkt1), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G12250)  24.75 
 
 
724 aa  45.4  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_46971  predicted protein  23.51 
 
 
696 aa  44.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33639  predicted protein  24.15 
 
 
894 aa  44.7  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.224011  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0765  DNA polymerase I  25.6 
 
 
930 aa  44.3  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0949  ribonuclease H  30.08 
 
 
482 aa  43.5  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2864  DNA polymerase I  28.87 
 
 
480 aa  43.5  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>