73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2512 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_2512  flap endonuclease-1  100 
 
 
326 aa  650    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3231  flap structure-specific endonuclease  71.78 
 
 
325 aa  478  1e-134  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.151547  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1081  flap structure-specific endonuclease  70.55 
 
 
325 aa  471  1.0000000000000001e-131  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2779  flap endonuclease-1  72.62 
 
 
326 aa  466  9.999999999999999e-131  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1613  flap endonuclease-1  69.33 
 
 
325 aa  449  1e-125  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.817409  normal  0.647176 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1913  flap endonuclease-1  33.24 
 
 
338 aa  204  2e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1634  flap endonuclease-1  36.8 
 
 
336 aa  199  7e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1212  flap endonuclease-1  33.82 
 
 
338 aa  193  4e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1926  flap endonuclease-1  35.57 
 
 
333 aa  189  4e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2106  flap endonuclease-1  35.5 
 
 
333 aa  181  1e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2117  flap endonuclease-1  35.76 
 
 
346 aa  181  2e-44  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2521  flap endonuclease-1  33.92 
 
 
333 aa  179  4e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.239531  normal  0.701303 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1360  flap endonuclease-1  31.79 
 
 
324 aa  177  2e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.880498  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1158  flap structure-specific endonuclease  31.16 
 
 
351 aa  177  2e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.146438  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0356  flap endonuclease-1  34.91 
 
 
333 aa  177  3e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0280  flap endonuclease-1  31.56 
 
 
324 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.969351  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0490  flap structure-specific endonuclease  30.52 
 
 
339 aa  173  2.9999999999999996e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0426  flap endonuclease-1  31.64 
 
 
341 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0057  flap endonuclease-1  32.71 
 
 
333 aa  172  5e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0302  flap endonuclease-1  32.66 
 
 
346 aa  172  9e-42  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0681  flap endonuclease-1  34.48 
 
 
346 aa  170  2e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.387412 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0558  flap endonuclease-1  30.94 
 
 
324 aa  170  3e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2348  flap endonuclease-1  35.31 
 
 
346 aa  169  8e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0196172 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1492  flap endonuclease-1  29.81 
 
 
326 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.36701  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1985  flap endonuclease-1  33.95 
 
 
349 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0212  flap endonuclease-1  35.14 
 
 
300 aa  160  2e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.022826  decreased coverage  0.0048464 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0040  flap endonuclease-1  31.79 
 
 
350 aa  158  1e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0623  flap endonuclease-1  28.7 
 
 
324 aa  156  6e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48638  predicted protein  34.78 
 
 
421 aa  153  2.9999999999999998e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0703  flap endonuclease-1  29.47 
 
 
340 aa  152  5.9999999999999996e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33791  predicted protein  27.96 
 
 
381 aa  152  5.9999999999999996e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.561665  normal  0.280438 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42373  predicted protein  35.27 
 
 
389 aa  144  3e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.159065  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND01190  flap endonuclease, putative  32.66 
 
 
453 aa  132  6e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02764  5' to 3' exonuclease, 5' flap endonuclease (Eurofung)  29.84 
 
 
395 aa  131  1.0000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33450  5'-3' exonuclease  25.32 
 
 
676 aa  79.7  0.00000000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.167856 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13915  predicted protein  26.2 
 
 
330 aa  65.1  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0963407  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_5620  predicted protein  29.72 
 
 
333 aa  64.3  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.469951  normal  0.0101798 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05216  single-stranded DNA endonuclease (Eurofung)  31.4 
 
 
1141 aa  63.5  0.000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03035  5'-3' exonuclease and flap-endonuclease (Eurofung)  26.74 
 
 
761 aa  63.5  0.000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.799677 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35911  predicted protein  29.84 
 
 
992 aa  62.8  0.000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.3407  normal  0.878994 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_3874  predicted protein  35.85 
 
 
271 aa  62  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.301307  normal  0.764914 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03100  single-stranded DNA specific endodeoxyribonuclease, putative  26.07 
 
 
1323 aa  57.8  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC07150  5' flap endonuclease, putative  35.4 
 
 
643 aa  57.4  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38848  predicted protein  34.74 
 
 
552 aa  56.6  0.0000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1494  5'-3' exonuclease  21.29 
 
 
299 aa  49.3  0.00009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.32691  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13041  DNA polymerase I  28.85 
 
 
976 aa  48.5  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_46971  predicted protein  32.09 
 
 
696 aa  48.1  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13151  DNA polymerase I  28.85 
 
 
976 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33639  predicted protein  26.4 
 
 
894 aa  47  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.224011  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1841  DNA polymerase I  49.12 
 
 
885 aa  47  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46734  predicted protein  27.57 
 
 
894 aa  46.6  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1236  DNA polymerase I  27.88 
 
 
976 aa  46.6  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.206272  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08230  DNA polymerase I  24.39 
 
 
885 aa  46.2  0.0007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.919287 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13291  DNA polymerase I  27.88 
 
 
976 aa  46.2  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03186  Rad2-like endonuclease, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G13260)  25.15 
 
 
822 aa  45.8  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.861457 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2058  5'-3' exonuclease  29.69 
 
 
292 aa  44.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.762247  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3272  DNA polymerase I  26.61 
 
 
877 aa  43.9  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0345464  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2421  DNA polymerase I  28.29 
 
 
904 aa  44.3  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0819967  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0850  DNA polymerase I  28.87 
 
 
982 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0300789 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2250  DNA polymerase I  34.07 
 
 
866 aa  43.9  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.177355  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4697  DNA polymerase I  25.4 
 
 
877 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0439377  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4328  DNA polymerase I  25.81 
 
 
891 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4317  DNA polymerase I  25.81 
 
 
891 aa  43.9  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4482  DNA polymerase I  25.81 
 
 
891 aa  43.9  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0087  DNA polymerase I  26.86 
 
 
903 aa  43.5  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1962  DNA polymerase I  34.07 
 
 
866 aa  43.5  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0886  DNA polymerase I  23.71 
 
 
894 aa  43.1  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4712  DNA polymerase I  25.4 
 
 
877 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.14352  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4718  DNA polymerase I  25.4 
 
 
877 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4702  DNA polymerase I  25.4 
 
 
877 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7101300000000004e-28 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4831  DNA polymerase I  25.4 
 
 
877 aa  43.1  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.318585  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2468  DNA polymerase I  26.11 
 
 
873 aa  42.7  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.095823  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0136  DNA polymerase I  29.7 
 
 
982 aa  42.7  0.008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.3801  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>