31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_119559 on replicon NC_009356
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009356  OSTLU_119559  Exodeoxyribonuclease I  100 
 
 
701 aa  1456    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03035  5'-3' exonuclease and flap-endonuclease (Eurofung)  27.66 
 
 
761 aa  76.6  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.799677 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33450  5'-3' exonuclease  27.86 
 
 
676 aa  75.9  0.000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.167856 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13915  predicted protein  25.13 
 
 
330 aa  60.8  0.00000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0963407  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1913  flap endonuclease-1  25.38 
 
 
338 aa  59.7  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02764  5' to 3' exonuclease, 5' flap endonuclease (Eurofung)  26.19 
 
 
395 aa  55.5  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0040  flap endonuclease-1  26.44 
 
 
350 aa  55.1  0.000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_5620  predicted protein  25.36 
 
 
333 aa  54.7  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.469951  normal  0.0101798 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35911  predicted protein  29.01 
 
 
992 aa  53.9  0.000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.3407  normal  0.878994 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1492  flap endonuclease-1  22.52 
 
 
326 aa  53.1  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.36701  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2348  flap endonuclease-1  25.85 
 
 
346 aa  51.6  0.00005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0196172 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1634  flap endonuclease-1  26.21 
 
 
336 aa  51.2  0.00006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05216  single-stranded DNA endonuclease (Eurofung)  30 
 
 
1141 aa  51.2  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2117  flap endonuclease-1  24.88 
 
 
346 aa  50.1  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0356  flap endonuclease-1  22.27 
 
 
333 aa  50.4  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1613  flap endonuclease-1  23.85 
 
 
325 aa  49.3  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.817409  normal  0.647176 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0057  flap endonuclease-1  26.32 
 
 
333 aa  48.9  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48638  predicted protein  24.9 
 
 
421 aa  48.9  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1985  flap endonuclease-1  25 
 
 
349 aa  48.5  0.0004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03186  Rad2-like endonuclease, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G13260)  24.27 
 
 
822 aa  48.5  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.861457 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0681  flap endonuclease-1  22.93 
 
 
346 aa  47.8  0.0008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.387412 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1158  flap structure-specific endonuclease  23.74 
 
 
351 aa  47.8  0.0008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.146438  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0302  flap endonuclease-1  24.24 
 
 
346 aa  46.6  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46734  predicted protein  27.82 
 
 
894 aa  47  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_3874  predicted protein  27.35 
 
 
271 aa  45.8  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.301307  normal  0.764914 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0558  flap endonuclease-1  20.99 
 
 
324 aa  45.8  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2106  flap endonuclease-1  23.33 
 
 
333 aa  45.8  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0623  flap endonuclease-1  20.99 
 
 
324 aa  44.7  0.005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2521  flap endonuclease-1  22.93 
 
 
333 aa  44.7  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.239531  normal  0.701303 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0490  flap structure-specific endonuclease  24.15 
 
 
339 aa  44.3  0.008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0280  flap endonuclease-1  20.61 
 
 
324 aa  43.9  0.01  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.969351  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>