53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0681 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_0681  flap endonuclease-1  100 
 
 
346 aa  702    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.387412 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2117  flap endonuclease-1  82.66 
 
 
346 aa  613  9.999999999999999e-175  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2348  flap endonuclease-1  82.95 
 
 
346 aa  593  1e-168  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0196172 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1985  flap endonuclease-1  83.53 
 
 
349 aa  588  1e-167  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0040  flap endonuclease-1  66.48 
 
 
350 aa  485  1e-136  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0490  flap structure-specific endonuclease  56.85 
 
 
339 aa  367  1e-100  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1158  flap structure-specific endonuclease  50.84 
 
 
351 aa  347  1e-94  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.146438  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0302  flap endonuclease-1  52.38 
 
 
346 aa  335  5.999999999999999e-91  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0703  flap endonuclease-1  48.66 
 
 
340 aa  312  3.9999999999999997e-84  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1634  flap endonuclease-1  49.55 
 
 
336 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1913  flap endonuclease-1  46.13 
 
 
338 aa  302  5.000000000000001e-81  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1926  flap endonuclease-1  47.6 
 
 
333 aa  299  5e-80  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1212  flap endonuclease-1  45.69 
 
 
338 aa  287  2e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0356  flap endonuclease-1  44.72 
 
 
333 aa  280  3e-74  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0057  flap endonuclease-1  48.55 
 
 
333 aa  279  6e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2521  flap endonuclease-1  45.24 
 
 
333 aa  278  1e-73  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.239531  normal  0.701303 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2106  flap endonuclease-1  45.51 
 
 
333 aa  275  1.0000000000000001e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0212  flap endonuclease-1  49.17 
 
 
300 aa  272  8.000000000000001e-72  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.022826  decreased coverage  0.0048464 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1492  flap endonuclease-1  44.12 
 
 
326 aa  266  4e-70  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.36701  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0558  flap endonuclease-1  42.73 
 
 
324 aa  259  6e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0280  flap endonuclease-1  41.5 
 
 
324 aa  258  1e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.969351  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0623  flap endonuclease-1  42.78 
 
 
324 aa  256  4e-67  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1360  flap endonuclease-1  41.79 
 
 
324 aa  255  9e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.880498  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33791  predicted protein  40.11 
 
 
381 aa  241  1e-62  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.561665  normal  0.280438 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02764  5' to 3' exonuclease, 5' flap endonuclease (Eurofung)  38.36 
 
 
395 aa  229  4e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0426  flap endonuclease-1  40.06 
 
 
341 aa  223  4e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42373  predicted protein  39.17 
 
 
389 aa  217  2e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.159065  normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48638  predicted protein  36.59 
 
 
421 aa  209  6e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01190  flap endonuclease, putative  42.49 
 
 
453 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1081  flap structure-specific endonuclease  36.86 
 
 
325 aa  177  3e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3231  flap structure-specific endonuclease  35.58 
 
 
325 aa  172  6.999999999999999e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.151547  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1613  flap endonuclease-1  33.85 
 
 
325 aa  171  2e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.817409  normal  0.647176 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2512  flap endonuclease-1  34.48 
 
 
326 aa  170  3e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2779  flap endonuclease-1  34.38 
 
 
326 aa  156  5.0000000000000005e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33450  5'-3' exonuclease  28.67 
 
 
676 aa  94.7  2e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.167856 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35911  predicted protein  33.83 
 
 
992 aa  80.1  0.00000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.3407  normal  0.878994 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13915  predicted protein  24.44 
 
 
330 aa  78.2  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0963407  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05216  single-stranded DNA endonuclease (Eurofung)  31.87 
 
 
1141 aa  74.7  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_3874  predicted protein  36.72 
 
 
271 aa  72.8  0.000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.301307  normal  0.764914 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03035  5'-3' exonuclease and flap-endonuclease (Eurofung)  25.17 
 
 
761 aa  69.7  0.00000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.799677 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03100  single-stranded DNA specific endodeoxyribonuclease, putative  39.05 
 
 
1323 aa  68.9  0.0000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_46971  predicted protein  27.23 
 
 
696 aa  62  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38848  predicted protein  38.68 
 
 
552 aa  60.8  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03186  Rad2-like endonuclease, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G13260)  27.41 
 
 
822 aa  53.9  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.861457 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08230  DNA polymerase I  26.56 
 
 
885 aa  50.4  0.00004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.919287 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33639  predicted protein  31.34 
 
 
894 aa  48.1  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.224011  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119559  Exodeoxyribonuclease I  22.93 
 
 
701 aa  47.8  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2468  DNA polymerase I  31.88 
 
 
873 aa  45.8  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.095823  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1104  DNA polymerase I  26.74 
 
 
912 aa  46.2  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1504  DNA polymerase I  42.31 
 
 
915 aa  45.1  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1509  DNA polymerase I  55.56 
 
 
905 aa  44.3  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2673  DNA polymerase I  48.89 
 
 
878 aa  43.5  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000968641  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_5620  predicted protein  27.5 
 
 
333 aa  43.5  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.469951  normal  0.0101798 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>