33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_38848 on replicon NC_011685
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011685  PHATRDRAFT_38848  predicted protein  100 
 
 
552 aa  1123    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03100  single-stranded DNA specific endodeoxyribonuclease, putative  44.96 
 
 
1323 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35911  predicted protein  43.85 
 
 
992 aa  113  8.000000000000001e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.3407  normal  0.878994 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05216  single-stranded DNA endonuclease (Eurofung)  51.69 
 
 
1141 aa  107  4e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48638  predicted protein  35.14 
 
 
421 aa  68.9  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0040  flap endonuclease-1  41.12 
 
 
350 aa  68.9  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0681  flap endonuclease-1  38.68 
 
 
346 aa  61.2  0.00000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.387412 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2348  flap endonuclease-1  38.68 
 
 
346 aa  60.5  0.00000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0196172 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2117  flap endonuclease-1  37.74 
 
 
346 aa  60.5  0.00000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1985  flap endonuclease-1  40.57 
 
 
349 aa  60.1  0.0000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33791  predicted protein  34.58 
 
 
381 aa  59.3  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.561665  normal  0.280438 
 
 
-
 
NC_006686  CND01190  flap endonuclease, putative  35.51 
 
 
453 aa  58.5  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0490  flap structure-specific endonuclease  37.63 
 
 
339 aa  57  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2512  flap endonuclease-1  34.74 
 
 
326 aa  56.2  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0426  flap endonuclease-1  37.36 
 
 
341 aa  55.5  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0703  flap endonuclease-1  34.02 
 
 
340 aa  54.7  0.000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1613  flap endonuclease-1  36.67 
 
 
325 aa  53.1  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.817409  normal  0.647176 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1158  flap structure-specific endonuclease  35.24 
 
 
351 aa  52.8  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.146438  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1634  flap endonuclease-1  36.67 
 
 
336 aa  52  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2521  flap endonuclease-1  37.14 
 
 
333 aa  52  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.239531  normal  0.701303 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02764  5' to 3' exonuclease, 5' flap endonuclease (Eurofung)  29.73 
 
 
395 aa  49.7  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0057  flap endonuclease-1  38.54 
 
 
333 aa  50.1  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2106  flap endonuclease-1  36.78 
 
 
333 aa  48.9  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1913  flap endonuclease-1  34.88 
 
 
338 aa  49.3  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1212  flap endonuclease-1  36.67 
 
 
338 aa  49.3  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42373  predicted protein  30.84 
 
 
389 aa  48.5  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.159065  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01350  hypothetical protein  34.65 
 
 
858 aa  47.8  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0302  flap endonuclease-1  32.99 
 
 
346 aa  47.4  0.0007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03035  5'-3' exonuclease and flap-endonuclease (Eurofung)  32.69 
 
 
761 aa  47.4  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.799677 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1926  flap endonuclease-1  38.16 
 
 
333 aa  47  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3231  flap structure-specific endonuclease  30.17 
 
 
325 aa  45.4  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.151547  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1081  flap structure-specific endonuclease  31.03 
 
 
325 aa  45.1  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33450  5'-3' exonuclease  29.2 
 
 
676 aa  45.1  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.167856 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>