46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0623 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_0623  flap endonuclease-1  100 
 
 
324 aa  650    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0558  flap endonuclease-1  80.86 
 
 
324 aa  542  1e-153  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0280  flap endonuclease-1  80.56 
 
 
324 aa  540  9.999999999999999e-153  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.969351  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1360  flap endonuclease-1  80.56 
 
 
324 aa  537  9.999999999999999e-153  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.880498  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1492  flap endonuclease-1  61.04 
 
 
326 aa  411  1e-113  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.36701  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1212  flap endonuclease-1  41.06 
 
 
338 aa  256  4e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0681  flap endonuclease-1  42.78 
 
 
346 aa  256  4e-67  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.387412 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0490  flap structure-specific endonuclease  40.47 
 
 
339 aa  254  1.0000000000000001e-66  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2117  flap endonuclease-1  42.82 
 
 
346 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0040  flap endonuclease-1  40.57 
 
 
350 aa  252  8.000000000000001e-66  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1913  flap endonuclease-1  39.59 
 
 
338 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2348  flap endonuclease-1  41.09 
 
 
346 aa  242  5e-63  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0196172 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1985  flap endonuclease-1  41.38 
 
 
349 aa  241  2e-62  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1926  flap endonuclease-1  38.94 
 
 
333 aa  237  2e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0302  flap endonuclease-1  38.95 
 
 
346 aa  236  3e-61  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1158  flap structure-specific endonuclease  40.06 
 
 
351 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.146438  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0356  flap endonuclease-1  40.45 
 
 
333 aa  233  3e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2521  flap endonuclease-1  38.89 
 
 
333 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.239531  normal  0.701303 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2106  flap endonuclease-1  39.23 
 
 
333 aa  232  8.000000000000001e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0057  flap endonuclease-1  40 
 
 
333 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1634  flap endonuclease-1  36.07 
 
 
336 aa  219  5e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0703  flap endonuclease-1  38.6 
 
 
340 aa  218  7e-56  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0212  flap endonuclease-1  40.53 
 
 
300 aa  202  8e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.022826  decreased coverage  0.0048464 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0426  flap endonuclease-1  35.47 
 
 
341 aa  194  1e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33791  predicted protein  36.19 
 
 
381 aa  189  4e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.561665  normal  0.280438 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3231  flap structure-specific endonuclease  33.66 
 
 
325 aa  164  3e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.151547  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02764  5' to 3' exonuclease, 5' flap endonuclease (Eurofung)  32.62 
 
 
395 aa  162  7e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48638  predicted protein  30.65 
 
 
421 aa  162  1e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42373  predicted protein  34.17 
 
 
389 aa  160  2e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.159065  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1081  flap structure-specific endonuclease  32.35 
 
 
325 aa  159  8e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1613  flap endonuclease-1  29.63 
 
 
325 aa  159  8e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.817409  normal  0.647176 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2512  flap endonuclease-1  28.7 
 
 
326 aa  156  6e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01190  flap endonuclease, putative  37.71 
 
 
453 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2779  flap endonuclease-1  28.26 
 
 
326 aa  141  9.999999999999999e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35911  predicted protein  39.64 
 
 
992 aa  85.9  9e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.3407  normal  0.878994 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_3874  predicted protein  39.25 
 
 
271 aa  81.6  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.301307  normal  0.764914 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05216  single-stranded DNA endonuclease (Eurofung)  36.5 
 
 
1141 aa  79.7  0.00000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03100  single-stranded DNA specific endodeoxyribonuclease, putative  28.98 
 
 
1323 aa  72.8  0.000000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33639  predicted protein  27.94 
 
 
894 aa  67.8  0.0000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.224011  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13915  predicted protein  26.26 
 
 
330 aa  62.8  0.000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0963407  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_46971  predicted protein  26.57 
 
 
696 aa  60.5  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33450  5'-3' exonuclease  28.28 
 
 
676 aa  58.9  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.167856 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03035  5'-3' exonuclease and flap-endonuclease (Eurofung)  26.23 
 
 
761 aa  54.7  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.799677 
 
 
-
 
NC_006685  CNC07150  5' flap endonuclease, putative  30.97 
 
 
643 aa  53.5  0.000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03186  Rad2-like endonuclease, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G13260)  23.32 
 
 
822 aa  52.8  0.000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.861457 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119559  Exodeoxyribonuclease I  20.99 
 
 
701 aa  44.7  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>