55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0212 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0212  flap endonuclease-1  100 
 
 		 300 aa  602  1.0000000000000001e-171  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.022826  decreased coverage  0.0048464 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1158  flap structure-specific endonuclease  65.36 
 
 		 351 aa  404  1e-111  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.146438  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0302  flap endonuclease-1  55.67 
 
 		 346 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0040  flap endonuclease-1  52.98 
 
 		 350 aa  311  1e-83  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0490  flap structure-specific endonuclease  53.67 
 
 		 339 aa  303  2.0000000000000002e-81  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0703  flap endonuclease-1  48.67 
 
 		 340 aa  294  1e-78  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2117  flap endonuclease-1  51.49 
 
 		 346 aa  291  7e-78  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2348  flap endonuclease-1  50.66 
 
 		 346 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0196172 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0681  flap endonuclease-1  49.17 
 
 		 346 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.387412 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1985  flap endonuclease-1  48.36 
 
 		 349 aa  267  1e-70  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1913  flap endonuclease-1  47.16 
 
 		 338 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1212  flap endonuclease-1  48 
 
 		 338 aa  260  2e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1634  flap endonuclease-1  47 
 
 		 336 aa  258  6e-68  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0057  flap endonuclease-1  45.33 
 
 		 333 aa  248  8e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1926  flap endonuclease-1  44.19 
 
 		 333 aa  248  9e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2521  flap endonuclease-1  41.67 
 
 		 333 aa  238  1e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.239531  normal  0.701303 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0356  flap endonuclease-1  42.72 
 
 		 333 aa  231  1e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1492  flap endonuclease-1  42.33 
 
 		 326 aa  229  4e-59  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.36701  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2106  flap endonuclease-1  44.13 
 
 		 333 aa  224  2e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1360  flap endonuclease-1  40.47 
 
 		 324 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.880498  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33791  predicted protein  40 
 
 		 381 aa  214  1.9999999999999998e-54  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.561665  normal  0.280438 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0623  flap endonuclease-1  40.53 
 
 		 324 aa  211  7.999999999999999e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0280  flap endonuclease-1  40.13 
 
 		 324 aa  211  1e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.969351  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0558  flap endonuclease-1  39.8 
 
 		 324 aa  209  3e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02764  5' to 3' exonuclease, 5' flap endonuclease (Eurofung)  39.35 
 
 		 395 aa  209  5e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0426  flap endonuclease-1  39.27 
 
 		 341 aa  202  7e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42373  predicted protein  42.56 
 
 		 389 aa  195  6e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.159065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48638  predicted protein  33.43 
 
 		 421 aa  182  8.000000000000001e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2512  flap endonuclease-1  35.14 
 
 		 326 aa  178  1e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1613  flap endonuclease-1  35.79 
 
 		 325 aa  176  3e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.817409  normal  0.647176 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1081  flap structure-specific endonuclease  35.59 
 
 		 325 aa  163  3e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01190  flap endonuclease, putative  41.82 
 
 		 453 aa  162  8.000000000000001e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3231  flap structure-specific endonuclease  34.58 
 
 		 325 aa  161  1e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.151547  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2779  flap endonuclease-1  35.57 
 
 		 326 aa  160  2e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33450  5'-3' exonuclease  30.77 
 
 		 676 aa  91.7  1e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.167856 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35911  predicted protein  30.99 
 
 		 992 aa  78.2  0.0000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.3407  normal  0.878994 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13915  predicted protein  27.54 
 
 		 330 aa  77.4  0.0000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0963407  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_3874  predicted protein  32.52 
 
 		 271 aa  74.7  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.301307  normal  0.764914 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03035  5'-3' exonuclease and flap-endonuclease (Eurofung)  28.23 
 
 		 761 aa  71.6  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.799677 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05216  single-stranded DNA endonuclease (Eurofung)  32.59 
 
 		 1141 aa  70.9  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_46971  predicted protein  25.85 
 
 		 696 aa  69.7  0.00000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03100  single-stranded DNA specific endodeoxyribonuclease, putative  29.77 
 
 		 1323 aa  62.8  0.000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03186  Rad2-like endonuclease, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G13260)  26.92 
 
 		 822 aa  54.7  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.861457 
 
 
-
 
NC_006685  CNC07150  5' flap endonuclease, putative  29.01 
 
 		 643 aa  54.3  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33639  predicted protein  30.95 
 
 		 894 aa  53.5  0.000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.224011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08230  DNA polymerase I  30.77 
 
 		 885 aa  48.5  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.919287 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119559  Exodeoxyribonuclease I  23.08 
 
 		 701 aa  48.9  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46734  predicted protein  21.74 
 
 		 894 aa  46.6  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_5620  predicted protein  24.43 
 
 		 333 aa  46.6  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.469951  normal  0.0101798 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7357  DNA polymerase I  33.06 
 
 		 1020 aa  45.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.409782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1494  5'-3' exonuclease  26.25 
 
 		 299 aa  44.3  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.32691  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0494  DNA polymerase I  34.55 
 
 		 950 aa  45.1  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.958979 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3945  DNA polymerase I  30.77 
 
 		 978 aa  43.9  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2420  exonuclease IX  27.78 
 
 		 253 aa  43.1  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1289  exonuclease IX  35.09 
 
 		 262 aa  42.4  0.009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0967687  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>