61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_2348 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_2348  flap endonuclease-1  100 
 
 		 346 aa  701    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0196172 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0681  flap endonuclease-1  82.95 
 
 		 346 aa  612  9.999999999999999e-175  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.387412 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2117  flap endonuclease-1  82.37 
 
 		 346 aa  608  1e-173  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1985  flap endonuclease-1  80.64 
 
 		 349 aa  571  1.0000000000000001e-162  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0040  flap endonuclease-1  66.19 
 
 		 350 aa  483  1e-135  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1158  flap structure-specific endonuclease  53.09 
 
 		 351 aa  360  2e-98  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.146438  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0490  flap structure-specific endonuclease  55.99 
 
 		 339 aa  358  9.999999999999999e-98  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0302  flap endonuclease-1  51.5 
 
 		 346 aa  327  3e-88  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1913  flap endonuclease-1  47.28 
 
 		 338 aa  309  5e-83  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0703  flap endonuclease-1  46.41 
 
 		 340 aa  306  3e-82  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1634  flap endonuclease-1  48.06 
 
 		 336 aa  293  3e-78  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1926  flap endonuclease-1  47.63 
 
 		 333 aa  293  3e-78  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2521  flap endonuclease-1  47.04 
 
 		 333 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.239531  normal  0.701303 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0057  flap endonuclease-1  48.18 
 
 		 333 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0212  flap endonuclease-1  50.99 
 
 		 300 aa  278  9e-74  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.022826  decreased coverage  0.0048464 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0356  flap endonuclease-1  43.17 
 
 		 333 aa  276  3e-73  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2106  flap endonuclease-1  45.59 
 
 		 333 aa  276  5e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1212  flap endonuclease-1  45.85 
 
 		 338 aa  272  6e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1492  flap endonuclease-1  41.79 
 
 		 326 aa  259  4e-68  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.36701  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0280  flap endonuclease-1  38.9 
 
 		 324 aa  253  5.000000000000001e-66  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.969351  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0558  flap endonuclease-1  39.19 
 
 		 324 aa  252  5.000000000000001e-66  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1360  flap endonuclease-1  39.2 
 
 		 324 aa  251  1e-65  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.880498  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0623  flap endonuclease-1  41.09 
 
 		 324 aa  249  5e-65  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33791  predicted protein  39.83 
 
 		 381 aa  238  8e-62  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.561665  normal  0.280438 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02764  5' to 3' exonuclease, 5' flap endonuclease (Eurofung)  37.67 
 
 		 395 aa  224  2e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0426  flap endonuclease-1  39.47 
 
 		 341 aa  224  2e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42373  predicted protein  39.89 
 
 		 389 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.159065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48638  predicted protein  36.59 
 
 		 421 aa  211  2e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01190  flap endonuclease, putative  43.22 
 
 		 453 aa  202  8e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1081  flap structure-specific endonuclease  38.46 
 
 		 325 aa  181  2e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2512  flap endonuclease-1  35.94 
 
 		 326 aa  179  4.999999999999999e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1613  flap endonuclease-1  35.63 
 
 		 325 aa  179  7e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.817409  normal  0.647176 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3231  flap structure-specific endonuclease  37.18 
 
 		 325 aa  177  2e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.151547  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2779  flap endonuclease-1  35.42 
 
 		 326 aa  162  6e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33450  5'-3' exonuclease  29.75 
 
 		 676 aa  99  1e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.167856 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35911  predicted protein  35.29 
 
 		 992 aa  82.4  0.000000000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.3407  normal  0.878994 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05216  single-stranded DNA endonuclease (Eurofung)  35.1 
 
 		 1141 aa  79  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13915  predicted protein  25.09 
 
 		 330 aa  78.6  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0963407  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_3874  predicted protein  35.77 
 
 		 271 aa  73.2  0.000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.301307  normal  0.764914 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03035  5'-3' exonuclease and flap-endonuclease (Eurofung)  27.17 
 
 		 761 aa  71.2  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.799677 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03100  single-stranded DNA specific endodeoxyribonuclease, putative  34.06 
 
 		 1323 aa  70.5  0.00000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_46971  predicted protein  27.72 
 
 		 696 aa  61.6  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38848  predicted protein  38.68 
 
 		 552 aa  60.8  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08230  DNA polymerase I  26.56 
 
 		 885 aa  55.1  0.000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.919287 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03186  Rad2-like endonuclease, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G13260)  26.8 
 
 		 822 aa  52.8  0.000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.861457 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119559  Exodeoxyribonuclease I  25.85 
 
 		 701 aa  51.6  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33639  predicted protein  25.53 
 
 		 894 aa  50.8  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.224011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2468  DNA polymerase I  33.58 
 
 		 873 aa  50.4  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.095823  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC07150  5' flap endonuclease, putative  29.1 
 
 		 643 aa  49.7  0.00007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04860  DNA polymerase I  26.59 
 
 		 870 aa  49.3  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029838  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1104  DNA polymerase I  26.82 
 
 		 912 aa  48.5  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2673  DNA polymerase I  53.33 
 
 		 878 aa  47.8  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000968641  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2445  DNA polymerase I  26.25 
 
 		 877 aa  45.8  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1504  DNA polymerase I  46.15 
 
 		 915 aa  45.8  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1349  DNA polymerase I  26.02 
 
 		 924 aa  45.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38206  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_5620  predicted protein  28.08 
 
 		 333 aa  43.5  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.469951  normal  0.0101798 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2573  DNA polymerase I  56.82 
 
 		 892 aa  43.1  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000431166  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20220  DNA polymerase I  53.49 
 
 		 901 aa  43.5  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.232173 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1509  DNA polymerase I  39.78 
 
 		 905 aa  43.1  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3657  DNA polymerase I  40.68 
 
 		 946 aa  42.7  0.009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1226  DNA polymerase I  50 
 
 		 893 aa  42.7  0.009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.826859 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>