40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_5620 on replicon NC_009369
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009369  OSTLU_5620  predicted protein  100 
 
 
333 aa  676    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.469951  normal  0.0101798 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13915  predicted protein  36.69 
 
 
330 aa  186  5e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0963407  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03035  5'-3' exonuclease and flap-endonuclease (Eurofung)  32.53 
 
 
761 aa  175  9.999999999999999e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.799677 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33450  5'-3' exonuclease  32.72 
 
 
676 aa  165  1.0000000000000001e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.167856 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00080  exonuclease, putative  29.84 
 
 
1012 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.008122  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42373  predicted protein  25.98 
 
 
389 aa  90.9  3e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.159065  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46734  predicted protein  27.82 
 
 
894 aa  82  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48638  predicted protein  25.96 
 
 
421 aa  80.1  0.00000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1613  flap endonuclease-1  29 
 
 
325 aa  79.7  0.00000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.817409  normal  0.647176 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02764  5' to 3' exonuclease, 5' flap endonuclease (Eurofung)  26.54 
 
 
395 aa  77.4  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1212  flap endonuclease-1  24.29 
 
 
338 aa  77  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2512  flap endonuclease-1  29.72 
 
 
326 aa  77.4  0.0000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48206  predicted protein  27.4 
 
 
794 aa  74.7  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.32747  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3231  flap structure-specific endonuclease  27.5 
 
 
325 aa  74.3  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.151547  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01190  flap endonuclease, putative  27.02 
 
 
453 aa  73.6  0.000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1081  flap structure-specific endonuclease  27.5 
 
 
325 aa  73.2  0.000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0057  flap endonuclease-1  29.11 
 
 
333 aa  69.7  0.00000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33791  predicted protein  23.4 
 
 
381 aa  69.3  0.00000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.561665  normal  0.280438 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2521  flap endonuclease-1  31.22 
 
 
333 aa  68.6  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.239531  normal  0.701303 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1913  flap endonuclease-1  23.05 
 
 
338 aa  67.8  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1926  flap endonuclease-1  28.34 
 
 
333 aa  67.4  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1634  flap endonuclease-1  25.95 
 
 
336 aa  65.5  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2779  flap endonuclease-1  27.69 
 
 
326 aa  64.7  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0490  flap structure-specific endonuclease  25.18 
 
 
339 aa  57.8  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119559  Exodeoxyribonuclease I  25.96 
 
 
701 aa  57.4  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0040  flap endonuclease-1  28.02 
 
 
350 aa  54.7  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2117  flap endonuclease-1  25.82 
 
 
346 aa  54.7  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0302  flap endonuclease-1  22.83 
 
 
346 aa  55.1  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1158  flap structure-specific endonuclease  25.68 
 
 
351 aa  54.7  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.146438  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0681  flap endonuclease-1  27.59 
 
 
346 aa  53.9  0.000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.387412 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1985  flap endonuclease-1  25.09 
 
 
349 aa  53.5  0.000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1492  flap endonuclease-1  25.77 
 
 
326 aa  52.8  0.000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.36701  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2106  flap endonuclease-1  26.76 
 
 
333 aa  52.4  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2348  flap endonuclease-1  28.08 
 
 
346 aa  52  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0196172 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0356  flap endonuclease-1  25.3 
 
 
333 aa  50.1  0.00005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0212  flap endonuclease-1  23.87 
 
 
300 aa  47.8  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.022826  decreased coverage  0.0048464 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02340  viral life cycle-related protein, putative  26.03 
 
 
768 aa  47.8  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0703  flap endonuclease-1  22.92 
 
 
340 aa  47  0.0004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03100  single-stranded DNA specific endodeoxyribonuclease, putative  33.96 
 
 
1323 aa  45.8  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0426  flap endonuclease-1  24.59 
 
 
341 aa  43.1  0.007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>