90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_48638 on replicon NC_011686
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011686  PHATRDRAFT_48638  predicted protein  100 
 
 		 421 aa  871    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33791  predicted protein  44 
 
 		 381 aa  342  1e-92  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.561665  normal  0.280438 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02764  5' to 3' exonuclease, 5' flap endonuclease (Eurofung)  44.9 
 
 		 395 aa  335  7.999999999999999e-91  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42373  predicted protein  44.94 
 
 		 389 aa  332  8e-90  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.159065  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND01190  flap endonuclease, putative  44.32 
 
 		 453 aa  330  2e-89  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1158  flap structure-specific endonuclease  34.77 
 
 		 351 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.146438  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2348  flap endonuclease-1  37.34 
 
 		 346 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0196172 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0040  flap endonuclease-1  34.09 
 
 		 350 aa  212  9e-54  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1985  flap endonuclease-1  35.61 
 
 		 349 aa  211  1e-53  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0681  flap endonuclease-1  36.84 
 
 		 346 aa  209  5e-53  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.387412 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0490  flap structure-specific endonuclease  33.86 
 
 		 339 aa  206  9e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2117  flap endonuclease-1  40.43 
 
 		 346 aa  200  3e-50  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0302  flap endonuclease-1  32.89 
 
 		 346 aa  195  1e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0057  flap endonuclease-1  31.27 
 
 		 333 aa  192  1e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1212  flap endonuclease-1  32.11 
 
 		 338 aa  188  2e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1926  flap endonuclease-1  39.16 
 
 		 333 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1492  flap endonuclease-1  34.29 
 
 		 326 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.36701  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0426  flap endonuclease-1  31.03 
 
 		 341 aa  173  5.999999999999999e-42  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0212  flap endonuclease-1  33.43 
 
 		 300 aa  170  4e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.022826  decreased coverage  0.0048464 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1913  flap endonuclease-1  30.03 
 
 		 338 aa  169  1e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0558  flap endonuclease-1  29.92 
 
 		 324 aa  169  1e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0280  flap endonuclease-1  29.92 
 
 		 324 aa  168  1e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.969351  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0703  flap endonuclease-1  28.39 
 
 		 340 aa  168  2e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1360  flap endonuclease-1  30.11 
 
 		 324 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.880498  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0623  flap endonuclease-1  30.65 
 
 		 324 aa  162  1e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2106  flap endonuclease-1  30.49 
 
 		 333 aa  159  1e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1634  flap endonuclease-1  29.95 
 
 		 336 aa  156  8e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2512  flap endonuclease-1  34.78 
 
 		 326 aa  154  4e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2521  flap endonuclease-1  35.74 
 
 		 333 aa  153  5e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.239531  normal  0.701303 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1613  flap endonuclease-1  27.49 
 
 		 325 aa  148  2.0000000000000003e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.817409  normal  0.647176 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0356  flap endonuclease-1  32.65 
 
 		 333 aa  144  4e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1081  flap structure-specific endonuclease  32.4 
 
 		 325 aa  142  9e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3231  flap structure-specific endonuclease  31.53 
 
 		 325 aa  142  9e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.151547  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2779  flap endonuclease-1  32.42 
 
 		 326 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13915  predicted protein  27.31 
 
 		 330 aa  92  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0963407  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_3874  predicted protein  27.47 
 
 		 271 aa  90.9  4e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.301307  normal  0.764914 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33450  5'-3' exonuclease  26.91 
 
 		 676 aa  89  1e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.167856 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35911  predicted protein  28.38 
 
 		 992 aa  87  5e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.3407  normal  0.878994 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03035  5'-3' exonuclease and flap-endonuclease (Eurofung)  26.47 
 
 		 761 aa  85.5  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.799677 
 
 
-
 
NC_006685  CNC07150  5' flap endonuclease, putative  31.65 
 
 		 643 aa  79  0.0000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05216  single-stranded DNA endonuclease (Eurofung)  34.17 
 
 		 1141 aa  75.1  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03100  single-stranded DNA specific endodeoxyribonuclease, putative  35.54 
 
 		 1323 aa  74.7  0.000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38848  predicted protein  35.14 
 
 		 552 aa  69.3  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_5620  predicted protein  26.32 
 
 		 333 aa  67.8  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.469951  normal  0.0101798 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2250  DNA polymerase I  28.38 
 
 		 866 aa  66.6  0.0000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.177355  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1962  DNA polymerase I  28.38 
 
 		 866 aa  66.2  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0886  DNA polymerase I  34.86 
 
 		 894 aa  60.5  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2075  DNA polymerase I  26.79 
 
 		 896 aa  56.6  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000172322  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1494  5'-3' exonuclease  27.27 
 
 		 299 aa  56.2  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.32691  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_46971  predicted protein  24.52 
 
 		 696 aa  55.1  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4978  DNA polymerase I  30.66 
 
 		 936 aa  54.3  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0087  DNA polymerase I  24.1 
 
 		 903 aa  53.5  0.000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1062  DNA polymerase I  28.24 
 
 		 934 aa  52.4  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46734  predicted protein  23.83 
 
 		 894 aa  51.2  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1711  DNA polymerase I  24.91 
 
 		 943 aa  50.4  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.338945  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33639  predicted protein  25.09 
 
 		 894 aa  50.4  0.00006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.224011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0541  DNA polymerase I  25.55 
 
 		 908 aa  50.1  0.00008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2468  DNA polymerase I  24.23 
 
 		 873 aa  49.3  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.095823  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0044  DNA polymerase I  25.91 
 
 		 939 aa  49.3  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00167336  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1148  DNA-directed DNA polymerase  27.92 
 
 		 937 aa  48.9  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.725762  normal  0.433626 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119559  Exodeoxyribonuclease I  24.9 
 
 		 701 aa  48.1  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03186  Rad2-like endonuclease, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G13260)  25.98 
 
 		 822 aa  48.1  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.861457 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2019  DNA polymerase I  39.66 
 
 		 885 aa  48.1  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.206031  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0378  DNA polymerase I  25.45 
 
 		 956 aa  46.6  0.0008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00080  exonuclease, putative  34.55 
 
 		 1012 aa  46.6  0.0009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.008122  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04860  DNA polymerase I  22.57 
 
 		 870 aa  46.6  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029838  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1599  DNA polymerase I  29.82 
 
 		 883 aa  46.2  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2156  DNA polymerase I  25.18 
 
 		 872 aa  46.2  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1736  DNA polymerase I  44.07 
 
 		 879 aa  46.2  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2624  DNA polymerase I  24.11 
 
 		 934 aa  46.6  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.972131  normal  0.775806 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0278  DNA polymerase I  33.33 
 
 		 945 aa  46.2  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0113  DNA polymerase I  25.32 
 
 		 896 aa  45.1  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13041  DNA polymerase I  40 
 
 		 976 aa  45.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0850  DNA polymerase I  26.39 
 
 		 982 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0300789 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2573  DNA polymerase I  23.79 
 
 		 906 aa  45.4  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2453  DNA polymerase I  26.05 
 
 		 907 aa  45.4  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0096  DNA-directed DNA polymerase  24.89 
 
 		 933 aa  44.3  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00741762  hitchhiker  0.000000822051 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0099  DNA polymerase I  28.36 
 
 		 896 aa  44.3  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0419  DNA polymerase I  25 
 
 		 988 aa  44.3  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1325  DNA polymerase I  26.29 
 
 		 957 aa  43.9  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0389  DNA polymerase I  40.68 
 
 		 880 aa  43.9  0.005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02340  viral life cycle-related protein, putative  24.73 
 
 		 768 aa  43.5  0.006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1080  DNA polymerase I  27.98 
 
 		 886 aa  43.9  0.006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0494  DNA polymerase I  38.18 
 
 		 950 aa  43.5  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.958979 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2014  DNA polymerase I  31.58 
 
 		 875 aa  43.5  0.007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000063172  unclonable  0.00000000000000410772 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13151  DNA polymerase I  36.07 
 
 		 976 aa  43.5  0.007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0959  DNA polymerase I  26.72 
 
 		 928 aa  43.1  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.75162 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1103  DNA polymerase I  29.69 
 
 		 861 aa  43.5  0.008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1429  DNA polymerase I  24.01 
 
 		 942 aa  43.5  0.008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1024  DNA polymerase I  28.57 
 
 		 868 aa  43.1  0.009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>