More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1494 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1494  5'-3' exonuclease  100 
 
 		 299 aa  585  1e-166  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.32691  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0036  5'-3' exonuclease  46.53 
 
 		 299 aa  257  2e-67  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.974407  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2860  DNA polymerase I  43.77 
 
 		 912 aa  253  3e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.129264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0087  DNA polymerase I  43.17 
 
 		 903 aa  250  2e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0346  DNA polymerase I  43.17 
 
 		 892 aa  249  5e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.335360000000001e-24 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0541  DNA polymerase I  41.73 
 
 		 908 aa  248  8e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1429  DNA polymerase I  42.25 
 
 		 942 aa  247  2e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0365  DNA polymerase I  43.17 
 
 		 892 aa  247  2e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1688  DNA polymerase I  42.35 
 
 		 940 aa  243  3e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0023  DNA polymerase I  41.61 
 
 		 932 aa  243  3.9999999999999997e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000103572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0021  DNA polymerase I  41.61 
 
 		 932 aa  243  3.9999999999999997e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00121039  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4195  DNA polymerase I  41.61 
 
 		 932 aa  243  3.9999999999999997e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00580719  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0021  DNA polymerase I  42.96 
 
 		 902 aa  241  7.999999999999999e-63  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1992  DNA polymerase I  42.96 
 
 		 902 aa  241  7.999999999999999e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0554  DNA polymerase A  42.24 
 
 		 903 aa  239  2.9999999999999997e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.266566  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2156  DNA polymerase I  45.64 
 
 		 872 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1711  DNA polymerase I  39.65 
 
 		 943 aa  238  8e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.338945  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0044  DNA polymerase I  40.57 
 
 		 939 aa  238  1e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00167336  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3902  DNA polymerase I  39.66 
 
 		 892 aa  238  1e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000292646  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0044  DNA polymerase I  42.86 
 
 		 911 aa  237  1e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.812891  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  40.5 
 
 		 891 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2285  DNA polymerase I  42.14 
 
 		 1273 aa  234  1.0000000000000001e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.153285  hitchhiker  0.0000116157 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3185  fused DNA polymerase 5'->3' exonuclease and 3'->5' polymerase and 3'->5' exonuclease  42.61 
 
 		 938 aa  234  1.0000000000000001e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.994376  normal  0.149667 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2224  DNA polymerase I  44.33 
 
 		 846 aa  233  4.0000000000000004e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.817961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1612  DNA polymerase I  40.65 
 
 		 902 aa  233  4.0000000000000004e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3967  DNA polymerase I  41.26 
 
 		 931 aa  232  5e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000137661  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2573  DNA polymerase I  39.93 
 
 		 906 aa  232  7.000000000000001e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0718  DNA polymerase I  42.16 
 
 		 951 aa  231  9e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2983  DNA polymerase I  41.28 
 
 		 892 aa  231  1e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4517  DNA polymerase I  39.73 
 
 		 929 aa  231  1e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21603  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2798  DNA polymerase I  39.15 
 
 		 888 aa  231  1e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2421  DNA polymerase I  41.99 
 
 		 904 aa  230  2e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0819967  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4227  DNA polymerase I  40.07 
 
 		 929 aa  230  2e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0477521  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6788  DNA polymerase I  41.49 
 
 		 913 aa  230  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0147599  hitchhiker  0.00000170009 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1542  DNA polymerase I  40.69 
 
 		 940 aa  229  3e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4887  DNA polymerase I  42.16 
 
 		 934 aa  229  4e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000312634  hitchhiker  0.0000015928 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4978  DNA polymerase I  39.51 
 
 		 936 aa  229  5e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0113  DNA polymerase I  40.93 
 
 		 896 aa  229  5e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2864  DNA polymerase I  41.45 
 
 		 480 aa  229  5e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1092  DNA polymerase I  43.55 
 
 		 932 aa  228  6e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.416306  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0765  DNA polymerase I  40.78 
 
 		 930 aa  228  6e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0099  DNA polymerase I  40.57 
 
 		 896 aa  228  1e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0227  DNA polymerase I  42.16 
 
 		 934 aa  227  2e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.774927  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2345  DNA polymerase I  42.05 
 
 		 895 aa  227  2e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08230  DNA polymerase I  40.07 
 
 		 885 aa  226  3e-58  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.919287 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  38.63 
 
 		 891 aa  226  3e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2624  DNA polymerase I  40.35 
 
 		 934 aa  226  3e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.972131  normal  0.775806 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2834  DNA polymerase I  40.78 
 
 		 913 aa  226  4e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2415  DNA polymerase I  42.96 
 
 		 888 aa  226  4e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0701371 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03749  DNA polymerase I  40.28 
 
 		 928 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000312835  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4123  DNA polymerase I  40.28 
 
 		 928 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000018502  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4337  DNA polymerase I  40.28 
 
 		 928 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000947993  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5306  DNA polymerase I  40.07 
 
 		 928 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000330989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0568  DNA polymerase I  39.15 
 
 		 905 aa  226  5.0000000000000005e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03698  hypothetical protein  40.28 
 
 		 928 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000500829  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0787  DNA polymerase I  42.56 
 
 		 876 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4088  DNA polymerase I  40.07 
 
 		 928 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000478192  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4382  DNA polymerase I  40.28 
 
 		 928 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000170331  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4152  DNA polymerase I  40.28 
 
 		 928 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000213441  hitchhiker  0.000146367 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1441  DNA polymerase I  41.49 
 
 		 850 aa  226  5.0000000000000005e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001917  DNA polymerase I  40.91 
 
 		 928 aa  225  6e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000349897  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4669  DNA polymerase I  39.65 
 
 		 922 aa  225  7e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1794  DNA polymerase type I  40.21 
 
 		 926 aa  224  9e-58  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3906  DNA polymerase I  39.65 
 
 		 922 aa  224  1e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000887796  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4164  DNA polymerase I  39.93 
 
 		 928 aa  224  1e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0170728  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4246  DNA polymerase I  40.28 
 
 		 928 aa  224  1e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000118244  normal  0.166094 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2017  DNA polymerase I  41.34 
 
 		 866 aa  224  1e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1062  DNA polymerase I  39.58 
 
 		 934 aa  224  1e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04860  DNA polymerase I  40.26 
 
 		 870 aa  224  2e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029838  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2673  DNA polymerase I  42.11 
 
 		 878 aa  224  2e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000968641  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0358  DNA polymerase I  40.07 
 
 		 910 aa  223  2e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.681988  normal  0.0403702 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4102  DNA polymerase I  39.93 
 
 		 930 aa  223  2e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000162392  normal  0.404063 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3905  DNA polymerase I  39.65 
 
 		 922 aa  223  2e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0001632  normal  0.292845 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3813  DNA polymerase I  39.43 
 
 		 939 aa  224  2e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.273799  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2835  DNA polymerase I  39.29 
 
 		 893 aa  224  2e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333743  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0360  DNA polymerase I  43.92 
 
 		 898 aa  223  3e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4419  DNA polymerase I  40.14 
 
 		 915 aa  223  3e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.251272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3997  DNA polymerase I  39.65 
 
 		 922 aa  223  3e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00125715  normal  0.0107257 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4109  DNA polymerase I  39.65 
 
 		 922 aa  223  3e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000411128  normal  0.224079 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2435  DNA polymerase I  40.62 
 
 		 937 aa  223  3e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.326826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00572  DNA polymerase I  40.4 
 
 		 930 aa  223  4e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0073  DNA polymerase I  41.87 
 
 		 926 aa  223  4e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.800167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0015  DNA polymerase I  40.62 
 
 		 928 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.853211  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0280  DNA polymerase I  37.76 
 
 		 916 aa  221  9.999999999999999e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1645  DNA polymerase A  40.98 
 
 		 945 aa  221  9.999999999999999e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2852  DNA polymerase I  39.64 
 
 		 906 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00117674  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2042  DNA polymerase I  40.62 
 
 		 937 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.782294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0873  DNA polymerase I  38.95 
 
 		 941 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.504211  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3011  DNA polymerase I  37.81 
 
 		 957 aa  221  1.9999999999999999e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2409  DNA polymerase I  40.91 
 
 		 934 aa  220  1.9999999999999999e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078353  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4210  DNA polymerase I  38.97 
 
 		 928 aa  219  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0026674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4327  DNA polymerase I  38.97 
 
 		 928 aa  219  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.44762 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4281  DNA polymerase I  38.97 
 
 		 928 aa  219  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.729451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4231  DNA polymerase I  38.97 
 
 		 928 aa  219  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000696994  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4388  DNA polymerase I  39.24 
 
 		 928 aa  219  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00514081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1403  DNA polymerase I  42.31 
 
 		 878 aa  219  5e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2573  DNA polymerase I  40.93 
 
 		 892 aa  219  5e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000431166  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2453  DNA polymerase I  38.21 
 
 		 907 aa  219  6e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2230  DNA polymerase I  39.72 
 
 		 946 aa  218  1e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1310  DNA polymerase I  36.36 
 
 		 897 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0646718  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>