48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_1492 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009635  Maeo_1492  flap endonuclease-1  100 
 
 
326 aa  653    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.36701  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0280  flap endonuclease-1  64.42 
 
 
324 aa  431  1e-120  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.969351  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1360  flap endonuclease-1  63.8 
 
 
324 aa  425  1e-118  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.880498  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0558  flap endonuclease-1  63.19 
 
 
324 aa  426  1e-118  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0623  flap endonuclease-1  61.04 
 
 
324 aa  411  1e-113  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0490  flap structure-specific endonuclease  44.31 
 
 
339 aa  277  2e-73  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1158  flap structure-specific endonuclease  45.17 
 
 
351 aa  271  8.000000000000001e-72  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.146438  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2117  flap endonuclease-1  44.35 
 
 
346 aa  268  5.9999999999999995e-71  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0681  flap endonuclease-1  44.12 
 
 
346 aa  266  4e-70  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.387412 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0040  flap endonuclease-1  42.33 
 
 
350 aa  265  1e-69  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1985  flap endonuclease-1  41.49 
 
 
349 aa  256  4e-67  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0703  flap endonuclease-1  40.7 
 
 
340 aa  256  5e-67  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1913  flap endonuclease-1  40.82 
 
 
338 aa  255  7e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2348  flap endonuclease-1  41.19 
 
 
346 aa  251  1e-65  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0196172 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1212  flap endonuclease-1  40.52 
 
 
338 aa  247  2e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0302  flap endonuclease-1  38.73 
 
 
346 aa  246  3e-64  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2521  flap endonuclease-1  39.88 
 
 
333 aa  236  3e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.239531  normal  0.701303 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1926  flap endonuclease-1  38.19 
 
 
333 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0356  flap endonuclease-1  39.87 
 
 
333 aa  232  8.000000000000001e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0057  flap endonuclease-1  37.65 
 
 
333 aa  224  1e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1634  flap endonuclease-1  36.44 
 
 
336 aa  222  6e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2106  flap endonuclease-1  35.67 
 
 
333 aa  218  8.999999999999998e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0212  flap endonuclease-1  42.33 
 
 
300 aa  215  9.999999999999999e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.022826  decreased coverage  0.0048464 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33791  predicted protein  36.75 
 
 
381 aa  207  2e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.561665  normal  0.280438 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0426  flap endonuclease-1  34.95 
 
 
341 aa  203  3e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02764  5' to 3' exonuclease, 5' flap endonuclease (Eurofung)  35.22 
 
 
395 aa  198  9e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3231  flap structure-specific endonuclease  34.74 
 
 
325 aa  191  1e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.151547  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42373  predicted protein  35.94 
 
 
389 aa  187  2e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.159065  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1081  flap structure-specific endonuclease  34.42 
 
 
325 aa  187  2e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48638  predicted protein  30.75 
 
 
421 aa  175  9.999999999999999e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01190  flap endonuclease, putative  38.13 
 
 
453 aa  168  1e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2512  flap endonuclease-1  29.81 
 
 
326 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1613  flap endonuclease-1  28.97 
 
 
325 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.817409  normal  0.647176 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2779  flap endonuclease-1  29.06 
 
 
326 aa  156  6e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35911  predicted protein  26.27 
 
 
992 aa  89.7  7e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.3407  normal  0.878994 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_3874  predicted protein  31.82 
 
 
271 aa  82.8  0.000000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.301307  normal  0.764914 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05216  single-stranded DNA endonuclease (Eurofung)  36.89 
 
 
1141 aa  79.7  0.00000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03100  single-stranded DNA specific endodeoxyribonuclease, putative  36.7 
 
 
1323 aa  73.6  0.000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC07150  5' flap endonuclease, putative  30.97 
 
 
643 aa  71.2  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13915  predicted protein  24.58 
 
 
330 aa  63.5  0.000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0963407  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33450  5'-3' exonuclease  27.13 
 
 
676 aa  61.6  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.167856 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33639  predicted protein  26.27 
 
 
894 aa  58.9  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.224011  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_46971  predicted protein  25.68 
 
 
696 aa  57.4  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1637  DNA polymerase I  25.2 
 
 
936 aa  55.5  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119559  Exodeoxyribonuclease I  22.52 
 
 
701 aa  53.1  0.000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03035  5'-3' exonuclease and flap-endonuclease (Eurofung)  26.92 
 
 
761 aa  51.6  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.799677 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03186  Rad2-like endonuclease, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G13260)  25.13 
 
 
822 aa  47.8  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.861457 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_5620  predicted protein  25.19 
 
 
333 aa  44.7  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.469951  normal  0.0101798 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>