50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_33450 on replicon NC_009047
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009047  PICST_33450  5'-3' exonuclease  100 
 
 		 676 aa  1397    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.167856 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03035  5'-3' exonuclease and flap-endonuclease (Eurofung)  40.18 
 
 		 761 aa  272  2e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.799677 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13915  predicted protein  34.56 
 
 		 330 aa  206  1e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0963407  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_5620  predicted protein  32.72 
 
 		 333 aa  156  1e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.469951  normal  0.0101798 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00080  exonuclease, putative  27.41 
 
 		 1012 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.008122  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0040  flap endonuclease-1  29.58 
 
 		 350 aa  101  4e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2348  flap endonuclease-1  29.75 
 
 		 346 aa  98.2  4e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0196172 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1913  flap endonuclease-1  31.76 
 
 		 338 aa  97.1  9e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48206  predicted protein  27.4 
 
 		 794 aa  95.1  4e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.32747  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0681  flap endonuclease-1  28.67 
 
 		 346 aa  94.4  6e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.387412 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0490  flap structure-specific endonuclease  30.12 
 
 		 339 aa  94  9e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2117  flap endonuclease-1  28.67 
 
 		 346 aa  92.8  2e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1926  flap endonuclease-1  30.15 
 
 		 333 aa  91.7  4e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33791  predicted protein  27.44 
 
 		 381 aa  91.3  5e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.561665  normal  0.280438 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1158  flap structure-specific endonuclease  28.04 
 
 		 351 aa  90.1  1e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.146438  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48638  predicted protein  26.91 
 
 		 421 aa  89  3e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2521  flap endonuclease-1  27.65 
 
 		 333 aa  87.8  5e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.239531  normal  0.701303 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1985  flap endonuclease-1  30.04 
 
 		 349 aa  88.2  5e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42373  predicted protein  27.8 
 
 		 389 aa  86.3  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.159065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0703  flap endonuclease-1  27.6 
 
 		 340 aa  84  0.000000000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1212  flap endonuclease-1  27.45 
 
 		 338 aa  84  0.000000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0356  flap endonuclease-1  30.19 
 
 		 333 aa  82.8  0.00000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1634  flap endonuclease-1  29.22 
 
 		 336 aa  82.8  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02764  5' to 3' exonuclease, 5' flap endonuclease (Eurofung)  27.17 
 
 		 395 aa  81.6  0.00000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2106  flap endonuclease-1  30.46 
 
 		 333 aa  81.3  0.00000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1613  flap endonuclease-1  27.07 
 
 		 325 aa  80.9  0.00000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.817409  normal  0.647176 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2512  flap endonuclease-1  25.32 
 
 		 326 aa  79.7  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0302  flap endonuclease-1  26.54 
 
 		 346 aa  78.6  0.0000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0212  flap endonuclease-1  30.77 
 
 		 300 aa  78.6  0.0000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.022826  decreased coverage  0.0048464 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0057  flap endonuclease-1  26.87 
 
 		 333 aa  78.2  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46734  predicted protein  27.94 
 
 		 894 aa  77.8  0.0000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35911  predicted protein  38.1 
 
 		 992 aa  77.4  0.0000000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.3407  normal  0.878994 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0426  flap endonuclease-1  26.85 
 
 		 341 aa  76.3  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119559  Exodeoxyribonuclease I  27.86 
 
 		 701 aa  75.9  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05216  single-stranded DNA endonuclease (Eurofung)  34.27 
 
 		 1141 aa  73.9  0.000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3231  flap structure-specific endonuclease  25.6 
 
 		 325 aa  72  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.151547  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01190  flap endonuclease, putative  27.11 
 
 		 453 aa  69.3  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_3874  predicted protein  33.62 
 
 		 271 aa  68.2  0.0000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.301307  normal  0.764914 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03100  single-stranded DNA specific endodeoxyribonuclease, putative  33.93 
 
 		 1323 aa  67  0.000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2779  flap endonuclease-1  24.9 
 
 		 326 aa  65.9  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1081  flap structure-specific endonuclease  25.3 
 
 		 325 aa  64.7  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1492  flap endonuclease-1  27.69 
 
 		 326 aa  61.6  0.00000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.36701  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1360  flap endonuclease-1  27.92 
 
 		 324 aa  58.5  0.0000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.880498  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0623  flap endonuclease-1  29.9 
 
 		 324 aa  58.9  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0280  flap endonuclease-1  26.38 
 
 		 324 aa  58.2  0.0000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.969351  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0558  flap endonuclease-1  25.98 
 
 		 324 aa  56.2  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33639  predicted protein  23.85 
 
 		 894 aa  55.1  0.000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.224011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_46971  predicted protein  24.8 
 
 		 696 aa  54.3  0.000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02340  viral life cycle-related protein, putative  24.18 
 
 		 768 aa  49.7  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38848  predicted protein  29.2 
 
 		 552 aa  45.1  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>