63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_2117 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_2117  flap endonuclease-1  100 
 
 		 346 aa  696    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0681  flap endonuclease-1  82.66 
 
 		 346 aa  613  9.999999999999999e-175  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.387412 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2348  flap endonuclease-1  82.37 
 
 		 346 aa  591  1e-168  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0196172 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1985  flap endonuclease-1  82.66 
 
 		 349 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0040  flap endonuclease-1  68.48 
 
 		 350 aa  500  1e-140  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0490  flap structure-specific endonuclease  55.86 
 
 		 339 aa  365  1e-100  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1158  flap structure-specific endonuclease  53.09 
 
 		 351 aa  358  8e-98  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.146438  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0302  flap endonuclease-1  52.99 
 
 		 346 aa  341  1e-92  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1926  flap endonuclease-1  50.3 
 
 		 333 aa  314  9.999999999999999e-85  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1913  flap endonuclease-1  47.41 
 
 		 338 aa  312  5.999999999999999e-84  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0703  flap endonuclease-1  48.2 
 
 		 340 aa  306  2.0000000000000002e-82  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1634  flap endonuclease-1  49.4 
 
 		 336 aa  299  5e-80  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1212  flap endonuclease-1  49.28 
 
 		 338 aa  294  2e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0356  flap endonuclease-1  45.34 
 
 		 333 aa  291  1e-77  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0057  flap endonuclease-1  48.16 
 
 		 333 aa  286  4e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2106  flap endonuclease-1  46.5 
 
 		 333 aa  281  1e-74  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2521  flap endonuclease-1  44.91 
 
 		 333 aa  279  5e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.239531  normal  0.701303 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0212  flap endonuclease-1  51.49 
 
 		 300 aa  278  8e-74  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.022826  decreased coverage  0.0048464 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1492  flap endonuclease-1  44.35 
 
 		 326 aa  268  7e-71  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.36701  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0558  flap endonuclease-1  42.07 
 
 		 324 aa  264  2e-69  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0280  flap endonuclease-1  42.07 
 
 		 324 aa  264  2e-69  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.969351  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1360  flap endonuclease-1  42.07 
 
 		 324 aa  259  3e-68  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.880498  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0623  flap endonuclease-1  42.82 
 
 		 324 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33791  predicted protein  38.44 
 
 		 381 aa  234  2.0000000000000002e-60  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.561665  normal  0.280438 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02764  5' to 3' exonuclease, 5' flap endonuclease (Eurofung)  39.83 
 
 		 395 aa  231  1e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0426  flap endonuclease-1  41.59 
 
 		 341 aa  230  2e-59  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42373  predicted protein  39.2 
 
 		 389 aa  219  7.999999999999999e-56  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.159065  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND01190  flap endonuclease, putative  43.59 
 
 		 453 aa  204  2e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48638  predicted protein  40.43 
 
 		 421 aa  200  3e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3231  flap structure-specific endonuclease  36.76 
 
 		 325 aa  182  1e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.151547  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1081  flap structure-specific endonuclease  37.27 
 
 		 325 aa  181  2e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2512  flap endonuclease-1  35.76 
 
 		 326 aa  181  2e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1613  flap endonuclease-1  34.63 
 
 		 325 aa  173  2.9999999999999996e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.817409  normal  0.647176 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2779  flap endonuclease-1  35.16 
 
 		 326 aa  167  2e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33450  5'-3' exonuclease  28.67 
 
 		 676 aa  92.8  8e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.167856 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13915  predicted protein  25.93 
 
 		 330 aa  91.7  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0963407  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35911  predicted protein  36.76 
 
 		 992 aa  85.9  0.000000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.3407  normal  0.878994 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05216  single-stranded DNA endonuclease (Eurofung)  36.03 
 
 		 1141 aa  77.4  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_3874  predicted protein  38.21 
 
 		 271 aa  73.2  0.000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.301307  normal  0.764914 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03035  5'-3' exonuclease and flap-endonuclease (Eurofung)  26.55 
 
 		 761 aa  70.9  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.799677 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03100  single-stranded DNA specific endodeoxyribonuclease, putative  40 
 
 		 1323 aa  69.3  0.00000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_46971  predicted protein  28.71 
 
 		 696 aa  61.6  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38848  predicted protein  37.74 
 
 		 552 aa  60.5  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03186  Rad2-like endonuclease, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G13260)  28.57 
 
 		 822 aa  55.8  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.861457 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08230  DNA polymerase I  27.38 
 
 		 885 aa  54.7  0.000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.919287 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1104  DNA polymerase I  27.17 
 
 		 912 aa  52.4  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2468  DNA polymerase I  27.9 
 
 		 873 aa  51.2  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.095823  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119559  Exodeoxyribonuclease I  24.88 
 
 		 701 aa  50.1  0.00006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2983  DNA polymerase I  35.71 
 
 		 892 aa  48.1  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33639  predicted protein  32.82 
 
 		 894 aa  48.1  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.224011  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC07150  5' flap endonuclease, putative  29.93 
 
 		 643 aa  47.8  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1504  DNA polymerase I  44.23 
 
 		 915 aa  47  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_5620  predicted protein  25.82 
 
 		 333 aa  45.4  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.469951  normal  0.0101798 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2673  DNA polymerase I  48.89 
 
 		 878 aa  44.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000968641  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2445  DNA polymerase I  25.59 
 
 		 877 aa  45.1  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1349  DNA polymerase I  27.46 
 
 		 924 aa  45.1  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38206  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20220  DNA polymerase I  39.58 
 
 		 901 aa  43.9  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.232173 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3657  DNA polymerase I  39.13 
 
 		 946 aa  43.9  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1509  DNA polymerase I  54 
 
 		 905 aa  43.1  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1226  DNA polymerase I  52.27 
 
 		 893 aa  43.1  0.008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.826859 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0765  DNA polymerase I  29.03 
 
 		 930 aa  43.1  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04860  DNA polymerase I  46.81 
 
 		 870 aa  42.7  0.009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029838  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  45.9 
 
 		 891 aa  42.7  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>