53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1913 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_1913  flap endonuclease-1  100 
 
 		 338 aa  689    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1212  flap endonuclease-1  65.09 
 
 		 338 aa  457  9.999999999999999e-129  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1634  flap endonuclease-1  54.73 
 
 		 336 aa  403  1e-111  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0490  flap structure-specific endonuclease  51.33 
 
 		 339 aa  378  1e-104  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0302  flap endonuclease-1  51.01 
 
 		 346 aa  348  1e-94  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0040  flap endonuclease-1  49.57 
 
 		 350 aa  339  5e-92  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1926  flap endonuclease-1  50.59 
 
 		 333 aa  338  7e-92  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2106  flap endonuclease-1  48.83 
 
 		 333 aa  325  7e-88  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1158  flap structure-specific endonuclease  48.86 
 
 		 351 aa  322  7e-87  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.146438  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0057  flap endonuclease-1  50.63 
 
 		 333 aa  319  3.9999999999999996e-86  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2117  flap endonuclease-1  47.41 
 
 		 346 aa  312  5.999999999999999e-84  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2521  flap endonuclease-1  48.24 
 
 		 333 aa  311  7.999999999999999e-84  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.239531  normal  0.701303 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0356  flap endonuclease-1  50.63 
 
 		 333 aa  311  1e-83  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0703  flap endonuclease-1  43.11 
 
 		 340 aa  308  8e-83  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0681  flap endonuclease-1  46.13 
 
 		 346 aa  302  5.000000000000001e-81  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.387412 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2348  flap endonuclease-1  47.28 
 
 		 346 aa  300  3e-80  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0196172 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1985  flap endonuclease-1  44.8 
 
 		 349 aa  291  1e-77  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1492  flap endonuclease-1  40.82 
 
 		 326 aa  255  7e-67  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.36701  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0558  flap endonuclease-1  41.64 
 
 		 324 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0280  flap endonuclease-1  41.64 
 
 		 324 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.969351  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0212  flap endonuclease-1  47.16 
 
 		 300 aa  252  6e-66  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.022826  decreased coverage  0.0048464 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1360  flap endonuclease-1  41.35 
 
 		 324 aa  251  1e-65  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.880498  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0426  flap endonuclease-1  39.45 
 
 		 341 aa  247  2e-64  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0623  flap endonuclease-1  39.59 
 
 		 324 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33791  predicted protein  35.31 
 
 		 381 aa  220  3e-56  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.561665  normal  0.280438 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02764  5' to 3' exonuclease, 5' flap endonuclease (Eurofung)  35.76 
 
 		 395 aa  219  7e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1081  flap structure-specific endonuclease  35.1 
 
 		 325 aa  208  1e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3231  flap structure-specific endonuclease  35.96 
 
 		 325 aa  205  8e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.151547  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2512  flap endonuclease-1  33.24 
 
 		 326 aa  204  2e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42373  predicted protein  35.76 
 
 		 389 aa  200  3e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.159065  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1613  flap endonuclease-1  34.82 
 
 		 325 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.817409  normal  0.647176 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2779  flap endonuclease-1  34.89 
 
 		 326 aa  193  4e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND01190  flap endonuclease, putative  39.68 
 
 		 453 aa  185  8e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48638  predicted protein  30.03 
 
 		 421 aa  168  1e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33450  5'-3' exonuclease  31.76 
 
 		 676 aa  97.4  3e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.167856 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35911  predicted protein  37.32 
 
 		 992 aa  92.4  1e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.3407  normal  0.878994 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03100  single-stranded DNA specific endodeoxyribonuclease, putative  38.93 
 
 		 1323 aa  80.9  0.00000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13915  predicted protein  24.4 
 
 		 330 aa  79.7  0.00000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0963407  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05216  single-stranded DNA endonuclease (Eurofung)  27.6 
 
 		 1141 aa  78.2  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_3874  predicted protein  36.59 
 
 		 271 aa  73.9  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.301307  normal  0.764914 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03035  5'-3' exonuclease and flap-endonuclease (Eurofung)  26.89 
 
 		 761 aa  72.4  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.799677 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33639  predicted protein  30 
 
 		 894 aa  69.7  0.00000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.224011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_5620  predicted protein  23.59 
 
 		 333 aa  61.2  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.469951  normal  0.0101798 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119559  Exodeoxyribonuclease I  25.38 
 
 		 701 aa  59.7  0.00000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_46971  predicted protein  25.56 
 
 		 696 aa  56.2  0.0000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC07150  5' flap endonuclease, putative  27.86 
 
 		 643 aa  53.9  0.000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02340  viral life cycle-related protein, putative  24.15 
 
 		 768 aa  52.8  0.000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46734  predicted protein  25.83 
 
 		 894 aa  50.4  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38848  predicted protein  34.88 
 
 		 552 aa  49.3  0.00009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03186  Rad2-like endonuclease, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G13260)  25 
 
 		 822 aa  45.8  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.861457 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3381  DNA polymerase I  31.08 
 
 		 1004 aa  45.1  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.30865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3109  DNA polymerase I  23.68 
 
 		 972 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3011  DNA polymerase I  23.68 
 
 		 972 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.664853  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>