47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0302 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0302  flap endonuclease-1  100 
 
 		 346 aa  701    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0490  flap structure-specific endonuclease  57.39 
 
 		 339 aa  386  1e-106  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1158  flap structure-specific endonuclease  53.85 
 
 		 351 aa  366  1e-100  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.146438  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0040  flap endonuclease-1  53.73 
 
 		 350 aa  358  6e-98  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1913  flap endonuclease-1  51.01 
 
 		 338 aa  348  1e-94  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2117  flap endonuclease-1  52.99 
 
 		 346 aa  341  1e-92  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0703  flap endonuclease-1  48.26 
 
 		 340 aa  340  2e-92  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0681  flap endonuclease-1  52.38 
 
 		 346 aa  335  5.999999999999999e-91  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.387412 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1212  flap endonuclease-1  48.99 
 
 		 338 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2348  flap endonuclease-1  51.5 
 
 		 346 aa  316  5e-85  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0196172 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1634  flap endonuclease-1  48.84 
 
 		 336 aa  315  7e-85  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1985  flap endonuclease-1  50.6 
 
 		 349 aa  310  2e-83  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1926  flap endonuclease-1  44.8 
 
 		 333 aa  301  1e-80  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2106  flap endonuclease-1  46.8 
 
 		 333 aa  300  3e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0212  flap endonuclease-1  55.67 
 
 		 300 aa  297  2e-79  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.022826  decreased coverage  0.0048464 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2521  flap endonuclease-1  44.77 
 
 		 333 aa  287  2e-76  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.239531  normal  0.701303 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0057  flap endonuclease-1  43.68 
 
 		 333 aa  279  5e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0356  flap endonuclease-1  41.88 
 
 		 333 aa  268  1e-70  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0426  flap endonuclease-1  43.98 
 
 		 341 aa  248  2e-64  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1492  flap endonuclease-1  38.73 
 
 		 326 aa  246  3e-64  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.36701  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1360  flap endonuclease-1  38.55 
 
 		 324 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.880498  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0280  flap endonuclease-1  38.66 
 
 		 324 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.969351  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0558  flap endonuclease-1  38.08 
 
 		 324 aa  243  5e-63  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0623  flap endonuclease-1  38.95 
 
 		 324 aa  236  3e-61  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33791  predicted protein  38.18 
 
 		 381 aa  217  2.9999999999999998e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.561665  normal  0.280438 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02764  5' to 3' exonuclease, 5' flap endonuclease (Eurofung)  37.2 
 
 		 395 aa  211  2e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42373  predicted protein  37.69 
 
 		 389 aa  203  4e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.159065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48638  predicted protein  32.89 
 
 		 421 aa  194  2e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01190  flap endonuclease, putative  42.68 
 
 		 453 aa  181  1e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1081  flap structure-specific endonuclease  36.31 
 
 		 325 aa  177  2e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3231  flap structure-specific endonuclease  35.38 
 
 		 325 aa  175  9.999999999999999e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.151547  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2512  flap endonuclease-1  32.66 
 
 		 326 aa  172  1e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2779  flap endonuclease-1  34.46 
 
 		 326 aa  163  4.0000000000000004e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1613  flap endonuclease-1  33.33 
 
 		 325 aa  156  5.0000000000000005e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.817409  normal  0.647176 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33450  5'-3' exonuclease  26.54 
 
 		 676 aa  78.6  0.0000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.167856 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13915  predicted protein  23.03 
 
 		 330 aa  77  0.0000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0963407  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03035  5'-3' exonuclease and flap-endonuclease (Eurofung)  26.92 
 
 		 761 aa  75.9  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.799677 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35911  predicted protein  27.39 
 
 		 992 aa  74.3  0.000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.3407  normal  0.878994 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03100  single-stranded DNA specific endodeoxyribonuclease, putative  37.72 
 
 		 1323 aa  67.4  0.0000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05216  single-stranded DNA endonuclease (Eurofung)  39.36 
 
 		 1141 aa  67.4  0.0000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_3874  predicted protein  32.87 
 
 		 271 aa  67  0.0000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.301307  normal  0.764914 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33639  predicted protein  25.21 
 
 		 894 aa  61.6  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.224011  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03186  Rad2-like endonuclease, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G13260)  22.63 
 
 		 822 aa  50.8  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.861457 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_46971  predicted protein  22.83 
 
 		 696 aa  49.3  0.00009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_5620  predicted protein  21.74 
 
 		 333 aa  48.9  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.469951  normal  0.0101798 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38848  predicted protein  32.99 
 
 		 552 aa  47.8  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119559  Exodeoxyribonuclease I  24.24 
 
 		 701 aa  46.6  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>