43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_33639 on replicon NC_009048
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009048  PICST_33639  predicted protein  100 
 
 		 894 aa  1827    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.224011  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03186  Rad2-like endonuclease, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G13260)  31.44 
 
 		 822 aa  92.8  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.861457 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_3874  predicted protein  34.68 
 
 		 271 aa  78.6  0.0000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.301307  normal  0.764914 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35911  predicted protein  35.9 
 
 		 992 aa  75.9  0.000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.3407  normal  0.878994 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0356  flap endonuclease-1  28 
 
 		 333 aa  71.2  0.00000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1913  flap endonuclease-1  30 
 
 		 338 aa  69.3  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03100  single-stranded DNA specific endodeoxyribonuclease, putative  34.17 
 
 		 1323 aa  68.9  0.0000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0623  flap endonuclease-1  27.94 
 
 		 324 aa  67  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0280  flap endonuclease-1  24.47 
 
 		 324 aa  64.7  0.000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.969351  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0558  flap endonuclease-1  24.47 
 
 		 324 aa  63.9  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1634  flap endonuclease-1  28.08 
 
 		 336 aa  63.9  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05216  single-stranded DNA endonuclease (Eurofung)  31.45 
 
 		 1141 aa  62.8  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2106  flap endonuclease-1  31.01 
 
 		 333 aa  63.2  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1360  flap endonuclease-1  24.47 
 
 		 324 aa  63.5  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.880498  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0302  flap endonuclease-1  25.21 
 
 		 346 aa  61.2  0.00000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0040  flap endonuclease-1  24.91 
 
 		 350 aa  60.1  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_46971  predicted protein  27.67 
 
 		 696 aa  60.1  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1492  flap endonuclease-1  26.27 
 
 		 326 aa  58.9  0.0000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.36701  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1926  flap endonuclease-1  26.46 
 
 		 333 aa  57  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1158  flap structure-specific endonuclease  30 
 
 		 351 aa  56.6  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.146438  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0490  flap structure-specific endonuclease  30.23 
 
 		 339 aa  56.2  0.000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03035  5'-3' exonuclease and flap-endonuclease (Eurofung)  25.85 
 
 		 761 aa  55.8  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.799677 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02764  5' to 3' exonuclease, 5' flap endonuclease (Eurofung)  25 
 
 		 395 aa  55.5  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33450  5'-3' exonuclease  22.42 
 
 		 676 aa  55.1  0.000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.167856 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0057  flap endonuclease-1  29.7 
 
 		 333 aa  55.5  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1613  flap endonuclease-1  29.03 
 
 		 325 aa  54.7  0.000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.817409  normal  0.647176 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0212  flap endonuclease-1  30.95 
 
 		 300 aa  53.1  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.022826  decreased coverage  0.0048464 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3231  flap structure-specific endonuclease  29.6 
 
 		 325 aa  50.4  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.151547  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2521  flap endonuclease-1  26.71 
 
 		 333 aa  50.8  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.239531  normal  0.701303 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2348  flap endonuclease-1  25.53 
 
 		 346 aa  50.8  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0196172 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1212  flap endonuclease-1  27.47 
 
 		 338 aa  50.8  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1081  flap structure-specific endonuclease  26.49 
 
 		 325 aa  50.1  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48638  predicted protein  25.09 
 
 		 421 aa  50.1  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1985  flap endonuclease-1  30.77 
 
 		 349 aa  48.5  0.0006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2117  flap endonuclease-1  32.82 
 
 		 346 aa  48.1  0.0008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46734  predicted protein  24.46 
 
 		 894 aa  47.4  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0681  flap endonuclease-1  31.34 
 
 		 346 aa  47.8  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.387412 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2512  flap endonuclease-1  26.4 
 
 		 326 aa  47  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2779  flap endonuclease-1  26.02 
 
 		 326 aa  47  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0703  flap endonuclease-1  24.24 
 
 		 340 aa  45.4  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33791  predicted protein  23.14 
 
 		 381 aa  45.4  0.005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.561665  normal  0.280438 
 
 
-
 
NC_006686  CND01190  flap endonuclease, putative  27.78 
 
 		 453 aa  45.1  0.006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13915  predicted protein  24.15 
 
 		 330 aa  44.7  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0963407  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>