More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene UUR10_0459 on replicon NC_011374
Organism: Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011374  UUR10_0459  Exo  100 
 
 		 289 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.454696  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1441  DNA polymerase I  40.59 
 
 		 850 aa  196  4.0000000000000005e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2415  DNA polymerase I  41.48 
 
 		 888 aa  194  2e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0701371 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2445  DNA polymerase I  36.07 
 
 		 877 aa  179  4e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0636  DNA polymerase I  39.86 
 
 		 911 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.2885  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1599  DNA polymerase I  38.58 
 
 		 883 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1403  DNA polymerase I  37.45 
 
 		 878 aa  173  2.9999999999999996e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2017  DNA polymerase I  35.76 
 
 		 866 aa  173  2.9999999999999996e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2156  DNA polymerase I  34.29 
 
 		 872 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1254  DNA polymerase I  38.55 
 
 		 876 aa  172  5e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0673  DNA polymerase I  34.52 
 
 		 903 aa  172  5e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.605668  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1612  DNA polymerase I  34.29 
 
 		 902 aa  172  7.999999999999999e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0886  DNA polymerase I  39.22 
 
 		 894 aa  171  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3272  DNA polymerase I  35.54 
 
 		 877 aa  170  3e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0345464  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2345  DNA polymerase I  34.1 
 
 		 895 aa  169  3e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1781  DNA polymerase I  37.87 
 
 		 876 aa  169  4e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1747  DNA polymerase I  37.87 
 
 		 876 aa  169  4e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.724051  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4697  DNA polymerase I  34.84 
 
 		 877 aa  169  7e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0439377  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2014  DNA polymerase I  35.59 
 
 		 875 aa  168  9e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000063172  unclonable  0.00000000000000410772 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl582  DNA polymerase I  35.79 
 
 		 895 aa  168  1e-40  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0335993  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0554  DNA polymerase A  35.79 
 
 		 903 aa  168  1e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.266566  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08230  DNA polymerase I  35.71 
 
 		 885 aa  168  1e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.919287 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2075  DNA polymerase I  35.56 
 
 		 896 aa  167  1e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000172322  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0227  DNA polymerase I  36.56 
 
 		 934 aa  167  2e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.774927  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2573  DNA polymerase I  34.04 
 
 		 892 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000431166  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1421  DNA polymerase I  35.84 
 
 		 896 aa  166  4e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0115482  hitchhiker  0.000000064495 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf613  5'-3' exonuclease, exo domain of DNA polymerase I  37.45 
 
 		 293 aa  166  5e-40  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2468  DNA polymerase I  36.19 
 
 		 873 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.095823  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04860  DNA polymerase I  35.15 
 
 		 870 aa  166  5.9999999999999996e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029838  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001917  DNA polymerase I  36.52 
 
 		 928 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000349897  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0541  DNA polymerase I  34.84 
 
 		 877 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.375796  hitchhiker  0.00000000000567935 
 
 
-
 
NC_002936  DET1391  DNA-directed DNA polymerase I  34.83 
 
 		 903 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.958554  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4417  DNA polymerase I  34.84 
 
 		 877 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1736  DNA polymerase I  33.68 
 
 		 879 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3185  fused DNA polymerase 5'->3' exonuclease and 3'->5' polymerase and 3'->5' exonuclease  34.97 
 
 		 938 aa  163  2.0000000000000002e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.994376  normal  0.149667 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4718  DNA polymerase I  34.15 
 
 		 877 aa  163  3e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4482  DNA polymerase I  34.15 
 
 		 891 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4317  DNA polymerase I  34.15 
 
 		 891 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4328  DNA polymerase I  34.15 
 
 		 891 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0713  DNA polymerase I  33.45 
 
 		 893 aa  163  4.0000000000000004e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4831  DNA polymerase I  34.15 
 
 		 877 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.318585  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1330  DNA polymerase I  35.29 
 
 		 879 aa  162  5.0000000000000005e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.17915  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4702  DNA polymerase I  34.15 
 
 		 877 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7101300000000004e-28 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1172  DNA-directed DNA polymerase I  34.74 
 
 		 903 aa  162  6e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.813063  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4712  DNA polymerase I  34.15 
 
 		 877 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.14352  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0389  DNA polymerase I  35.94 
 
 		 880 aa  161  9e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0087  DNA polymerase I  34.29 
 
 		 903 aa  161  1e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1012  5'-3' exonuclease, putative  34.15 
 
 		 292 aa  160  2e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.667651  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2673  DNA polymerase I  33.45 
 
 		 878 aa  160  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000968641  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0056  DNA polymerase I  34.71 
 
 		 935 aa  160  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0787  DNA polymerase I  33.69 
 
 		 876 aa  160  3e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0541  DNA polymerase I  35.16 
 
 		 908 aa  160  3e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0021  DNA polymerase I  33.92 
 
 		 932 aa  159  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00121039  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0023  DNA polymerase I  33.92 
 
 		 932 aa  159  4e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000103572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4195  DNA polymerase I  33.92 
 
 		 932 aa  159  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00580719  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2250  DNA polymerase I  35.07 
 
 		 866 aa  159  5e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.177355  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1500  5'-3' exonuclease  34.25 
 
 		 292 aa  159  5e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1529  5'-3' exonuclease  34.25 
 
 		 292 aa  159  5e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4887  DNA polymerase I  35.19 
 
 		 934 aa  159  6e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000312634  hitchhiker  0.0000015928 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0113  DNA polymerase I  35.48 
 
 		 896 aa  159  7e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00572  DNA polymerase I  35.49 
 
 		 930 aa  159  7e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1962  DNA polymerase I  35.07 
 
 		 866 aa  159  7e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0099  DNA polymerase I  35.48 
 
 		 896 aa  157  1e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4164  DNA polymerase I  33.69 
 
 		 928 aa  158  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0170728  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0194  DNA polymerase I  32.06 
 
 		 953 aa  157  2e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12990  DNA polymerase I  33.69 
 
 		 878 aa  157  2e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000153824  normal  0.116301 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1200  DNA polymerase I  33.45 
 
 		 903 aa  157  2e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0073  DNA polymerase I  34.96 
 
 		 926 aa  156  3e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.800167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2409  DNA polymerase I  34.86 
 
 		 934 aa  156  3e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078353  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1349  DNA polymerase I  33.1 
 
 		 924 aa  157  3e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38206  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2445  DNA polymerase I  32.5 
 
 		 917 aa  156  4e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4978  DNA polymerase I  33.1 
 
 		 936 aa  156  4e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4246  DNA polymerase I  34.29 
 
 		 928 aa  156  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000118244  normal  0.166094 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0765  DNA polymerase I  31.69 
 
 		 930 aa  155  6e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0540  DNA polymerase I  35.94 
 
 		 936 aa  155  6e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.560108  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4227  DNA polymerase I  34.27 
 
 		 929 aa  155  7e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0477521  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2534  DNA polymerase I  35.12 
 
 		 926 aa  154  2e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1104  DNA polymerase I  34.41 
 
 		 912 aa  154  2e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4517  DNA polymerase I  33.22 
 
 		 929 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21603  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4231  DNA polymerase I  34.52 
 
 		 928 aa  152  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000696994  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4281  DNA polymerase I  34.52 
 
 		 928 aa  152  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.729451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4327  DNA polymerase I  34.52 
 
 		 928 aa  152  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.44762 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4388  DNA polymerase I  34.52 
 
 		 928 aa  152  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00514081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2860  DNA polymerase I  34.94 
 
 		 912 aa  152  5.9999999999999996e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.129264  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03749  DNA polymerase I  33.93 
 
 		 928 aa  152  7e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000312835  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4123  DNA polymerase I  33.93 
 
 		 928 aa  152  7e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000018502  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4337  DNA polymerase I  33.93 
 
 		 928 aa  152  7e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000947993  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5306  DNA polymerase I  33.93 
 
 		 928 aa  152  7e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000330989  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03698  hypothetical protein  33.93 
 
 		 928 aa  152  7e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000500829  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4382  DNA polymerase I  33.93 
 
 		 928 aa  152  7e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000170331  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2025  DNA polymerase I  34.13 
 
 		 843 aa  152  7e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4088  DNA polymerase I  33.93 
 
 		 928 aa  152  7e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000478192  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4152  DNA polymerase I  33.93 
 
 		 928 aa  152  7e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000213441  hitchhiker  0.000146367 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1024  DNA polymerase I  34.7 
 
 		 868 aa  152  8e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4210  DNA polymerase I  34.52 
 
 		 928 aa  152  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0026674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1247  DNA polymerase I  35.32 
 
 		 888 aa  152  8.999999999999999e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00267055  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0568  DNA polymerase I  32.97 
 
 		 905 aa  151  1e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1220  ribonuclease H  33.22 
 
 		 484 aa  150  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0536  DNA polymerase I  37.07 
 
 		 946 aa  150  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1841  DNA polymerase I  36.19 
 
 		 885 aa  150  3e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>