More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_1529 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_1500  5'-3' exonuclease  100 
 
 		 292 aa  610  1e-173  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1529  5'-3' exonuclease  100 
 
 		 292 aa  610  1e-173  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1012  5'-3' exonuclease, putative  75.34 
 
 		 292 aa  481  1e-135  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.667651  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1316  5'-3' exonuclease  53.99 
 
 		 288 aa  318  7.999999999999999e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000236171  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1504  5'-3' exonuclease  53.45 
 
 		 288 aa  312  4.999999999999999e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1643  5'-3' exonuclease family protein  55.51 
 
 		 288 aa  310  2e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0209002  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1707  5'-3' exonuclease  55.51 
 
 		 288 aa  309  4e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00574418  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1675  5'-3' exonuclease family protein  55.12 
 
 		 288 aa  309  4e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1754  5'-3' exonuclease family protein  55.51 
 
 		 288 aa  309  4e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0435319  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3702  5'-3' exonuclease family protein  55.12 
 
 		 288 aa  309  5e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00175288  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1489  5'-3' exonuclease family protein  55.12 
 
 		 288 aa  308  5e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.145211  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1462  5'-3' exonuclease  55.12 
 
 		 288 aa  308  5e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0869981  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1606  5'-3' exonuclease family protein  55.12 
 
 		 288 aa  308  5e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.368882  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1461  5'-3' exonuclease  55.12 
 
 		 288 aa  308  5.9999999999999995e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2058  5'-3' exonuclease  51.19 
 
 		 292 aa  296  3e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.762247  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04860  DNA polymerase I  39.93 
 
 		 870 aa  216  2.9999999999999998e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029838  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4712  DNA polymerase I  39.1 
 
 		 877 aa  209  5e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.14352  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4702  DNA polymerase I  39.1 
 
 		 877 aa  209  5e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7101300000000004e-28 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4831  DNA polymerase I  39.1 
 
 		 877 aa  209  5e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.318585  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4697  DNA polymerase I  38.75 
 
 		 877 aa  208  7e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0439377  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4482  DNA polymerase I  38.75 
 
 		 891 aa  207  1e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4317  DNA polymerase I  38.75 
 
 		 891 aa  207  1e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4417  DNA polymerase I  38.41 
 
 		 877 aa  208  1e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4718  DNA polymerase I  38.75 
 
 		 877 aa  207  2e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4328  DNA polymerase I  38.75 
 
 		 891 aa  207  2e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0541  DNA polymerase I  38.41 
 
 		 877 aa  207  2e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.375796  hitchhiker  0.00000000000567935 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2017  DNA polymerase I  39.69 
 
 		 866 aa  205  8e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3272  DNA polymerase I  37.63 
 
 		 877 aa  204  2e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0345464  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2445  DNA polymerase I  40 
 
 		 877 aa  201  9.999999999999999e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2673  DNA polymerase I  35.2 
 
 		 878 aa  196  3e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000968641  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1254  DNA polymerase I  41.02 
 
 		 876 aa  196  4.0000000000000005e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2415  DNA polymerase I  38.74 
 
 		 888 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0701371 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0787  DNA polymerase I  35.69 
 
 		 876 aa  192  4e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1962  DNA polymerase I  42.41 
 
 		 866 aa  192  5e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2250  DNA polymerase I  42.02 
 
 		 866 aa  191  1e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.177355  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1747  DNA polymerase I  37.02 
 
 		 876 aa  190  2e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.724051  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1781  DNA polymerase I  37.02 
 
 		 876 aa  190  2e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl582  DNA polymerase I  35.74 
 
 		 895 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0335993  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0389  DNA polymerase I  38.91 
 
 		 880 aa  189  5.999999999999999e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1736  DNA polymerase I  38.52 
 
 		 879 aa  184  1.0000000000000001e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2345  DNA polymerase I  37.07 
 
 		 895 aa  183  3e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0360  DNA polymerase I  37.64 
 
 		 898 aa  183  3e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1599  DNA polymerase I  38.98 
 
 		 883 aa  183  4.0000000000000006e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2468  DNA polymerase I  38.13 
 
 		 873 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.095823  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1283  DNA polymerase I  36.33 
 
 		 893 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2966  DNA-directed DNA polymerase  35.83 
 
 		 901 aa  182  7e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2156  DNA polymerase I  32.56 
 
 		 872 aa  182  7e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1172  DNA polymerase I  35.94 
 
 		 893 aa  180  2e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1475  DNA polymerase I  34.52 
 
 		 893 aa  177  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2983  DNA polymerase I  35.86 
 
 		 892 aa  176  3e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5677  DNA polymerase I  36.25 
 
 		 905 aa  176  5e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.902906  normal  0.469276 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2043  DNA polymerase I  33.99 
 
 		 911 aa  175  7e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.307294 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1841  DNA polymerase I  37.4 
 
 		 885 aa  175  9e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1247  DNA polymerase I  38.7 
 
 		 888 aa  174  9.999999999999999e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00267055  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1441  DNA polymerase I  38.04 
 
 		 850 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0655  DNA polymerase I  33.91 
 
 		 944 aa  174  9.999999999999999e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2025  DNA polymerase I  34.75 
 
 		 843 aa  175  9.999999999999999e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3590  DNA polymerase I  37.4 
 
 		 936 aa  175  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120816 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1403  DNA polymerase I  37.01 
 
 		 878 aa  173  1.9999999999999998e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0536  DNA polymerase I  32.88 
 
 		 946 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3361  DNA polymerase I  35.06 
 
 		 909 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00788758  normal  0.41459 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2445  DNA polymerase I  35.1 
 
 		 917 aa  173  2.9999999999999996e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3564  DNA polymerase I  35.06 
 
 		 908 aa  172  7.999999999999999e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0954216  normal  0.139495 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3037  DNA polymerase I  35.04 
 
 		 902 aa  171  9e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000203838  normal  0.011117 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1621  DNA polymerase I  33.99 
 
 		 945 aa  171  1e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.924074 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2835  DNA polymerase I  35.55 
 
 		 893 aa  171  1e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333743  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0494  DNA polymerase I  35.41 
 
 		 950 aa  170  2e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.958979 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1421  DNA polymerase I  37.45 
 
 		 896 aa  170  2e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0115482  hitchhiker  0.000000064495 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3026  DNA polymerase I  35.06 
 
 		 929 aa  170  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.248484  normal  0.0929498 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0765  DNA polymerase I  35.46 
 
 		 930 aa  170  3e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0636  DNA polymerase I  34.72 
 
 		 911 aa  169  3e-41  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.2885  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3011  DNA polymerase I  35.06 
 
 		 920 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128275  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3057  DNA polymerase I  35.06 
 
 		 920 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.826907 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1024  DNA polymerase I  31.16 
 
 		 868 aa  169  6e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25960  DNA polymerase I  34.13 
 
 		 901 aa  169  7e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0077  DNA polymerase I  33.33 
 
 		 896 aa  168  8e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.586313  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0473  DNA polymerase I  31.83 
 
 		 943 aa  168  8e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3201  DNA polymerase I  33.99 
 
 		 912 aa  168  9e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2886  DNA polymerase I  33.72 
 
 		 949 aa  168  9e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.725232  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1349  DNA polymerase I  37.25 
 
 		 924 aa  168  1e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38206  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11645  DNA polymerase I  35.06 
 
 		 904 aa  167  2e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.693039 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0069  DNA polymerase I  37.94 
 
 		 953 aa  166  2.9999999999999998e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.512123  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1512  DNA polymerase I  37.65 
 
 		 972 aa  167  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.43872  normal  0.0397579 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1330  DNA polymerase I  36.82 
 
 		 879 aa  166  4e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.17915  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2075  DNA polymerase I  33.22 
 
 		 896 aa  165  6.9999999999999995e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000172322  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  30.98 
 
 		 891 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2798  DNA polymerase I  32.04 
 
 		 888 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1092  DNA polymerase I  34.83 
 
 		 932 aa  165  1.0000000000000001e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.416306  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0673  DNA polymerase I  36.23 
 
 		 903 aa  164  1.0000000000000001e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.605668  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2285  DNA polymerase I  36.08 
 
 		 1273 aa  164  2.0000000000000002e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.153285  hitchhiker  0.0000116157 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4423  DNA polymerase I  34.51 
 
 		 1016 aa  163  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2534  DNA polymerase I  34.78 
 
 		 926 aa  163  3e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  34.11 
 
 		 891 aa  163  3e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3450  DNA polymerase I  36.59 
 
 		 931 aa  163  3e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf613  5'-3' exonuclease, exo domain of DNA polymerase I  34.22 
 
 		 293 aa  163  3e-39  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0850  DNA polymerase I  30.85 
 
 		 982 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0300789 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0713  DNA polymerase I  39.41 
 
 		 893 aa  162  5.0000000000000005e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0346  DNA polymerase I  31.47 
 
 		 892 aa  162  6e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.335360000000001e-24 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0540  DNA polymerase I  32.14 
 
 		 936 aa  162  6e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.560108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4103  DNA polymerase I  33.85 
 
 		 999 aa  162  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>