273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp1616 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp1616  hypothetical protein  100 
 
 		 191 aa  385  1e-106  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1611  hypothetical protein  96.86 
 
 		 191 aa  377  1e-104  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2178  YceI family protein  43.48 
 
 		 188 aa  125  5e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5251  YceI family protein  42.07 
 
 		 192 aa  114  8.999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1935  YceI family protein  38.29 
 
 		 191 aa  113  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.321555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1027  YceI family protein  37.65 
 
 		 193 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4487  YceI family protein  39.1 
 
 		 441 aa  110  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1204  YceI  37.28 
 
 		 421 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4402  YceI family protein  39.16 
 
 		 190 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.426674 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0470  YceI family protein  37.5 
 
 		 193 aa  107  9.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3506  YceI family protein  37.95 
 
 		 192 aa  106  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790188 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3996  hypothetical protein  37.08 
 
 		 187 aa  104  9e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.29888  normal  0.350257 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3579  YceI family protein  38.69 
 
 		 196 aa  101  7e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.948947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0705  YceI family protein  35.96 
 
 		 187 aa  100  9e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.587119  normal  0.613914 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3507  hypothetical protein  35 
 
 		 194 aa  100  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.317049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2227  YceI family protein  35.19 
 
 		 190 aa  99.4  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000482548  decreased coverage  0.00464038 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0682  YceI family protein  36.94 
 
 		 186 aa  98.6  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5859  YceI family protein  32.94 
 
 		 191 aa  97.8  8e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0458  YceI family protein  32.93 
 
 		 190 aa  97.8  9e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0231  YceI  36.94 
 
 		 186 aa  97.8  9e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0733061  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0715  YceI family protein  36.94 
 
 		 186 aa  97.8  9e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3803  hypothetical protein  32.8 
 
 		 186 aa  97.4  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3201  YceI family protein  35.19 
 
 		 186 aa  97.1  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.484936 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2670  YceI family protein  36.31 
 
 		 186 aa  95.9  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.415789  normal  0.822376 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1030  hypothetical protein  34.18 
 
 		 186 aa  96.3  3e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.103898  normal  0.0258647 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3683  YceI  34.03 
 
 		 192 aa  96.3  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.579212  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1711  YceI  32.9 
 
 		 420 aa  95.9  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.811721  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2321  YceI  32.32 
 
 		 191 aa  95.1  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01687  YceI like family  31.84 
 
 		 189 aa  94.7  6e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.740504  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3153  YceI  30.52 
 
 		 183 aa  94  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0885591  normal  0.570024 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2817  YceI  31.49 
 
 		 190 aa  93.2  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4184  YceI family protein  32.1 
 
 		 193 aa  93.2  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2065  hypothetical protein  29.1 
 
 		 191 aa  92.8  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.257216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1272  YceI-like family protein  37.58 
 
 		 207 aa  91.3  7e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2381  hypothetical protein  33.89 
 
 		 186 aa  90.5  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.481751  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0296  hypothetical protein  33.89 
 
 		 186 aa  90.5  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3369  hypothetical protein  36.94 
 
 		 186 aa  89.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3335  YceI  36.94 
 
 		 186 aa  89.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0606  YceI family protein  36.31 
 
 		 186 aa  90.1  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2718  signal peptide protein  32.1 
 
 		 189 aa  89.4  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.495901  normal  0.071315 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3378  YceI, base-induced periplasmic protein  36.94 
 
 		 207 aa  89.4  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2566  hypothetical protein  36.94 
 
 		 186 aa  89.7  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1860  YceI family protein  31.48 
 
 		 186 aa  89.4  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1158  hypothetical protein  36.94 
 
 		 186 aa  89.7  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0685  hypothetical protein  30.94 
 
 		 189 aa  89  4e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0630  YceI family protein  35.67 
 
 		 186 aa  88.6  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0602  YceI family protein  30.39 
 
 		 189 aa  87.8  8e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3540  YceI  31.02 
 
 		 185 aa  87  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3045  YceI family protein  35.48 
 
 		 190 aa  87.4  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2954  hypothetical protein  30.46 
 
 		 191 aa  87.4  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.247116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2962  YceI family protein  30.25 
 
 		 190 aa  84.7  8e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0295  cytochrome b561  30.36 
 
 		 416 aa  84  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0256942  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2552  YceI family protein  31.33 
 
 		 190 aa  84  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.370741  normal  0.285953 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2795  YceI  31.71 
 
 		 184 aa  83.6  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.772608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2531  YceI family protein  32.28 
 
 		 187 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.990271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  31.43 
 
 		 177 aa  80.1  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1520  YceI family protein  28.26 
 
 		 192 aa  78.2  0.00000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0333  YceI family protein  31.76 
 
 		 199 aa  73.9  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.192845  normal  0.888817 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0089  YceI family protein  28.02 
 
 		 184 aa  73.2  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  29.65 
 
 		 201 aa  72.4  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1870  YceI family protein  33.57 
 
 		 182 aa  70.5  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0076574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2184  putative cytochrome B561  30.81 
 
 		 400 aa  70.9  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2036  YceI family protein  32.54 
 
 		 195 aa  69.3  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460798 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3508  periplasmic protein  32.35 
 
 		 196 aa  68.6  0.00000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.234261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2217  YceI family protein  32.61 
 
 		 199 aa  66.6  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0275332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2283  YceI family protein  31.25 
 
 		 189 aa  67  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0832  YceI family protein  28.97 
 
 		 182 aa  65.5  0.0000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.261869  hitchhiker  0.00246548 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1049  cytochrome B561  30.41 
 
 		 410 aa  65.1  0.0000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.183438  normal  0.102385 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0457  YceI family protein  31.15 
 
 		 189 aa  63.9  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1859  YceI family protein  36.07 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1400  cytochrome B561  29.75 
 
 		 397 aa  63.5  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.687205 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3505  YceI family protein  35.33 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.781833 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0955  YceI family protein  28.96 
 
 		 186 aa  62.4  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03182  signal peptide protein  29.68 
 
 		 195 aa  61.6  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.173698  normal  0.294176 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3389  YceI family protein  28.49 
 
 		 193 aa  61.6  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.013479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4409  YceI family protein  28.57 
 
 		 177 aa  61.6  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1028  YceI family protein  33.33 
 
 		 191 aa  61.2  0.000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1281  YceI family protein  27.43 
 
 		 184 aa  61.2  0.000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2226  YceI family protein  36.61 
 
 		 192 aa  61.2  0.000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000678562  decreased coverage  0.00447323 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2233  YceI family protein  28.29 
 
 		 199 aa  60.8  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.329585  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2493  YceI family protein  35.56 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3826  YceI  28.07 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3889  YceI family protein  26.79 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0543172  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5860  YceI family protein  31.2 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3690  YceI family protein  29.17 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.442684  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3499  YceI family protein  34.46 
 
 		 179 aa  59.7  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0890239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1988  YceI family protein  26.44 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0903  YceI family protein  27.38 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.150803  normal  0.443368 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2066  hypothetical protein  27.74 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0648985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0382  hypothetical protein  28.49 
 
 		 180 aa  59.3  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0621265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0366  YceI family protein  26.09 
 
 		 189 aa  59.3  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3578  YceI family protein  33.59 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.728206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2816  YceI  31.87 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1745  cytochrome B561  26.67 
 
 		 406 aa  58.5  0.00000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.399847  normal  0.227689 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0815  hypothetical protein  31.5 
 
 		 197 aa  58.2  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.090251 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  27.01 
 
 		 214 aa  57.8  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3967  YceI family protein  26.19 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0780  hypothetical protein  32.79 
 
 		 196 aa  57  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.263048  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0912  YceI  29.89 
 
 		 188 aa  57  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.580537  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0612  YceI family protein  26.54 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0392069  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>