284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl1611 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006369  lpl1611  hypothetical protein  100 
 
 
191 aa  386  1e-106  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1616  hypothetical protein  96.86 
 
 
191 aa  377  1e-104  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2178  YceI family protein  42.86 
 
 
188 aa  124  8.000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5251  YceI family protein  42.68 
 
 
192 aa  115  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1935  YceI family protein  39.13 
 
 
191 aa  112  4.0000000000000004e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.321555  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4402  YceI family protein  40.36 
 
 
190 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.426674 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1204  YceI  36.69 
 
 
421 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1027  YceI family protein  37.04 
 
 
193 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4487  YceI family protein  37.58 
 
 
441 aa  109  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3506  YceI family protein  38.55 
 
 
192 aa  108  4.0000000000000004e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.790188 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0470  YceI family protein  36.88 
 
 
193 aa  107  7.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3996  hypothetical protein  35.67 
 
 
187 aa  103  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.29888  normal  0.350257 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3507  hypothetical protein  35.62 
 
 
194 aa  102  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.317049  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2227  YceI family protein  35.8 
 
 
190 aa  101  6e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000482548  decreased coverage  0.00464038 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3579  YceI family protein  38.1 
 
 
196 aa  100  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.948947  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0705  YceI family protein  34.5 
 
 
187 aa  99.8  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.587119  normal  0.613914 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5859  YceI family protein  30.69 
 
 
191 aa  99.4  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0682  YceI family protein  36.31 
 
 
186 aa  98.6  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424973  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1030  hypothetical protein  34.81 
 
 
186 aa  98.6  5e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.103898  normal  0.0258647 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3201  YceI family protein  35.19 
 
 
186 aa  98.6  5e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.484936 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1711  YceI  32.9 
 
 
420 aa  98.2  7e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.811721  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3803  hypothetical protein  33.52 
 
 
186 aa  97.4  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3683  YceI  34.03 
 
 
192 aa  97.4  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.579212  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0458  YceI family protein  32.34 
 
 
190 aa  97.4  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0231  YceI  36.31 
 
 
186 aa  97.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0733061  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0715  YceI family protein  36.31 
 
 
186 aa  97.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2817  YceI  32.04 
 
 
190 aa  95.5  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2670  YceI family protein  35.67 
 
 
186 aa  95.5  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.415789  normal  0.822376 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2321  YceI  32.93 
 
 
191 aa  95.1  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4184  YceI family protein  32.72 
 
 
193 aa  95.1  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2381  hypothetical protein  34.44 
 
 
186 aa  94  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.481751  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1272  YceI-like family protein  38.22 
 
 
207 aa  94  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2065  hypothetical protein  28.57 
 
 
191 aa  94.4  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.257216  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0296  hypothetical protein  34.44 
 
 
186 aa  94  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3153  YceI  30.52 
 
 
183 aa  92.4  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0885591  normal  0.570024 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01687  YceI like family  33.33 
 
 
189 aa  92.4  4e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.740504  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3335  YceI  37.58 
 
 
186 aa  92  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3369  hypothetical protein  37.58 
 
 
186 aa  92  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3378  YceI, base-induced periplasmic protein  37.58 
 
 
207 aa  92  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2566  hypothetical protein  37.58 
 
 
186 aa  92  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1158  hypothetical protein  37.58 
 
 
186 aa  92  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0606  YceI family protein  35.67 
 
 
186 aa  90.5  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2718  signal peptide protein  31.48 
 
 
189 aa  90.1  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.495901  normal  0.071315 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2954  hypothetical protein  31.9 
 
 
191 aa  90.1  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.247116  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3045  YceI family protein  36.13 
 
 
190 aa  90.1  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1860  YceI family protein  30.86 
 
 
186 aa  89  4e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0630  YceI family protein  35.03 
 
 
186 aa  88.6  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0685  hypothetical protein  33.11 
 
 
189 aa  88.6  5e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0295  cytochrome b561  31.76 
 
 
416 aa  88.2  6e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0256942  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3540  YceI  33.76 
 
 
185 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0602  YceI family protein  32.45 
 
 
189 aa  87.4  1e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2962  YceI family protein  29.63 
 
 
190 aa  85.1  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2552  YceI family protein  30.72 
 
 
190 aa  84  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.370741  normal  0.285953 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2795  YceI  31.71 
 
 
184 aa  83.6  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.772608  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1520  YceI family protein  28.8 
 
 
192 aa  82  0.000000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  32 
 
 
177 aa  81.6  0.000000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2531  YceI family protein  31.65 
 
 
187 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.990271  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0089  YceI family protein  30 
 
 
184 aa  77.4  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0333  YceI family protein  31.4 
 
 
199 aa  76.3  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.192845  normal  0.888817 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  30.23 
 
 
201 aa  73.9  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2184  putative cytochrome B561  30.81 
 
 
400 aa  71.2  0.000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2036  YceI family protein  31.31 
 
 
195 aa  69.7  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.460798 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3508  periplasmic protein  34.12 
 
 
196 aa  70.5  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.234261  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2283  YceI family protein  31.94 
 
 
189 aa  69.3  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1870  YceI family protein  32.87 
 
 
182 aa  68.9  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0076574  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2217  YceI family protein  33.33 
 
 
199 aa  67  0.0000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0275332  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1049  cytochrome B561  31.08 
 
 
410 aa  66.6  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.183438  normal  0.102385 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3389  YceI family protein  29.05 
 
 
193 aa  65.9  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.013479  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03182  signal peptide protein  30.32 
 
 
195 aa  65.1  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.173698  normal  0.294176 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1859  YceI family protein  36.89 
 
 
192 aa  65.1  0.0000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0955  YceI family protein  28.42 
 
 
186 aa  64.7  0.0000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3505  YceI family protein  35.33 
 
 
191 aa  63.9  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.781833 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2066  hypothetical protein  29.03 
 
 
192 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0648985  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5860  YceI family protein  32.8 
 
 
192 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3499  YceI family protein  34.46 
 
 
179 aa  62.8  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0890239  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1400  cytochrome B561  29.75 
 
 
397 aa  62.4  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.687205 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2233  YceI family protein  28.95 
 
 
199 aa  62.4  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.329585  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1028  YceI family protein  34.01 
 
 
191 aa  62.4  0.000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1281  YceI family protein  27.43 
 
 
184 aa  61.6  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2226  YceI family protein  36.61 
 
 
192 aa  61.6  0.000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000678562  decreased coverage  0.00447323 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0832  YceI family protein  27.59 
 
 
182 aa  61.2  0.000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.261869  hitchhiker  0.00246548 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0903  YceI family protein  27.98 
 
 
209 aa  60.5  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.150803  normal  0.443368 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0457  YceI family protein  31.15 
 
 
189 aa  60.8  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2493  YceI family protein  35.56 
 
 
201 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3690  YceI family protein  27.71 
 
 
190 aa  60.1  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.442684  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1988  YceI family protein  27.01 
 
 
196 aa  60.1  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0612  YceI family protein  27.78 
 
 
205 aa  60.5  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0392069  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3736  YceI  29.17 
 
 
218 aa  59.7  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.192641 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0382  hypothetical protein  28.49 
 
 
180 aa  59.3  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0621265  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3578  YceI family protein  33.59 
 
 
192 aa  59.3  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.728206  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4409  YceI family protein  27.68 
 
 
177 aa  58.9  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4183  YceI family protein  29.6 
 
 
192 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3826  YceI  27.49 
 
 
201 aa  58.9  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1745  cytochrome B561  27.33 
 
 
406 aa  58.9  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.399847  normal  0.227689 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2531  YceI family protein  25.15 
 
 
186 aa  58.9  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.178135 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0366  YceI family protein  26.09 
 
 
189 aa  58.5  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  27.01 
 
 
214 aa  58.5  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0963  YceI family protein  27.98 
 
 
213 aa  58.2  0.00000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00574961 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03910  YceI like family  30.07 
 
 
254 aa  58.2  0.00000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3889  YceI family protein  26.99 
 
 
201 aa  58.2  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0543172  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>