More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_0743 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_3686  putative phage integrase  99.02 
 
 		 322 aa  211  2.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0743  phage integrase family site specific recombinase  100 
 
 		 102 aa  209  7.999999999999999e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0710  integrase family protein  75 
 
 		 324 aa  166  7e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0810  putative phage integrase  100 
 
 		 49 aa  100  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0163  phage integrase family site specific recombinase  100 
 
 		 48 aa  98.2  3e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000123199 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4117  integrase family protein  53.26 
 
 		 337 aa  98.6  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.944065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0401  integrase family protein  53.26 
 
 		 337 aa  98.2  4e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.663201  normal  0.0314633 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4048  integrase family protein  47.92 
 
 		 343 aa  89.4  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.900099 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4797  phage integrase  45.65 
 
 		 308 aa  86.7  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1421  Phage integrase  39.18 
 
 		 468 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.602834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4434  phage integrase family site specific recombinase  39.56 
 
 		 427 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4530  phage integrase family site specific recombinase  38.71 
 
 		 449 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51650  putative integrase  39.56 
 
 		 426 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000506916  hitchhiker  0.0000630791 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3356  phage integrase family protein  52.94 
 
 		 352 aa  80.1  0.000000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36590  phage integrase  38.71 
 
 		 415 aa  77.8  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.706618  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0001  integrase  43.33 
 
 		 265 aa  70.1  0.000000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4162  integrase family protein  50 
 
 		 396 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0787  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E-like protein  46.43 
 
 		 320 aa  50.8  0.000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.00453269  unclonable  0.000000000000100471 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1201  phage integrase  44.64 
 
 		 301 aa  50.4  0.000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0529826  normal  0.150621 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0758  phage integrase family protein  42.86 
 
 		 304 aa  49.7  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000222973  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0435  integrase family protein  36.14 
 
 		 299 aa  49.7  0.00001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0722  phage integrase family protein  41.38 
 
 		 306 aa  49.7  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0599364 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0128  site-specific tyrosine recombinase XerC  43.1 
 
 		 303 aa  49.3  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.742386  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1732  integrase/recombinase XerD  36.49 
 
 		 308 aa  48.9  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1654  integrase family protein  41.54 
 
 		 298 aa  48.9  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  33.73 
 
 		 305 aa  49.3  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2436  tyrosine recombinase XerD  42.19 
 
 		 305 aa  48.9  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.578966 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1962  phage integrase family site specific recombinase  37.1 
 
 		 642 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000374969 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00307  site-specific tyrosine recombinase XerC  43.1 
 
 		 313 aa  48.5  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5040  phage integrase  37.5 
 
 		 732 aa  48.5  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.346055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4150  integrase family protein  36.23 
 
 		 373 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.333103 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2391  site-specific tyrosine recombinase XerC  43.1 
 
 		 311 aa  48.9  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0010  tyrosine recombinase XerC  40 
 
 		 299 aa  48.5  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002113  tyrosine recombinase XerC  43.1 
 
 		 310 aa  48.9  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5516  phage integrase  37.5 
 
 		 734 aa  48.1  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0248661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0485  site-specific tyrosine recombinase XerC  43.1 
 
 		 322 aa  48.1  0.00004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.853028 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0381  tyrosine recombinase XerD  40.68 
 
 		 303 aa  47.8  0.00005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2147  phage integrase  32.56 
 
 		 411 aa  47.4  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3532  phage integrase  32.56 
 
 		 411 aa  47.4  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.346968  normal  0.212487 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2175  tyrosine recombinase XerD  40.91 
 
 		 299 aa  47.4  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  45.83 
 
 		 294 aa  47.4  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0492  phage integrase family site specific recombinase  41.07 
 
 		 294 aa  46.6  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0248661  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0590  tyrosine recombinase XerD  39.53 
 
 		 306 aa  46.6  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12908  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.65 
 
 		 298 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000436053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15230  site-specific tyrosine recombinase XerD  38.33 
 
 		 316 aa  46.2  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0614301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  40.68 
 
 		 381 aa  46.2  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0341  tyrosine recombinase XerC  44.9 
 
 		 317 aa  45.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000100724  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11988  putative tyrosine recombinase  40.98 
 
 		 298 aa  45.8  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0772  phage integrase  37.66 
 
 		 304 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0359  tyrosine recombinase XerD  45.28 
 
 		 290 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00723526 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0285  tyrosine recombinase XerC  43.75 
 
 		 302 aa  45.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0478  integrase family protein  44.68 
 
 		 312 aa  46.2  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  41.67 
 
 		 293 aa  45.4  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2241  integrase family protein  34 
 
 		 345 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.640527  hitchhiker  0.000757999 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1317  phage integrase family protein  42.11 
 
 		 325 aa  45.4  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1466  Tn554-related, transposase A  34.31 
 
 		 370 aa  45.4  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000354684  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1178  integrase family protein  34.48 
 
 		 329 aa  45.4  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.801835  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0724  integrase family protein  48.98 
 
 		 308 aa  45.4  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.971464 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0082  site-specific tyrosine recombinase XerC  39.66 
 
 		 339 aa  45.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.472951  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1689  integrase family protein  47.83 
 
 		 292 aa  45.1  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0836065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3042  tyrosine recombinase XerD subunit  39.29 
 
 		 294 aa  45.4  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000138339  normal  0.959316 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  41.67 
 
 		 293 aa  45.4  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3442  phage integrase  32.39 
 
 		 337 aa  45.1  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0989  integrase family protein  37.93 
 
 		 292 aa  45.1  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0618431 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0083  site-specific tyrosine recombinase XerC  42.11 
 
 		 322 aa  45.4  0.0003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2497  integrase family protein  30.34 
 
 		 308 aa  45.1  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1266  tyrosine recombinase XerD  39.06 
 
 		 310 aa  45.4  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1455  integrase family protein  39.66 
 
 		 365 aa  44.7  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11080  phage integrase family protein  37.04 
 
 		 310 aa  44.7  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0105178  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2702  site-specific recombinase  38.6 
 
 		 299 aa  44.7  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2241  integrase family protein  35.21 
 
 		 296 aa  44.3  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000667129 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11170  site-specific recombinase XerD  37.5 
 
 		 336 aa  44.7  0.0005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0225756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4359  integrase family protein  42.31 
 
 		 336 aa  44.7  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0728  site-specific tyrosine recombinase XerC  42.31 
 
 		 330 aa  44.3  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.442089  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2982  integrase family protein  42.31 
 
 		 336 aa  44.7  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4385  integrase family protein  42.31 
 
 		 336 aa  44.7  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1217  integrase family protein  42.31 
 
 		 336 aa  44.7  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4135  site-specific tyrosine recombinase XerC  39.66 
 
 		 300 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.383086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19920  tyrosine recombinase XerD  46.94 
 
 		 317 aa  44.3  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.210765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1971  tyrosine recombinase XerD subunit  44.9 
 
 		 309 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000860406  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4524  Phage integrase  43.28 
 
 		 310 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2102  integrase family protein  36.67 
 
 		 304 aa  44.3  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.167189  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14190  tyrosine recombinase XerD  42.86 
 
 		 321 aa  44.3  0.0006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.127512  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1695  phage integrase family protein  35.21 
 
 		 296 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.363626  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3445  integrase family protein  37.74 
 
 		 304 aa  44.3  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3398  integrase  37.74 
 
 		 293 aa  43.9  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.292469  normal  0.438437 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1241  tyrosine recombinase XerD  42.86 
 
 		 311 aa  43.9  0.0007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.657845  normal  0.578091 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2210  integrase family protein  36.84 
 
 		 295 aa  43.9  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000241024 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0052  site-specific tyrosine recombinase XerC  38.33 
 
 		 329 aa  43.9  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.578512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15290  tyrosine recombinase XerD subunit  42.86 
 
 		 332 aa  43.9  0.0008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.203953  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1902  phage integrase  44 
 
 		 293 aa  43.9  0.0008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.162765  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00070  putative site-specific recombinase  37.93 
 
 		 295 aa  43.9  0.0008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1179  site-specific tyrosine recombinase XerC  38.46 
 
 		 450 aa  43.9  0.0008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000142279  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4967  integrase family protein  36.36 
 
 		 495 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.617968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0817  tyrosine recombinase XerD  46.43 
 
 		 305 aa  43.9  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.763193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1133  integrase family protein  41.18 
 
 		 299 aa  43.9  0.0008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1560  tyrosine recombinase XerD  37.93 
 
 		 331 aa  43.9  0.0008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.736869  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3583  phage integrase  37.93 
 
 		 385 aa  43.5  0.0009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0727  tyrosine recombinase XerD  48.89 
 
 		 304 aa  43.5  0.0009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.689003 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2797  tyrosine recombinase XerD  41.82 
 
 		 298 aa  43.5  0.0009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal  0.205647 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>