More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B4797 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011149  SeAg_B4797  phage integrase  100 
 
 		 308 aa  643    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0710  integrase family protein  41.29 
 
 		 324 aa  258  1e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3686  putative phage integrase  41.61 
 
 		 322 aa  244  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0401  integrase family protein  36.86 
 
 		 337 aa  224  1e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.663201  normal  0.0314633 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3356  phage integrase family protein  37.97 
 
 		 352 aa  223  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36590  phage integrase  38.11 
 
 		 415 aa  222  6e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.706618  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4434  phage integrase family site specific recombinase  40.26 
 
 		 427 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4117  integrase family protein  36.22 
 
 		 337 aa  221  9.999999999999999e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.944065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4048  integrase family protein  38.41 
 
 		 343 aa  221  9.999999999999999e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.900099 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51650  putative integrase  39.94 
 
 		 426 aa  219  3e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000506916  hitchhiker  0.0000630791 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1421  Phage integrase  38.89 
 
 		 468 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.602834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0001  integrase  41.54 
 
 		 265 aa  206  6e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4530  phage integrase family site specific recombinase  36.98 
 
 		 449 aa  202  6e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60140  xerD-like putative integrase  38.93 
 
 		 306 aa  171  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000287702  hitchhiker  0.00000000219898 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0743  phage integrase family site specific recombinase  45.65 
 
 		 102 aa  86.7  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0762  phage integrase family protein  25.97 
 
 		 287 aa  69.7  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3587  integrase family protein  26.1 
 
 		 304 aa  68.9  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  decreased coverage  0.00000000515843  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2844  integrase family protein  23.78 
 
 		 329 aa  66.2  0.0000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  25.82 
 
 		 293 aa  64.7  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0772  phage integrase  25.08 
 
 		 304 aa  62.8  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0795  phage integrase family protein  22.48 
 
 		 283 aa  62.4  0.000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39510  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.76 
 
 		 298 aa  62  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1439  integrase family protein  24.72 
 
 		 317 aa  61.6  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.110569  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1360  integrase/recombinase  22.7 
 
 		 306 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6099899999999998e-31 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16040  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.43 
 
 		 298 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3445  integrase family protein  25.7 
 
 		 304 aa  62  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0370  phage integrase family protein  24.89 
 
 		 304 aa  62  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0492  phage integrase family site specific recombinase  24.58 
 
 		 294 aa  61.6  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0248661  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  26.09 
 
 		 293 aa  61.2  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0818  tyrosine recombinase XerC  26.38 
 
 		 296 aa  60.8  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.368613  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0738  integrase/recombinase  29.09 
 
 		 340 aa  61.6  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.42 
 
 		 301 aa  61.2  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1381  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.45 
 
 		 298 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00360913  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3212  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.27 
 
 		 311 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1971  tyrosine recombinase XerD subunit  26.54 
 
 		 309 aa  60.5  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000860406  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0726  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.66 
 
 		 333 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.218987  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1227  integrase family protein  23.1 
 
 		 305 aa  60.1  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.842173  decreased coverage  0.000216705 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2483  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.94 
 
 		 299 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000855714  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1996  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.15 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  25 
 
 		 299 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  25 
 
 		 299 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0924  phage integrase family protein  26.35 
 
 		 294 aa  60.1  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.852644  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.94 
 
 		 299 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0712  integrase family protein  23.72 
 
 		 285 aa  59.3  0.00000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00227312  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3042  tyrosine recombinase XerD subunit  29.11 
 
 		 294 aa  58.9  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000138339  normal  0.959316 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0262  integrase family protein  23.33 
 
 		 291 aa  58.5  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1349  integrase family protein  27.52 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.58 
 
 		 299 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1067  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.66 
 
 		 305 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1025  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.44 
 
 		 298 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.899371  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0750  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.66 
 
 		 311 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1316  integrase/recombinase  22.26 
 
 		 306 aa  57.8  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.718184  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.58 
 
 		 299 aa  57.4  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1337  tyrosine recombinase XerC  26.8 
 
 		 298 aa  57.4  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0149085  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0184  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.64 
 
 		 303 aa  57.4  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.72736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0279  phage integrase family protein  26.13 
 
 		 282 aa  57.4  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.033075  hitchhiker  0.000013626 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1312  tyrosine recombinase XerC  26.8 
 
 		 298 aa  57.4  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.199373  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0737  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.88 
 
 		 316 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.088128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.58 
 
 		 299 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0240  tyrosine recombinase XerC subunit  26.97 
 
 		 291 aa  57.4  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.295303  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2127  tyrosine recombinase XerD  29.03 
 
 		 308 aa  57  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0523  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.05 
 
 		 315 aa  57  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.221654  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1478  integrase/recombinase XerD  22.44 
 
 		 298 aa  57  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0755097  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3682  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.58 
 
 		 299 aa  57  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.58 
 
 		 299 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0369  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.32 
 
 		 305 aa  57  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1286  site-specific tyrosine recombinase XerD  21.67 
 
 		 298 aa  57  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0511461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2240  Phage integrase  25.16 
 
 		 406 aa  57  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.58 
 
 		 299 aa  57  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391393  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0023  integrase family protein  23.99 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0669  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.32 
 
 		 305 aa  57  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2504  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.32 
 
 		 329 aa  57  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3892  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.08 
 
 		 299 aa  57  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.413643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0911  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.32 
 
 		 333 aa  57  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0118  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.32 
 
 		 333 aa  57  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.412982  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0537  tyrosine recombinase XerD subunit  29.52 
 
 		 302 aa  56.6  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1185  tyrosine recombinase XerD  23.4 
 
 		 310 aa  56.6  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.497096  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1948  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.27 
 
 		 318 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2559  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.27 
 
 		 318 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3796  phage integrase family protein  27.24 
 
 		 304 aa  56.6  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2583  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.27 
 
 		 318 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6131  integrase family protein  25.16 
 
 		 305 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0914  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.32 
 
 		 333 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.1246  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0235  integrase family protein  28.31 
 
 		 289 aa  56.2  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2378  tyrosine recombinase XerD  23.18 
 
 		 296 aa  56.2  0.0000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3396  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.1 
 
 		 298 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0562  integrase/recombinase  24.67 
 
 		 308 aa  56.2  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0843058  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2241  integrase family protein  27.85 
 
 		 345 aa  56.2  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.640527  hitchhiker  0.000757999 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1390  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.7 
 
 		 328 aa  56.2  0.0000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000179914  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0722  phage integrase family protein  23.79 
 
 		 306 aa  56.2  0.0000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0599364 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4168  tyrosine recombinase XerC  22.76 
 
 		 298 aa  55.8  0.0000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4177  site-specific tyrosine recombinase XerC  22.76 
 
 		 298 aa  55.8  0.0000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0208532 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4036  site-specific tyrosine recombinase XerC  22.76 
 
 		 298 aa  55.8  0.0000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4196  site-specific tyrosine recombinase XerC  22.76 
 
 		 298 aa  55.8  0.0000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0689633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2329  tyrosine recombinase XerD  27.92 
 
 		 277 aa  55.8  0.0000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00235896  normal  0.0350779 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4271  site-specific tyrosine recombinase XerC  22.76 
 
 		 298 aa  55.8  0.0000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  25.34 
 
 		 290 aa  55.8  0.0000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4330  site-specific tyrosine recombinase XerC  22.76 
 
 		 298 aa  55.8  0.0000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  23.83 
 
 		 295 aa  55.8  0.0000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03636  hypothetical protein  22.57 
 
 		 298 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.487194  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>