More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1178 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_1178  integrase family protein  100 
 
 		 329 aa  624  1e-178  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.801835  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23640  tyrosine recombinase XerC subunit  61.36 
 
 		 310 aa  338  8e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.154193  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1481  integrase family protein  60 
 
 		 308 aa  291  1e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.141471  normal  0.0727308 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3245  phage integrase family protein  54.72 
 
 		 312 aa  285  7e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.676462  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2509  integrase family protein  56.23 
 
 		 380 aa  284  1.0000000000000001e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.593152  normal  0.73908 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2207  site-specific tyrosine recombinase XerC  55.41 
 
 		 319 aa  283  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.787262  normal  0.257716 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2471  tyrosine recombinase XerC subunit  52.73 
 
 		 308 aa  278  8e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0340389  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2210  integrase family protein  53.72 
 
 		 295 aa  276  4e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000241024 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1990  site-specific tyrosine recombinase XerC  54.88 
 
 		 300 aa  273  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2036  site-specific tyrosine recombinase XerC  54.88 
 
 		 300 aa  273  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0541579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1970  site-specific tyrosine recombinase XerC  54.88 
 
 		 300 aa  273  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.397741 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0251  site-specific tyrosine recombinase XerC  44.38 
 
 		 355 aa  267  2e-70  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00631913  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4135  site-specific tyrosine recombinase XerC  53 
 
 		 300 aa  266  5e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.383086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1317  phage integrase family protein  51.6 
 
 		 325 aa  265  1e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0674  site-specific tyrosine recombinase XerC  54.07 
 
 		 303 aa  259  4e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12908  site-specific tyrosine recombinase XerC  56.08 
 
 		 298 aa  259  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000436053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2194  integrase family protein  47.78 
 
 		 317 aa  255  6e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09860  tyrosine recombinase XerC subunit  47.4 
 
 		 329 aa  255  9e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0485  site-specific tyrosine recombinase XerC  41.61 
 
 		 322 aa  254  1.0000000000000001e-66  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.853028 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3995  integrase family protein  56.03 
 
 		 311 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2102  integrase family protein  52.16 
 
 		 304 aa  240  2e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.167189  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1654  integrase family protein  51.82 
 
 		 298 aa  240  2.9999999999999997e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3115  integrase family protein  50 
 
 		 336 aa  238  1e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0082342  normal  0.151412 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0989  integrase family protein  49.16 
 
 		 292 aa  238  2e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0618431 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10100  site-specific recombinase XerD  48.26 
 
 		 332 aa  235  6e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0235  integrase family protein  53.22 
 
 		 289 aa  235  9e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5914  integrase family protein  49.84 
 
 		 325 aa  234  1.0000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000658468  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11170  site-specific recombinase XerD  45.78 
 
 		 336 aa  227  2e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0225756  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09270  tyrosine recombinase XerC subunit  47.83 
 
 		 346 aa  224  1e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.111586  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1208  integrase family protein  46.57 
 
 		 363 aa  220  1.9999999999999999e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1159  integrase family protein  50 
 
 		 344 aa  219  6e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.226555 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1001  integrase family protein  46.36 
 
 		 333 aa  218  1e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  35.64 
 
 		 307 aa  215  9.999999999999999e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  35.64 
 
 		 307 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  35.97 
 
 		 307 aa  210  3e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1547  phage integrase family protein  45.95 
 
 		 336 aa  204  2e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.268843 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0478  integrase family protein  41.78 
 
 		 312 aa  203  4e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3583  phage integrase  46.87 
 
 		 385 aa  202  9e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  36.51 
 
 		 298 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  36.04 
 
 		 302 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  32.67 
 
 		 295 aa  196  5.000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1202  tyrosine recombinase XerC  44.33 
 
 		 304 aa  196  6e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.910177  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  35.39 
 
 		 302 aa  194  1e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  35.39 
 
 		 302 aa  194  1e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2695  tyrosine recombinase XerC  42.39 
 
 		 342 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.400065  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3715  integrase family protein  39.34 
 
 		 298 aa  194  2e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  40.07 
 
 		 332 aa  192  6e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0967  integrase family protein  39.2 
 
 		 373 aa  192  9e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  41.89 
 
 		 295 aa  191  1e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2788  tyrosine recombinase XerC  42.17 
 
 		 343 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0114244  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2881  tyrosine recombinase XerC  42.17 
 
 		 343 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.312354  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2375  tyrosine recombinase XerD  39.87 
 
 		 324 aa  191  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.973456  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0063  tyrosine recombinase XerC  42.3 
 
 		 304 aa  190  2e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2391  site-specific tyrosine recombinase XerC  37.03 
 
 		 311 aa  189  5e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  36.48 
 
 		 294 aa  188  1e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09590  tyrosine recombinase XerD  36.69 
 
 		 302 aa  187  2e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0503565 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0235  Integrase  37.18 
 
 		 308 aa  187  2e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.386202  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  34.56 
 
 		 296 aa  187  3e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0476  tyrosine recombinase XerD  37.25 
 
 		 302 aa  187  3e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  36.84 
 
 		 295 aa  186  5e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002113  tyrosine recombinase XerC  35.96 
 
 		 310 aa  184  1.0000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  36.27 
 
 		 290 aa  185  1.0000000000000001e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  40.27 
 
 		 294 aa  184  2.0000000000000003e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08760  tyrosine recombinase XerD  37.16 
 
 		 309 aa  184  2.0000000000000003e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.940341  unclonable  0.00000000128305 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5431  tyrosine recombinase XerD  44.04 
 
 		 299 aa  183  3e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.060431  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0574  integrase family protein  38.54 
 
 		 304 aa  182  9.000000000000001e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000663621  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2497  integrase family protein  35.81 
 
 		 308 aa  181  1e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0341  tyrosine recombinase XerC  39.74 
 
 		 317 aa  181  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000100724  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.67 
 
 		 299 aa  181  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2942  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.01 
 
 		 318 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00307  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.96 
 
 		 313 aa  180  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2986  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.01 
 
 		 318 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0222  integrase/recombinase XerC  37.84 
 
 		 299 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2821  tyrosine recombinase XerD  40.82 
 
 		 313 aa  180  2.9999999999999997e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.346068  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2957  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.01 
 
 		 318 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271721  normal  0.636956 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  32.67 
 
 		 295 aa  180  4e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2689  tyrosine recombinase XerC  40.76 
 
 		 311 aa  179  4e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.147909 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0452  tyrosine recombinase XerC subunit  36.86 
 
 		 335 aa  180  4e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.577676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2105  tyrosine recombinase XerD  37.58 
 
 		 297 aa  179  4.999999999999999e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.179497  hitchhiker  0.00877552 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2346  tyrosine recombinase XerC  37 
 
 		 302 aa  179  7e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126195  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.55 
 
 		 296 aa  178  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3090  tyrosine recombinase XerD  39.88 
 
 		 320 aa  178  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1971  tyrosine recombinase XerD subunit  36.99 
 
 		 309 aa  178  1e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000860406  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.1 
 
 		 296 aa  178  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.77 
 
 		 296 aa  177  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.77 
 
 		 296 aa  177  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.55 
 
 		 296 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.55 
 
 		 296 aa  177  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0185  site-specific tyrosine recombinase XerC  37.84 
 
 		 299 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.55 
 
 		 296 aa  177  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.55 
 
 		 296 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0727  tyrosine recombinase XerD  33.66 
 
 		 304 aa  177  2e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.689003 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3474  site-specific tyrosine recombinase XerC  39.53 
 
 		 296 aa  177  2e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.486058 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.77 
 
 		 296 aa  177  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.55 
 
 		 296 aa  177  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1932  tyrosine recombinase XerD  42.86 
 
 		 310 aa  177  2e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3281  site-specific tyrosine recombinase XerD  40.69 
 
 		 317 aa  177  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.77 
 
 		 296 aa  177  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2483  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.22 
 
 		 299 aa  176  4e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000855714  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.89 
 
 		 299 aa  176  4e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>