More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2632 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0249  extracellular solute-binding protein  56.13 
 
 		 670 aa  658    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4214  extracellular solute-binding protein family 5  59.97 
 
 		 631 aa  743    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.159532  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0387  extracellular solute-binding protein family 5  55.37 
 
 		 637 aa  666    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.111911  normal  0.651599 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0288  extracellular solute-binding protein  64.55 
 
 		 631 aa  781    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0342  extracellular solute-binding protein  55.54 
 
 		 637 aa  667    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4446  extracellular solute-binding protein family 5  53.29 
 
 		 610 aa  644    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.215863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4132  extracellular solute-binding protein family 5  53.63 
 
 		 610 aa  646    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3639  extracellular solute-binding protein  55.25 
 
 		 641 aa  679    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.294463  normal  0.053682 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0514  extracellular solute-binding protein family 5  58.11 
 
 		 617 aa  704    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.772903  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0421  extracellular solute-binding protein family 5  56.02 
 
 		 641 aa  666    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.427516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1770  extracellular solute-binding protein  61.12 
 
 		 635 aa  745    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.235807  normal  0.035612 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3729  extracellular solute-binding protein  60.7 
 
 		 605 aa  748    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7055  oligopeptide ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  61.08 
 
 		 614 aa  755    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0391894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3535  twin-arginine translocation pathway signal  61.54 
 
 		 631 aa  736    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.10202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0378  extracellular solute-binding protein  63.46 
 
 		 659 aa  797    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.296975  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1616  extracellular solute-binding protein  59.15 
 
 		 621 aa  699    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.320311 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2632  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 638 aa  1305    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.267737 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0015  extracellular solute-binding protein  51.88 
 
 		 622 aa  632  1e-180  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.440164  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3366  extracellular solute-binding protein  53.74 
 
 		 619 aa  627  1e-178  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0244  ABC transporter substrate binding protein (peptide)  50.91 
 
 		 631 aa  616  1e-175  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0010  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  49.92 
 
 		 622 aa  611  1e-173  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.427067  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0010  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  50.91 
 
 		 610 aa  608  1e-173  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3166  extracellular solute-binding protein  49.16 
 
 		 615 aa  544  1e-153  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2274  extracellular solute-binding protein  48.97 
 
 		 600 aa  545  1e-153  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0180  extracellular solute-binding protein family 5  48.8 
 
 		 607 aa  540  9.999999999999999e-153  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0115715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3472  extracellular solute-binding protein  47.15 
 
 		 611 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3719  extracellular solute-binding protein  47.39 
 
 		 611 aa  533  1e-150  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0280101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4084  extracellular solute-binding protein  47.04 
 
 		 622 aa  534  1e-150  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1538  extracellular solute-binding protein  48.71 
 
 		 609 aa  531  1e-149  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2181  extracellular solute-binding protein  47.66 
 
 		 613 aa  531  1e-149  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2060  extracellular solute-binding protein  47.4 
 
 		 615 aa  529  1e-149  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163136  normal  0.391933 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4147  peptide ABC transporter, periplamic peptide-binding protein  47.31 
 
 		 611 aa  527  1e-148  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1718  extracellular solute-binding protein  47.49 
 
 		 611 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.359306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3486  ABC transporter periplasmic binding protein  47.07 
 
 		 615 aa  520  1e-146  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1348  extracellular solute-binding protein family 5  46.11 
 
 		 603 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0798387  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41130  putative binding protein component of ABC transporter  46.55 
 
 		 615 aa  515  1e-144  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0597  extracellular solute-binding protein  44.96 
 
 		 633 aa  510  1e-143  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1758  extracellular solute-binding protein  47.33 
 
 		 618 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.316004  normal  0.0569954 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3717  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  46.18 
 
 		 618 aa  504  1e-141  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29650  oligopeptide ABC transporter, periplasmic substrate binding protein  46.11 
 
 		 613 aa  503  1e-141  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000703906  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0289  ABC transporter extracellular solute-binding protein  43.85 
 
 		 606 aa  479  1e-134  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1946  extracellular solute-binding protein  44.75 
 
 		 611 aa  480  1e-134  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.185407  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0448  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  41.56 
 
 		 628 aa  456  1e-127  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0189227  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37880  putative binding protein component of ABC transporter  42.46 
 
 		 602 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00173754  normal  0.230207 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0535  putative peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  42.39 
 
 		 611 aa  448  1.0000000000000001e-124  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0393  extracellular solute-binding protein family 5  42.88 
 
 		 658 aa  435  1e-121  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.305694  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3471  extracellular solute-binding protein  40.91 
 
 		 609 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.640162  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4146  peptide ABC transporter, periplamic peptide-binding protein  40.91 
 
 		 609 aa  433  1e-120  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2711  ABC transporter, periplamic substrate-binding protein  41.19 
 
 		 602 aa  432  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1497  ABC transporter periplamic substrate-binding protein  41.36 
 
 		 602 aa  434  1e-120  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0248  extracellular solute-binding protein  42.01 
 
 		 626 aa  432  1e-120  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1719  extracellular solute-binding protein  40.91 
 
 		 646 aa  433  1e-120  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.244782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2786  extracellular solute-binding protein  41.36 
 
 		 602 aa  435  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.426757  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3718  extracellular solute-binding protein  40.91 
 
 		 590 aa  431  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.357391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0845  extracellular solute-binding protein  41.52 
 
 		 638 aa  430  1e-119  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0910462 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3640  extracellular solute-binding protein  41.56 
 
 		 615 aa  431  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.133111 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3093  extracellular solute-binding protein  39.42 
 
 		 640 aa  431  1e-119  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311181 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2633  extracellular solute-binding protein  42.4 
 
 		 629 aa  426  1e-118  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.350381  normal  0.525149 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1615  extracellular solute-binding protein  39.21 
 
 		 627 aa  424  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.316028 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2182  extracellular solute-binding protein  40.72 
 
 		 610 aa  421  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3716  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  40.37 
 
 		 609 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1759  extracellular solute-binding protein  40.37 
 
 		 609 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.358749  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0515  extracellular solute-binding protein family 5  40.2 
 
 		 626 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3246  extracellular solute-binding protein  40.85 
 
 		 602 aa  418  9.999999999999999e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.645009  normal  0.0170676 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2061  extracellular solute-binding protein  39.39 
 
 		 616 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.409615  normal  0.170665 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7054  oligopeptide ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  40.03 
 
 		 614 aa  418  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.334122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0289  extracellular solute-binding protein  39.37 
 
 		 632 aa  415  1e-114  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0422  extracellular solute-binding protein family 5  40.16 
 
 		 625 aa  413  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.175563  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29640  oligopeptide ABC transporter, periplasmic substrate binding protein  39.01 
 
 		 609 aa  409  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.113024  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0576  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  40.65 
 
 		 615 aa  410  1e-113  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1645  extracellular solute-binding protein family 5  38.94 
 
 		 602 aa  411  1e-113  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.819399  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0379  extracellular solute-binding protein  39.37 
 
 		 628 aa  412  1e-113  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0542  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  40.65 
 
 		 616 aa  409  1.0000000000000001e-112  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1916  extracellular solute-binding protein family 5  39.11 
 
 		 602 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0655  ABC peptide transporter  39.36 
 
 		 633 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1917  extracellular solute-binding protein family 5  38.23 
 
 		 601 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.530573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2153  extracellular solute-binding protein  40.17 
 
 		 597 aa  409  1.0000000000000001e-112  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.453344 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1397  extracellular solute-binding protein  39.46 
 
 		 606 aa  404  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.982775  normal  0.886089 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3914  extracellular solute-binding protein family 5  38.95 
 
 		 630 aa  404  1e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2773  extracellular solute-binding protein  39.55 
 
 		 600 aa  403  1e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2453  extracellular solute-binding protein  39.32 
 
 		 601 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.958299  hitchhiker  0.000003014 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2456  extracellular solute-binding protein  39.32 
 
 		 601 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2365  extracellular solute-binding protein  39.32 
 
 		 601 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0436387  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3728  extracellular solute-binding protein  38.83 
 
 		 621 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1733  extracellular solute-binding protein family 5  38.01 
 
 		 600 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.197004 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2567  extracellular solute-binding protein  39.32 
 
 		 601 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00156108 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3534  extracellular solute-binding protein  38.68 
 
 		 626 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.173833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2410  extracellular solute-binding protein  39.32 
 
 		 601 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115101 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2336  extracellular solute-binding protein family 5  38.26 
 
 		 603 aa  397  1e-109  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3638  extracellular solute-binding protein  39.97 
 
 		 592 aa  397  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1771  extracellular solute-binding protein  38.35 
 
 		 625 aa  396  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.235807  normal  0.0344403 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1412  extracellular solute-binding protein  39.47 
 
 		 619 aa  393  1e-108  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.902569 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3485  putative solute-binding protein  37.34 
 
 		 626 aa  395  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2370  ABC transporter substrate binding protein (peptide)  38.53 
 
 		 615 aa  395  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0014  extracellular solute-binding protein  39.11 
 
 		 615 aa  394  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.498204  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41110  putative solute-binding protein  38.23 
 
 		 609 aa  394  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2902  extracellular solute-binding protein  39.59 
 
 		 622 aa  392  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.19921  normal  0.272453 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1014  extracellular solute-binding protein family 5  38.96 
 
 		 628 aa  390  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.517437  normal  0.0342428 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3315  ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  37.74 
 
 		 604 aa  389  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.644955  normal  0.133502 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2326  ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  37.91 
 
 		 604 aa  392  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00440714 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>