More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2576 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2576  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 139 aa  284  4e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.289994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0443  endoribonuclease L-PSP  64.93 
 
 		 139 aa  191  4e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6178  hypothetical protein  64.18 
 
 		 140 aa  189  1e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2388  endoribonuclease L-PSP  64.18 
 
 		 145 aa  189  1e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71200  YjgF family translation initiation inhibitor  64.18 
 
 		 140 aa  189  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2961  endoribonuclease L-PSP  64.39 
 
 		 138 aa  188  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.211045  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5405  endoribonuclease L-PSP  64.66 
 
 		 149 aa  187  2.9999999999999997e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0585911 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2200  endoribonuclease L-PSP  62.88 
 
 		 138 aa  186  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.162776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7080  endoribonuclease L-PSP  63.91 
 
 		 145 aa  185  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0944873 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6423  endoribonuclease L-PSP  63.91 
 
 		 145 aa  185  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.954317 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5674  endoribonuclease L-PSP  63.16 
 
 		 145 aa  184  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.171739  normal  0.201016 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2046  L-PSP family endoribonuclease  61.94 
 
 		 136 aa  184  3e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3031  endoribonuclease L-PSP  62.69 
 
 		 144 aa  184  3e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00544929  normal  0.808496 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2347  endoribonuclease L-PSP  62.12 
 
 		 138 aa  184  3e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.977249 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6992  endoribonuclease L-PSP  63.91 
 
 		 145 aa  184  4e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.615821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2367  Endoribonuclease L-PSP  62.6 
 
 		 145 aa  183  5e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.308002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6043  endoribonuclease L-PSP  62.41 
 
 		 145 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0143152  hitchhiker  0.000408683 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3267  endoribonuclease L-PSP  60.15 
 
 		 138 aa  179  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.431089  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3465  hypothetical protein  60.15 
 
 		 145 aa  176  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.589893 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1663  Endoribonuclease L-PSP  61.31 
 
 		 140 aa  174  4e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.526711  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0376  Endoribonuclease L-PSP  61.03 
 
 		 149 aa  173  7e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3227  endoribonuclease L-PSP  61.03 
 
 		 140 aa  170  5.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.841476  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3574  endoribonuclease L-PSP  60.98 
 
 		 130 aa  168  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4515  endoribonuclease L-PSP  58.65 
 
 		 137 aa  160  7e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1855  endoribonuclease L-PSP  52.94 
 
 		 141 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.570502  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3456  endoribonuclease L-PSP  54.48 
 
 		 138 aa  144  4.0000000000000006e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.962591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  36.09 
 
 		 129 aa  78.6  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3991  Endoribonuclease L-PSP  40.78 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79301  normal  0.524999 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4700  endoribonuclease L-PSP  35.51 
 
 		 136 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0915  endoribonuclease L-PSP  34.58 
 
 		 140 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4587  endoribonuclease L-PSP  30.43 
 
 		 134 aa  67  0.00000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0320417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4213  endoribonuclease L-PSP  30.6 
 
 		 137 aa  67.4  0.00000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.381709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4178  endoribonuclease L-PSP  34.58 
 
 		 136 aa  66.6  0.00000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.18793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3893  Endoribonuclease L-PSP  30.71 
 
 		 134 aa  66.2  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5488  endoribonuclease L-PSP  36.45 
 
 		 140 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.236112 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3572  endoribonuclease L-PSP  36.45 
 
 		 140 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.800436  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4795  endoribonuclease L-PSP  36.45 
 
 		 140 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3282  endoribonuclease L-PSP  40.95 
 
 		 126 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.925015  normal  0.517573 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3257  endoribonuclease L-PSP  38.14 
 
 		 128 aa  64.7  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3876  Endoribonuclease L-PSP  34.58 
 
 		 127 aa  64.7  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.873675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0512  endoribonuclease L-PSP  37.74 
 
 		 135 aa  63.9  0.0000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3867  endoribonuclease L-PSP  37.14 
 
 		 129 aa  63.9  0.0000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0282  Endoribonuclease L-PSP  36.19 
 
 		 128 aa  63.2  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0662893  normal  0.101063 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2374  endoribonuclease L-PSP  44.12 
 
 		 132 aa  62.4  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0617  Endoribonuclease L-PSP  30.48 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4670  endoribonuclease L-PSP  36.52 
 
 		 146 aa  61.6  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.758014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0958  endoribonuclease L-PSP  36.51 
 
 		 127 aa  62  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.678542 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0561  endoribonuclease L-PSP  33.01 
 
 		 133 aa  61.6  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3547  hypothetical protein  35.87 
 
 		 113 aa  61.2  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.7424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1821  endoribonuclease L-PSP  28.12 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.589735 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6151  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase and related beta-hydroxyacid dehydrogenase-like protein  32.43 
 
 		 402 aa  61.6  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0200858 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1171  endoribonuclease L-PSP  33.64 
 
 		 136 aa  60.5  0.000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0637  putative endoribonuclease L-PSP  36.17 
 
 		 128 aa  60.1  0.000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0604  endoribonuclease L-PSP  31.25 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.312968  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1053  L-PSP family endoribonuclease  31.25 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0450372  normal  0.0141038 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0543  L-PSP family endoribonuclease  31.25 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1821  endoribonuclease L-PSP  34.62 
 
 		 128 aa  60.1  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.623023  normal  0.012204 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2506  endoribonuclease L-PSP  31.19 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0850215  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2691  endoribonuclease L-PSP  31.19 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.65572  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0853  endoribonuclease L-PSP  31.2 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.287208 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3938  Endoribonuclease L-PSP  29.01 
 
 		 133 aa  59.3  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.014328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4068  endoribonuclease L-PSP  35.85 
 
 		 405 aa  59.3  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.611141  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0997  endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2706  putative endoribonuclease L-PSP  30.77 
 
 		 131 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000241959 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2467  endoribonuclease L-PSP  30.77 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000783764  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1252  Endoribonuclease L-PSP  30.91 
 
 		 128 aa  57.8  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1470  endoribonuclease L-PSP  34.31 
 
 		 129 aa  58.2  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4692  endoribonuclease L-PSP  40.19 
 
 		 126 aa  58.2  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00762  endoribonuclease L-PSP family protein  34.62 
 
 		 127 aa  57.8  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2408  hypothetical protein  36.27 
 
 		 128 aa  57.8  0.00000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0314271  normal  0.0494567 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2009  endoribonuclease  32.54 
 
 		 125 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.634719  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02363  endoribonuclease L-PSP, putative  36.08 
 
 		 126 aa  57.8  0.00000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2372  endoribonuclease L-PSP  31.78 
 
 		 127 aa  57.8  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.675716  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1155  endoribonuclease L-PSP family protein  36.54 
 
 		 127 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2599  putative endoribonuclease L-PSP  32.04 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000321897 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2756  putative endoribonuclease L-PSP  30.77 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00188195  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0935  Endoribonuclease L-PSP  32 
 
 		 128 aa  57  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1109  endoribonuclease L-PSP  30.91 
 
 		 128 aa  57  0.00000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2710  putative endoribonuclease L-PSP  31.73 
 
 		 131 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2496  endoribonuclease, inhibits protein synthesis  31.73 
 
 		 135 aa  57  0.00000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.591272  normal  0.661186 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2726  endoribonuclease L-PSP, putative  30.77 
 
 		 131 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000401402  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1816  endoribonuclease L-PSP  30.84 
 
 		 129 aa  57  0.00000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0684  Endoribonuclease L-PSP  38.78 
 
 		 131 aa  56.6  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4240  endoribonuclease L-PSP  34.31 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.209705 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2099  endoribonuclease L-PSP  31.53 
 
 		 394 aa  56.2  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0409826  normal  0.132893 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2689  endoribonuclease, putative  33.33 
 
 		 123 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331269  normal  0.266918 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6129  endoribonuclease L-PSP  30.77 
 
 		 117 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.409916  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3231  Endoribonuclease L-PSP  34.58 
 
 		 130 aa  55.5  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2299  Endoribonuclease L-PSP  38 
 
 		 126 aa  55.5  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4550  endoribonuclease L-PSP  31.2 
 
 		 128 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326313  normal  0.946176 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3052  endoribonuclease L-PSP  31.97 
 
 		 130 aa  55.5  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.66028 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0362  putative endoribonuclease L-PSP  32.71 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02800  Endoribonuclease L-PSP family protein  34.38 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140231  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0414  Endoribonuclease L-PSP  35.29 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0954621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3436  YjgF-like protein  31.78 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3980  endoribonuclease L-PSP  31.73 
 
 		 129 aa  55.1  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.370858 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1241  endoribonuclease L-PSP  34.38 
 
 		 130 aa  55.1  0.0000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.81003  normal  0.1674 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2553  hypothetical protein  33.33 
 
 		 100 aa  54.7  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.254874 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4917  Endoribonuclease L-PSP  35.4 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.51623  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1439  endoribonuclease L-PSP  36.19 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.534154  normal  0.776942 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>