More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001068 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_001068  vibrioferrin receptor PvuA  100 
 
 		 712 aa  1467    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0049  TonB-dependent siderophore receptor  63.22 
 
 		 703 aa  919    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.627674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0609  TonB-dependent siderophore receptor  50.28 
 
 		 710 aa  716    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1280  TonB-dependent siderophore receptor  58.72 
 
 		 731 aa  852    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0800812  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3142  TonB-dependent siderophore receptor  49.28 
 
 		 688 aa  666    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3851  TonB-dependent siderophore receptor  50.81 
 
 		 711 aa  705    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3090  ferric vibrioferrin receptor  45.73 
 
 		 690 aa  593  1e-168  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0290295  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09350  TonB-dependent siderophore receptor  44.24 
 
 		 704 aa  589  1e-167  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01932  TonB-dependent outer membrane Receptor  42.56 
 
 		 713 aa  564  1.0000000000000001e-159  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4787  TonB-dependent siderophore receptor  41.61 
 
 		 696 aa  523  1e-147  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0722  TonB-dependent siderophore receptor  41.72 
 
 		 675 aa  513  1e-144  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.534189 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4613  outer membrane iron(III) dicitrate receptor  32.52 
 
 		 774 aa  343  5.999999999999999e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4596  TonB-dependent siderophore receptor  32.38 
 
 		 774 aa  341  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3231  TonB-dependent siderophore receptor  33.38 
 
 		 687 aa  335  2e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.854124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5807  ferric citrate outer membrane transporter  32.01 
 
 		 717 aa  325  1e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04157  ferric citrate outer membrane transporter  31.4 
 
 		 774 aa  320  6e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04120  hypothetical protein  31.4 
 
 		 774 aa  320  6e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3709  TonB-dependent siderophore receptor  31.27 
 
 		 774 aa  319  1e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0483354  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4868  iron(III) dicitrate transport protein FecA  31.4 
 
 		 774 aa  319  1e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1038  TonB-dependent siderophore receptor  32.46 
 
 		 782 aa  318  3e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0743  TonB-dependent siderophore receptor  31.13 
 
 		 774 aa  317  3e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.689224  normal  0.515767 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5806  ferric citrate outer membrane transporter  32.58 
 
 		 731 aa  316  9.999999999999999e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0923  TonB-dependent siderophore receptor  31.65 
 
 		 777 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13430  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  32.64 
 
 		 784 aa  313  5.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1207  iron(III) dicitrate transport protein fecA  31.25 
 
 		 782 aa  313  6.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1204  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  32.59 
 
 		 784 aa  312  1e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.814963  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47190  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  31.59 
 
 		 784 aa  308  3e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2308  TonB-dependent siderophore receptor  32.32 
 
 		 693 aa  299  1e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00270239  normal  0.034674 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1853  TonB-dependent receptor  30.9 
 
 		 721 aa  295  2e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80471  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21730  putative TonB-dependent receptor  31.4 
 
 		 721 aa  295  3e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4646  TonB-dependent siderophore receptor  30.48 
 
 		 708 aa  288  2e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5169  TonB-dependent siderophore receptor  31.62 
 
 		 723 aa  287  5e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3784  TonB-dependent siderophore receptor  31.65 
 
 		 807 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.894959 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2453  TonB-dependent siderophore receptor  32.25 
 
 		 720 aa  275  3e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.591762  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0867  FecA-like outer membrane receptor  30.77 
 
 		 809 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.272294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0911  TonB-dependent siderophore receptor  30.49 
 
 		 809 aa  270  7e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.11228 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0897  TonB-dependent siderophore receptor  30.63 
 
 		 809 aa  270  8.999999999999999e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.448435  normal  0.28892 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4311  TonB-dependent siderophore receptor  30.25 
 
 		 809 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0939329 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0865  TonB-dependent receptor  27.7 
 
 		 700 aa  175  2.9999999999999996e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0848071  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02035  outer membrane iron(III) dicitrate receptor  26.25 
 
 		 705 aa  174  3.9999999999999995e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1512  TonB-dependent receptor  25.3 
 
 		 782 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.116652 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0445  TonB-dependent receptor  24.02 
 
 		 734 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.000342866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0713  TonB-dependent receptor  23.84 
 
 		 729 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000508975  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0590  putative TonB-dependent receptor protein  23.85 
 
 		 737 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000188689  decreased coverage  0.000190482 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3787  TonB-dependent receptor  24.42 
 
 		 751 aa  129  3e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000153626  decreased coverage  0.00000099878 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3399  TonB-dependent receptor  24.54 
 
 		 727 aa  127  9e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.186836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0630  TonB-dependent receptor  24.54 
 
 		 727 aa  126  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0349605  normal  0.294722 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3888  TonB-dependent receptor  24.59 
 
 		 730 aa  121  4.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000154411  decreased coverage  0.00438264 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0818  TonB-dependent receptor, plug  29.21 
 
 		 518 aa  120  6e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000136965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0241  TonB-dependent receptor  24.69 
 
 		 675 aa  118  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.571494  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6883  TonB-dependent receptor  23.34 
 
 		 821 aa  111  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1705  probable TonB-dependent receptor yncD  25.62 
 
 		 706 aa  111  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.714131  normal  0.179613 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0023  TonB-dependent receptor  22.73 
 
 		 747 aa  111  6e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1573  probable TonB-dependent receptor yncD  25.49 
 
 		 706 aa  109  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2728  TonB-dependent receptor  23.72 
 
 		 688 aa  109  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.811385  normal  0.575129 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1766  TonB-dependent receptor yncD  25.4 
 
 		 706 aa  108  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1702  putative TonB-dependent receptor yncD  25.54 
 
 		 706 aa  108  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.770108  normal  0.940102 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1754  TonB-dependent receptor YncD  25.5 
 
 		 721 aa  107  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3472  TonB-dependent siderophore receptor  24.93 
 
 		 653 aa  105  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0503687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0508  TonB-dependent receptor  21.4 
 
 		 764 aa  103  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.786517  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2057  TonB-dependent receptor  23.95 
 
 		 700 aa  103  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.980298  hitchhiker  0.0003174 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0651  tonB-dependent receptor  23.71 
 
 		 656 aa  103  1e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0646495  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0582  TonB-dependent receptor plug  23.33 
 
 		 664 aa  103  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000848459  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1538  TonB-dependent receptor  23.95 
 
 		 700 aa  102  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2046  TonB-dependent receptor  23.49 
 
 		 713 aa  102  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183904 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2208  TonB-dependent receptor  23.95 
 
 		 700 aa  102  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.346262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0312  iron(III) dicitrate transport protein, outer membrane receptor  23.17 
 
 		 807 aa  102  3e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.670307  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2195  TonB-dependent receptor  23.81 
 
 		 700 aa  100  6e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0192314  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3176  TonB-dependent siderophore receptor  24.66 
 
 		 653 aa  101  6e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4532  TonB-dependent receptor  22.91 
 
 		 813 aa  99.8  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.885203  normal  0.799433 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1632  TonB-dependent receptor  23.67 
 
 		 700 aa  99.8  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0815  TonB-dependent receptor domain-containing protein  24.16 
 
 		 653 aa  99.4  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1723  TonB-dependent receptor  23.67 
 
 		 700 aa  99.8  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01408  predicted iron outer membrane transporter  23.67 
 
 		 700 aa  99  3e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3109  TonB-dependent receptor  30.47 
 
 		 738 aa  99  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0242785  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01419  hypothetical protein  23.67 
 
 		 700 aa  99  3e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4120  enterobactin receptor protein  21.89 
 
 		 666 aa  98.2  4e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000897059  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0279  TonB-dependent receptor  23.39 
 
 		 730 aa  98.2  4e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.874959  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05789  hypothetical protein  23.89 
 
 		 712 aa  98.2  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1720  TonB-dependent receptor  23.2 
 
 		 700 aa  97.8  5e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201404 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0651  TonB-dependent siderophore receptor  24.2 
 
 		 653 aa  98.2  5e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.68611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1372  TonB-dependent receptor plug  23.26 
 
 		 701 aa  97.8  7e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000623394  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1930  TonB-dependent receptor  23.22 
 
 		 702 aa  97.4  8e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3576  TonB-dependent receptor  24.21 
 
 		 653 aa  96.7  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.313951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3302  TonB-dependent siderophore receptor  24.48 
 
 		 653 aa  96.7  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00384842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4681  TonB-dependent receptor  23.06 
 
 		 704 aa  96.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0656736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0217  enterobactin receptor protein  21.76 
 
 		 666 aa  96.3  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171736  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4241  enterobactin receptor protein  21.76 
 
 		 666 aa  95.9  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112255  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1760  TonB-dependent heme receptor  23.27 
 
 		 664 aa  96.3  2e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0219  enterobactin receptor protein  21.76 
 
 		 666 aa  95.9  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0246836  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  23.54 
 
 		 708 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4390  TonB-dependent receptor  22.58 
 
 		 704 aa  92.8  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5052  TonB-dependent receptor  32.64 
 
 		 726 aa  92.8  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0923716  normal  0.422268 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2099  TonB-dependent siderophore receptor  29.64 
 
 		 728 aa  92.4  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0104822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3767  TonB-dependent receptor  24.02 
 
 		 653 aa  91.7  4e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2724  TonB-dependent receptor  23.76 
 
 		 709 aa  92  4e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.424768 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37020  outer membrane receptor FepA  21.96 
 
 		 746 aa  91.3  5e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145193  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3521  TonB-dependent siderophore receptor  23.52 
 
 		 699 aa  90.9  7e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0934  putative outer membrane receptor  27.5 
 
 		 655 aa  90.1  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0729  TonB-dependent receptor, plug  22.91 
 
 		 656 aa  89.7  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000181168  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>