More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3271 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3271  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 201 aa  403  1.0000000000000001e-112  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.377871  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3721  transcriptional regulator, TetR family  35.19 
 
 		 200 aa  83.2  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5272  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 195 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0969  TetR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 195 aa  67.8  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.610377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5157  putative transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 233 aa  64.7  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23435  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4373  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 229 aa  62.8  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.335963  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3793  regulatory protein TetR  25.99 
 
 		 207 aa  61.6  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0686  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.863349  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0699  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.682068  normal  0.380548 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0679  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192454  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0258  TetR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.569121  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0106  transcriptional regulator, TetR family  27.81 
 
 		 227 aa  59.3  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2228  TetR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1490  TetR family transcriptional regulator  24 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6201  transcriptional regulator, TetR family  31.29 
 
 		 189 aa  57.4  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0829103  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2304  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.808365 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1512  TetR family transcriptional regulator  24 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1488  TetR family transcriptional regulator  24 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0740  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.156291  normal  0.856133 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3451  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.6413 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3965  transcriptional regulator, TetR family  36.78 
 
 		 208 aa  54.7  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0746  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 193 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0760  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 193 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.650224  normal  0.287817 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5011  putative transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 		 203 aa  53.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0421  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 189 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0114693  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1317  regulatory protein TetR  26.88 
 
 		 232 aa  53.5  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4464  transcriptional regulator, TetR family  37.11 
 
 		 188 aa  53.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129958  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0059  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 197 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.227701 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 197 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  26.57 
 
 		 226 aa  52.4  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2779  transcriptional regulator, TetR family  28.9 
 
 		 185 aa  52.4  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.441306  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1279  regulatory protein, TetR  30.17 
 
 		 206 aa  52  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.211303  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0202  TetR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 186 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05370  transcriptional regulator, TetR family  23.97 
 
 		 205 aa  51.6  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7116  putative transcriptional regulator, TetR family  29.6 
 
 		 183 aa  51.6  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101346  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2930  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 193 aa  51.2  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.585103  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 210 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27910  transcriptional regulator, tetR family  45.61 
 
 		 194 aa  50.8  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.839534  normal  0.794272 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  44.26 
 
 		 221 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1089  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4466  TetR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 193 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1313  TetR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 203 aa  50.4  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2013  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 173 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3223  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 228 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3779  transcriptional regulator, TetR family  34.34 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3234  transcriptional regulator, TetR family  32.47 
 
 		 191 aa  50.4  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 228 aa  50.1  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 324 aa  50.4  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0987  regulatory protein TetR  41.67 
 
 		 192 aa  50.4  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.383045  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2059  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 173 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.045167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3285  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 228 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2792  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 248 aa  50.1  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.41359  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3234  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 228 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  45.28 
 
 		 221 aa  50.1  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 213 aa  50.1  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1994  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 173 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.187018  normal  0.996586 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0256  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 227 aa  49.7  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.968825 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 210 aa  49.7  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0143  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 266 aa  49.7  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170765  normal  0.0134311 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 226 aa  49.7  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2087  transcriptional regulator, TetR family  26.94 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0227018  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4342  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 218 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0243053 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 206 aa  49.3  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0292  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 203 aa  49.3  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000945067 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4624  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 197 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1008  TetR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 190 aa  48.9  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1080  TetR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 190 aa  48.9  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1712  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 231 aa  48.9  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.149018  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15250  transcriptional regulator, tetR family  35.94 
 
 		 218 aa  48.9  0.00005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.110377  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2341  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 206 aa  48.9  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.554096 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 234 aa  48.9  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0855  TetR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 196 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.179371  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1511  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 225 aa  48.9  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3885  TetR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 242 aa  48.5  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 194 aa  48.5  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  28.89 
 
 		 243 aa  48.5  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  28.89 
 
 		 214 aa  48.5  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1211  transcriptional regulator, TetR family  31.88 
 
 		 227 aa  48.5  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1177  TetR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 190 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1634  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 209 aa  48.5  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.681802  normal  0.225704 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0995  TetR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 190 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7734  TetR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 217 aa  48.1  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 		 200 aa  48.5  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 		 200 aa  48.5  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0833  TetR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 190 aa  48.5  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0292  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 203 aa  48.5  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000414466 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1112  transcriptional regulator, TetR family  37.25 
 
 		 190 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4194  transcriptional regulator, TetR family  37.25 
 
 		 190 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1275  transcriptional regulator, TetR family  32.46 
 
 		 193 aa  48.5  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0714777  normal  0.0115307 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0995  TetR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 190 aa  48.5  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.713352  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0991  TetR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 190 aa  48.1  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1957  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 205 aa  48.1  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1237  transcriptional regulator, TetR family  37.25 
 
 		 190 aa  48.1  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  36.23 
 
 		 220 aa  48.1  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>