More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0715 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_2236  TIP49-like protein  84.48 
 
 		 450 aa  778    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.385068 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0715  TIP49 domain-containing protein  100 
 
 		 451 aa  892    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0616  TBP-interacting protein TIP49  85.75 
 
 		 450 aa  786    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1694  TIP49-like protein  88.03 
 
 		 451 aa  816    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.252738 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0904  TIP49-like protein  67.54 
 
 		 456 aa  627  1e-178  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0175331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0862  TIP49-like  59.59 
 
 		 441 aa  510  1e-143  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0596  TBP-interacting protein TIP49  53.66 
 
 		 452 aa  459  9.999999999999999e-129  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.739423 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0253  TIP49 domain protein  54.51 
 
 		 452 aa  444  1e-123  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.632673  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1220  TIP49 domain protein  50.11 
 
 		 448 aa  422  1e-117  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.478544  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31398  predicted protein  41.63 
 
 		 455 aa  360  4e-98  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.556143  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01971  RuvB-like helicase 1 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BBV9]  43.2 
 
 		 458 aa  358  8e-98  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000052606  hitchhiker  0.00951448 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37582  RUVB-like protein  42.04 
 
 		 459 aa  358  9.999999999999999e-98  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.262753 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29898  transcriptional regulator  44.65 
 
 		 484 aa  358  9.999999999999999e-98  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.287738  normal  0.530711 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00990  RVB1, putative  42.09 
 
 		 484 aa  352  5.9999999999999994e-96  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06840  conserved hypothetical protein  42.99 
 
 		 463 aa  350  3e-95  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.247034  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43499  predicted protein  42.4 
 
 		 462 aa  347  2e-94  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19568  predicted protein  41.27 
 
 		 485 aa  347  3e-94  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.921701  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00327  RuvB-like helicase 2 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BGK3]  40.91 
 
 		 468 aa  343  4e-93  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_50825  predicted protein  39.24 
 
 		 451 aa  326  7e-88  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2115  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  50 
 
 		 731 aa  51.6  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0683  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  47.69 
 
 		 731 aa  51.6  0.00003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0128  ATP-dependent metalloprotease FtsH  37.39 
 
 		 614 aa  50.8  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.464101 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0614  ATP-dependent metalloprotease FtsH  42.17 
 
 		 628 aa  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0630  ATP-dependent metalloprotease FtsH  42.17 
 
 		 628 aa  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1983  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  46.15 
 
 		 731 aa  50.1  0.00008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.338753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08451  FtsH ATP-dependent protease-like protein  44.16 
 
 		 637 aa  50.1  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0508625  hitchhiker  0.00322552 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1868  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.37 
 
 		 640 aa  50.1  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2346  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  46.15 
 
 		 731 aa  50.1  0.00009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.654531  hitchhiker  0.00924894 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1842  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.37 
 
 		 640 aa  50.1  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0470  cell division protein FtsH  40.66 
 
 		 658 aa  49.3  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08041  FtsH ATP-dependent protease-like protein  45.45 
 
 		 637 aa  49.7  0.0001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0315531  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5220  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.45 
 
 		 631 aa  49.3  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.991823  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1061  peptidase M41, FtsH  44.16 
 
 		 642 aa  49.3  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.498037  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1438  FtsH peptidase  42.86 
 
 		 639 aa  49.3  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.226378  normal  0.078862 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0751  FtsH peptidase  45.45 
 
 		 637 aa  49.7  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4594  FtsH peptidase  44.16 
 
 		 628 aa  49.3  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08031  FtsH ATP-dependent protease-like protein  45.45 
 
 		 637 aa  49.7  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0541  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  38.61 
 
 		 735 aa  49.3  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.716512  normal  0.437699 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  50.91 
 
 		 732 aa  49.7  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10141  cell division protein FtsH4  43.37 
 
 		 584 aa  48.9  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0293  FtsH peptidase  42.86 
 
 		 640 aa  48.9  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1180  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  49.09 
 
 		 781 aa  48.5  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.119571  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10151  cell division protein FtsH4  42.68 
 
 		 584 aa  48.9  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.745337  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3190  FtsH peptidase  44.16 
 
 		 628 aa  48.9  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0440312  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09651  FtsH ATP-dependent protease-like protein  42.86 
 
 		 640 aa  48.9  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.116112  normal  0.424003 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15451  FtsH ATP-dependent protease-like protein  42.86 
 
 		 638 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3313  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.16 
 
 		 628 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.711705 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08411  FtsH ATP-dependent protease-like protein  45.45 
 
 		 637 aa  48.9  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1076  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.84 
 
 		 701 aa  48.9  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5357  cell division protein ftsH (ATP-dependent zinc-metallo protease)  42.47 
 
 		 615 aa  48.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0232294 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02750  MMS2, putative  42.62 
 
 		 810 aa  48.1  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4361  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.84 
 
 		 640 aa  48.5  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193811 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1513  FtsH peptidase  39.36 
 
 		 665 aa  48.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000097295  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0775  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  49.09 
 
 		 781 aa  48.5  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0946  ATP-dependent metalloprotease FtsH  37.37 
 
 		 584 aa  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.344786  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2049  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.73 
 
 		 577 aa  48.1  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000035713  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0942  FtsH peptidase  44.16 
 
 		 630 aa  48.1  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3001  ATP-dependent metalloprotease FtsH  37.65 
 
 		 676 aa  48.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0623369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  49.09 
 
 		 800 aa  48.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1499  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  49.09 
 
 		 784 aa  48.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.84 
 
 		 638 aa  48.5  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1029  ATPase central domain-containing protein  28.85 
 
 		 583 aa  48.5  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4255  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.16 
 
 		 632 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0659148 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1495  FtsH-2 peptidase  46.58 
 
 		 635 aa  47.8  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.421707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2664  ATP-dependent metalloprotease FtsH  42.47 
 
 		 656 aa  47.8  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00646659 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1052  ATP-dependent metalloprotease FtsH  41.56 
 
 		 643 aa  47.8  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0076  membrane protease FtsH catalytic subunit  40.7 
 
 		 644 aa  48.1  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.597348  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.44 
 
 		 662 aa  47.8  0.0004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0836  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.58 
 
 		 697 aa  47.4  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473024  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  50.88 
 
 		 759 aa  47.4  0.0005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0232  hypothetical protein  36.9 
 
 		 691 aa  47.4  0.0005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  39.29 
 
 		 614 aa  47.4  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2444  FtsH peptidase  42.86 
 
 		 633 aa  47.4  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000343724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0812  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.48 
 
 		 651 aa  47.4  0.0005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0310743  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1506  ATP-dependent metallopeptidase HflB  37.93 
 
 		 647 aa  47.4  0.0005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0423  ATP-dependent metalloprotease FtsH  38.3 
 
 		 636 aa  47.4  0.0005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5040  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.29 
 
 		 685 aa  47.4  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3521  Holliday junction DNA helicase RuvB  50 
 
 		 347 aa  47.4  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4509  membrane protease FtsH catalytic subunit  40.43 
 
 		 652 aa  47.4  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.112611 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1440  cell division protein  37.93 
 
 		 650 aa  47.4  0.0005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09311  cell division protein FtsH4  37.37 
 
 		 584 aa  47.4  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.679797  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3253  FtsH peptidase  46.58 
 
 		 667 aa  47.8  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.586375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3029  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.84 
 
 		 651 aa  47.4  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0253083  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17401  Holliday junction DNA helicase RuvB  52 
 
 		 348 aa  47.4  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2804  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.47 
 
 		 645 aa  47.8  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2234  FtsH-2 peptidase  60.47 
 
 		 645 aa  47.4  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0163354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1021  ATPase central domain-containing protein  37.88 
 
 		 371 aa  47.4  0.0006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2418  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.84 
 
 		 616 aa  47.4  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0206  ATP-dependent metalloprotease FtsH  37.96 
 
 		 617 aa  47.4  0.0006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1293  ATP-dependent metalloprotease FtsH  41.1 
 
 		 608 aa  47.4  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0613  cell division protein, ATP-dependent metalloprotease  38.37 
 
 		 692 aa  47.4  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4390  ATP-dependent metalloprotease FtsH  41.18 
 
 		 623 aa  47.4  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.489169  normal  0.114321 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86417  mitochondrial protein of the CDC48/PAS1/SEC18 family of ATPases  45.21 
 
 		 703 aa  47.4  0.0006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.933986 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2293  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.53 
 
 		 615 aa  47.4  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0211  ATP-dependent metalloprotease FtsH  38.3 
 
 		 655 aa  47.4  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0172  ATP-dependent metalloprotease FtsH  38.67 
 
 		 646 aa  47  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4397  ATP-dependent metalloprotease FtsH  42.47 
 
 		 618 aa  47  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_50978  predicted protein  44.44 
 
 		 930 aa  47  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0064  FtsH peptidase  37.23 
 
 		 637 aa  47  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1599  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.36 
 
 		 647 aa  47  0.0007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.238697 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>