More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2000 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_2000  yecA family protein  100 
 
 		 259 aa  515  1.0000000000000001e-145  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1413  yecA family protein  32.2 
 
 		 237 aa  108  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3093  yecA family protein  32.2 
 
 		 267 aa  108  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.062887  normal  0.759909 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3237  YgfB and YecA  33.33 
 
 		 235 aa  105  6e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2224  YgfB and YecA  34.26 
 
 		 239 aa  102  8e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.358802 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0115  yecA family protein  31 
 
 		 225 aa  95.5  8e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.410021  hitchhiker  0.00793411 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2456  yecA family protein  31.53 
 
 		 228 aa  91.3  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5791  yecA family protein  29.1 
 
 		 236 aa  90.9  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1894  YgfB and YecA  29.96 
 
 		 432 aa  90.5  3e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00737905  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4386  transporter  33.94 
 
 		 228 aa  88.2  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.387377  normal  0.216789 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2153  hypothetical protein  31.47 
 
 		 221 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000183931 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1306  hypothetical protein  31.47 
 
 		 221 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.477015  hitchhiker  0.00000000164009 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2100  hypothetical protein  31.47 
 
 		 221 aa  87  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.45396e-18 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2093  hypothetical protein  31.47 
 
 		 221 aa  87  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.228892  hitchhiker  0.0000586575 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1183  hypothetical protein  31.47 
 
 		 221 aa  86.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.022199  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1735  yecA family protein  30.34 
 
 		 221 aa  85.5  8e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000279922  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2141  hypothetical protein  30.34 
 
 		 221 aa  85.5  8e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291021  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1728  hypothetical protein  30.34 
 
 		 221 aa  85.5  8e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000258214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1275  hypothetical protein  30.34 
 
 		 221 aa  85.5  8e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000031022  hitchhiker  0.000229612 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2006  hypothetical protein  30.34 
 
 		 221 aa  85.5  8e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000852324  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1035  hypothetical protein  30.34 
 
 		 221 aa  84.3  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000463904  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2648  hypothetical protein  29.91 
 
 		 221 aa  83.2  0.000000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.265395  hitchhiker  0.000000180818 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01876  conserved metal-binding protein  29.49 
 
 		 221 aa  82  0.000000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000425313  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01865  hypothetical protein  29.49 
 
 		 221 aa  82  0.000000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000280044  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0804  YecA  29.79 
 
 		 283 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3722  SecC motif-containing protein  30.48 
 
 		 272 aa  80.9  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000837198  decreased coverage  0.00531296 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0479  SEC-C motif domain protein  29.96 
 
 		 260 aa  80.1  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2706  yecA family protein  26.67 
 
 		 232 aa  79.3  0.00000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.179188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2940  yecA family protein  26.67 
 
 		 232 aa  79.3  0.00000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.188532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0353  SecC motif-containing protein  28.8 
 
 		 276 aa  79  0.00000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.958366 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0342  SEC-C motif domain protein  28.8 
 
 		 276 aa  79  0.00000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0940465  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0943  yecA family protein  30.04 
 
 		 254 aa  78.6  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4482  SecC motif-containing protein  29.41 
 
 		 274 aa  75.5  0.0000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.306168 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4194  yecA family protein  31.22 
 
 		 221 aa  74.3  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000432994 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0706  yecA family protein  26.67 
 
 		 314 aa  71.2  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5710  SecC motif-containing protein  28 
 
 		 281 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2490  hypothetical protein  31.09 
 
 		 222 aa  69.7  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3702  SecA-related metal-binding protein  30.35 
 
 		 254 aa  68.6  0.00000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.569831 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0426  SecC motif-containing protein  34.56 
 
 		 278 aa  68.6  0.00000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0060  yecA family protein  28.81 
 
 		 237 aa  68.2  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0950  yecA family protein  31.11 
 
 		 226 aa  65.5  0.0000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1895  YgfB and YecA  29.34 
 
 		 231 aa  65.1  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1865  SecC motif-containing protein  25 
 
 		 257 aa  62.8  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.356111  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0244  yecA family protein  26.12 
 
 		 253 aa  62.8  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0997  preprotein translocase subunit SecA  68.42 
 
 		 1031 aa  62  0.000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.407169 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3165  hypothetical protein  26.96 
 
 		 214 aa  62  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.550145  normal  0.0595917 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0477  preprotein translocase subunit SecA  63.64 
 
 		 897 aa  61.6  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000253416  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0113  yecA family protein  29.63 
 
 		 198 aa  60.8  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000620345  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1156  yecA family protein  29.69 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.324064 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1273  yecA family protein  28.16 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1709  preprotein translocase subunit SecA  66.67 
 
 		 858 aa  58.5  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.283153  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4747  preprotein translocase, SecA subunit  71.43 
 
 		 834 aa  57.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000758665  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2104  preprotein translocase, SecA subunit  38.14 
 
 		 848 aa  57.4  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2859  yecA family protein  25 
 
 		 249 aa  57.8  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.448598  normal  0.212674 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0190  preprotein translocase, SecA subunit  42.47 
 
 		 921 aa  57  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.893566  normal  0.461403 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2102  yecA family protein  31.25 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2873  preprotein translocase subunit SecA  57.89 
 
 		 844 aa  55.5  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0052  preprotein translocase, SecA subunit  95.24 
 
 		 866 aa  55.5  0.0000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0229  preprotein translocase subunit SecA  71.88 
 
 		 896 aa  55.1  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0140186  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1898  preprotein translocase subunit SecA  90.91 
 
 		 922 aa  54.7  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16440  preprotein translocase, SecA subunit  68.75 
 
 		 845 aa  54.7  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000273245  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4502  hypothetical protein  35.71 
 
 		 309 aa  54.7  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000195351 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1429  SEC-C motif domain protein  100 
 
 		 384 aa  53.9  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0098  YgfB and YecA  28.65 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7276  yecA family protein  27.27 
 
 		 336 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.106691 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1082  preprotein translocase subunit SecA  67.74 
 
 		 864 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7393  yecA family protein  27.27 
 
 		 336 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.147246  normal  0.347754 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1621  protein translocase subunit secA  52.38 
 
 		 902 aa  54.3  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.782819  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5240  preprotein translocase, SecA subunit  57.5 
 
 		 1067 aa  53.9  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0916466  normal  0.569995 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1651  hypothetical protein  91.3 
 
 		 420 aa  54.3  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3418  preprotein translocase subunit SecA  71.88 
 
 		 909 aa  54.3  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.487797  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1146  SecC motif-containing protein  63.64 
 
 		 1277 aa  53.1  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3417  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0466  preprotein translocase subunit SecA  100 
 
 		 888 aa  53.1  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0238  hypothetical protein  71.88 
 
 		 830 aa  53.5  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0889025  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0914  yecA family protein  27.94 
 
 		 198 aa  53.1  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0071  SEC-C motif domain protein  38.55 
 
 		 593 aa  53.1  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0646  preprotein translocase, SecA subunit  75 
 
 		 881 aa  53.1  0.000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1018  preprotein translocase subunit SecA  59.52 
 
 		 1017 aa  53.1  0.000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00760005  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2483  preprotein translocase, SecA subunit  70.97 
 
 		 859 aa  52.8  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0576  preprotein translocase subunit SecA  78.26 
 
 		 855 aa  52.8  0.000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.116184  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2368  preprotein translocase, SecA subunit  55 
 
 		 1200 aa  52.8  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.464933  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0589  preprotein translocase, SecA subunit  58.33 
 
 		 910 aa  52.4  0.000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0760479  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3195  preprotein translocase subunit SecA  68.75 
 
 		 837 aa  52.4  0.000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2413  SecC motif-containing protein  80.77 
 
 		 319 aa  52.4  0.000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00422033  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3488  preprotein translocase subunit SecA  75.86 
 
 		 904 aa  52.4  0.000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.185524 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05460  protein translocase subunit secA  83.33 
 
 		 945 aa  52  0.000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0770  preprotein translocase subunit SecA  68.57 
 
 		 910 aa  52.4  0.000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00309975  normal  0.728457 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7284  preprotein translocase, SecA subunit  58.33 
 
 		 1118 aa  52.4  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.884849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2780  SecC motif-containing protein  38.1 
 
 		 291 aa  52  0.000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.307535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2011  preprotein translocase subunit SecA  55.56 
 
 		 836 aa  51.2  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1857  preprotein translocase SecA subunit  60.61 
 
 		 955 aa  51.2  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.137741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0131  protein translocase subunit secA  70 
 
 		 923 aa  52  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.449185 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1982  SEC-C domain-containing protein  43.24 
 
 		 166 aa  51.6  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0736  protein translocase subunit secA  54.76 
 
 		 962 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0236421  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0176  preprotein translocase, SecA subunit  75 
 
 		 921 aa  51.6  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0185588  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2086  protein translocase subunit secA  63.33 
 
 		 909 aa  51.6  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511235 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0959  SEC-C motif domain protein  69.7 
 
 		 164 aa  51.6  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.510797 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0625  SecA, C-motif-containing protein  25 
 
 		 209 aa  51.6  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0113543  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0773  preprotein translocase, SecA subunit  54.76 
 
 		 962 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1274  preprotein translocase subunit SecA  79.17 
 
 		 1029 aa  50.8  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.128332  normal  0.146053 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>