82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2058 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_2058  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  100 
 
 
324 aa  665    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0306404  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3246  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  54.23 
 
 
309 aa  276  5e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00234507  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.27 
 
 
1343 aa  146  4.0000000000000006e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0230  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.96 
 
 
355 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0337671 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5125  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  37.66 
 
 
469 aa  127  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.499707  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3254  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.19 
 
 
457 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00168227 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1604  peptidase C14, caspase catalytic subunit P20  38.34 
 
 
205 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0287  polysaccharide deacetylase  31.44 
 
 
871 aa  90.5  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2378  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.81 
 
 
658 aa  89.7  7e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4190  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.52 
 
 
265 aa  85.9  9e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2223  polysaccharide deacetylase  30.09 
 
 
900 aa  84.7  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.161248  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4708  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.98 
 
 
1004 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.171644  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2313  hypothetical protein  29.2 
 
 
903 aa  80.9  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.88432  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4042  polysaccharide deacetylase  27.75 
 
 
890 aa  79  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0843  OmpA/MotB  25.51 
 
 
1619 aa  76.3  0.0000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.516542  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03488  polysaccharide deacetylase  29.13 
 
 
898 aa  75.5  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1403  hypothetical protein  26.74 
 
 
509 aa  69.7  0.00000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0229989  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2969  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.05 
 
 
261 aa  68.6  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.368497 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4864  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.55 
 
 
1004 aa  68.2  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.188606  normal  0.603613 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2005  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.5 
 
 
477 aa  64.3  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000318218  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1560  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.71 
 
 
316 aa  64.7  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3572  diguanylate cyclase  27.05 
 
 
902 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1212  hypothetical protein  25.81 
 
 
510 aa  64.7  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000290605  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2898  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.47 
 
 
428 aa  64.3  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.180767  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1185  hypothetical protein  26.88 
 
 
509 aa  64.3  0.000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00163792  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5582  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.62 
 
 
641 aa  63.2  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1383  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.99 
 
 
615 aa  62.8  0.000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.224094  hitchhiker  0.00154114 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2534  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.46 
 
 
941 aa  62  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.687385  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3660  WD repeat-containing protein  27 
 
 
1097 aa  62.4  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2899  ankyrin  26.07 
 
 
442 aa  62.4  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0204269  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1658  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.38 
 
 
615 aa  62  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0826255  normal  0.784993 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2900  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.23 
 
 
464 aa  60.1  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000126613  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3477  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.57 
 
 
830 aa  59.7  0.00000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00814329  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0867  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.19 
 
 
491 aa  59.3  0.00000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0144143  n/a   
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0055  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.79 
 
 
316 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000868193  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1323  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.79 
 
 
666 aa  58.5  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.540466  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3011  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.31 
 
 
466 aa  58.5  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.912982  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0825  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.84 
 
 
298 aa  57.8  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2413  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.69 
 
 
579 aa  57  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0588037  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1450  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.69 
 
 
578 aa  57  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0185927  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1545  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.69 
 
 
578 aa  56.6  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.314376  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2823  hypothetical protein  27.07 
 
 
388 aa  56.6  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.605143  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0868  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.88 
 
 
1106 aa  56.6  0.0000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3616  hypothetical protein  27.64 
 
 
328 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.666747  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2940  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.14 
 
 
1196 aa  55.8  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408455  hitchhiker  0.000165978 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2468  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.65 
 
 
629 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0996556  normal  0.406351 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6471  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.56 
 
 
1274 aa  54.3  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.707662  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1153  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.03 
 
 
278 aa  53.9  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.206114  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0772  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.31 
 
 
902 aa  52.4  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6953  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.17 
 
 
850 aa  52  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2760  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.58 
 
 
393 aa  52.4  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00577911  normal  0.882306 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4384  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.15 
 
 
324 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4110  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.54 
 
 
729 aa  50.4  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.110256 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2059  hypothetical protein  41.38 
 
 
378 aa  50.4  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.3774  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5307  KAP P-loop domain-containing protein  30 
 
 
770 aa  50.1  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.51517  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.33 
 
 
1686 aa  50.1  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2433  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.95 
 
 
445 aa  49.3  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2382  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.95 
 
 
445 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02503  metacaspase (Eurofung)  25.45 
 
 
420 aa  48.5  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  26.42 
 
 
925 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.95 
 
 
1760 aa  48.1  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1574  hypothetical protein  24.78 
 
 
587 aa  47.4  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.7 
 
 
1240 aa  47.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0722  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.1 
 
 
324 aa  47.8  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00740  metacaspase, putative  25.62 
 
 
463 aa  47.8  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1503  diguanylate phosphodiesterase  31.29 
 
 
731 aa  46.2  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.293201  hitchhiker  0.000197979 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2384  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.69 
 
 
590 aa  46.2  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194573 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7211  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  24.48 
 
 
841 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0794016 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0891  metacaspase  24.82 
 
 
293 aa  45.4  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5336  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.36 
 
 
495 aa  45.4  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.053898  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.95 
 
 
1711 aa  45.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5030  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.43 
 
 
479 aa  44.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0195468 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63918  predicted protein  26.8 
 
 
378 aa  45.1  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1719  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.48 
 
 
515 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.648302  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6462  hypothetical protein  23.83 
 
 
409 aa  44.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.11 
 
 
1557 aa  44.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3436  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  21.46 
 
 
654 aa  43.9  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0303831  normal  0.42881 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2462  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.95 
 
 
649 aa  44.3  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.10862  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2871  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.48 
 
 
1203 aa  43.9  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03882  metacaspase, putative (JCVI)  30.16 
 
 
540 aa  43.5  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.373127  normal  0.877993 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6053  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  23.96 
 
 
843 aa  43.5  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0201  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.86 
 
 
325 aa  42.7  0.008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0418553  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>