More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1594 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_2974  acriflavin resistance protein  38.6 
 
 		 1022 aa  723    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.128373  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3279  AcrB/AcrD/AcrF family protein  36.37 
 
 		 1026 aa  689    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2988  acriflavin resistance protein  38.31 
 
 		 1022 aa  724    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1569  acriflavin resistance protein  36.89 
 
 		 1026 aa  685    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4735  acriflavin resistance protein  47.38 
 
 		 1029 aa  973    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.130909  normal  0.265642 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1324  acriflavin resistance protein  36.76 
 
 		 1038 aa  672    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.778616  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2636  acriflavin resistance protein  37.85 
 
 		 1025 aa  714    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.545015  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1311  acriflavin resistance protein  37.08 
 
 		 1023 aa  709    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1311  acriflavin resistance protein  34.34 
 
 		 1039 aa  652    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.203129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3132  acriflavin resistance protein  38.51 
 
 		 1022 aa  726    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1389  acriflavin resistance protein  38.6 
 
 		 1022 aa  728    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1277  acriflavin resistance protein  37.44 
 
 		 1023 aa  709    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00411319  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3113  acriflavin resistance protein  36.86 
 
 		 1030 aa  687    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2343  acriflavin resistance protein  36.57 
 
 		 1022 aa  667    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.763441 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1594  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1037 aa  2083    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1245  acriflavin resistance protein  36.97 
 
 		 1026 aa  709    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1315  acriflavin resistance protein  36.87 
 
 		 1026 aa  710    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0188093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1147  acriflavin resistance protein  37.63 
 
 		 1021 aa  721    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1065  acriflavin resistance protein  36.74 
 
 		 1049 aa  724    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.494981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1295  acriflavin resistance protein  36.97 
 
 		 1026 aa  707    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00488  AcrB/AcrD/AcrF family protein  35 
 
 		 1048 aa  615  9.999999999999999e-175  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0250  efflux transporter  34.88 
 
 		 830 aa  509  9.999999999999999e-143  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2563  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.99 
 
 		 1019 aa  358  3.9999999999999996e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1925  acriflavin resistance protein  24.69 
 
 		 1020 aa  352  2e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.553474  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3205  transmembrane drug efflux protein  25.48 
 
 		 1040 aa  350  1e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.228213  normal  0.0965469 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2427  acriflavin resistance protein  26.66 
 
 		 1019 aa  348  3e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179675 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0941  cation efflux system protein  26.15 
 
 		 1020 aa  344  4e-93  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1463  RND efflux transporter  26.51 
 
 		 1025 aa  343  9e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1299  acriflavin resistance protein  25.9 
 
 		 1046 aa  343  1e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.639369  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6531  acriflavin resistance protein  25.9 
 
 		 1046 aa  343  1e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.548117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6138  acriflavin resistance protein  25.9 
 
 		 1046 aa  342  2e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.617624 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4376  acriflavin resistance protein  24.85 
 
 		 1041 aa  341  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.980623  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2179  acriflavin resistance protein  26.25 
 
 		 1051 aa  341  4e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.381595  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46590  putative AcrB/AcrD/AcrF family protein  25.75 
 
 		 1029 aa  341  5e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000144683  hitchhiker  0.00000801184 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2215  RND efflux transporter  24.71 
 
 		 1046 aa  338  2.9999999999999997e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.12162  normal  0.156003 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2531  transmembrane drug efflux protein  24.73 
 
 		 1022 aa  337  5.999999999999999e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.231236  normal  0.199392 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4073  acriflavin resistance protein  25.24 
 
 		 1046 aa  337  5.999999999999999e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3757  acriflavin resistance protein  24.13 
 
 		 1047 aa  337  9e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0820  AcrB/AcrD/AcrF family protein  25.43 
 
 		 1036 aa  336  1e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5363  acriflavin resistance protein  25.43 
 
 		 1025 aa  336  1e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0668408  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16820  putative efflux transmembrane protein  26.12 
 
 		 1025 aa  336  1e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.522228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2235  acriflavin resistance protein  26.05 
 
 		 1022 aa  334  6e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3001  cation-multidrug efflux pump  26.94 
 
 		 1025 aa  333  8e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2294  acriflavin resistance protein  25.44 
 
 		 1012 aa  333  8e-90  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1357  acriflavin resistance protein  24.86 
 
 		 1046 aa  333  1e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.776005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1373  acriflavin resistance protein  25.76 
 
 		 1036 aa  332  3e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.167404  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3469  acriflavin resistance protein  24.05 
 
 		 1048 aa  332  3e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4221  acriflavin resistance protein  24.76 
 
 		 1046 aa  332  3e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592622  normal  0.234166 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6001  acriflavin resistance protein  25.46 
 
 		 1037 aa  331  4e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.233388  normal  0.207677 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0057  acriflavin resistance protein  25.41 
 
 		 1019 aa  331  4e-89  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.663476  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0428  acriflavin resistance protein  25.45 
 
 		 1035 aa  331  6e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1556  acriflavin resistance protein  25.53 
 
 		 1056 aa  330  7e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0745  AcrB/AcrD/AcrF family protein  24.9 
 
 		 1027 aa  330  1.0000000000000001e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0816  acriflavin resistance protein  25.17 
 
 		 1035 aa  328  2.0000000000000001e-88  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3312  acriflavin resistance protein  26.48 
 
 		 1008 aa  329  2.0000000000000001e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2116  acriflavin resistance protein  26.83 
 
 		 1035 aa  328  4.0000000000000003e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0119534 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1862  acriflavin resistance protein  26.83 
 
 		 1035 aa  327  6e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635777 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2558  acriflavin resistance protein  24.98 
 
 		 1035 aa  327  8.000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0417174  normal  0.272072 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2023  acriflavin resistance protein  25.17 
 
 		 1015 aa  327  8.000000000000001e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0990325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1080  acriflavin resistance protein  25.8 
 
 		 1022 aa  326  1e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.756494 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3213  putative efflux protein  27.33 
 
 		 1027 aa  327  1e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4206  acriflavin resistance protein  25.34 
 
 		 1021 aa  326  1e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.355818 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1874  acriflavin resistance protein  25.8 
 
 		 1029 aa  325  2e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.722647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3931  acriflavin resistance protein  26.9 
 
 		 1026 aa  325  2e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415531  normal  0.145125 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2796  acriflavin resistance protein  25.27 
 
 		 1059 aa  326  2e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.963935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6579  acriflavin resistance protein  25.48 
 
 		 1045 aa  325  2e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521516  normal  0.41723 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3139  acriflavin resistance protein  25.2 
 
 		 1029 aa  325  3e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.856751  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3302  RND efflux transporter  25.91 
 
 		 1030 aa  324  4e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.186074  normal  0.0366541 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2423  acriflavin resistance protein  25.82 
 
 		 1030 aa  324  4e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3981  acriflavin resistance protein  24.93 
 
 		 1014 aa  324  6e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1517  acriflavin resistance protein  25.24 
 
 		 1021 aa  323  8e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.850738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6293  acriflavin resistance protein  25.48 
 
 		 1045 aa  323  8e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.258063  hitchhiker  0.00869954 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3460  acriflavin resistance protein  25.31 
 
 		 1073 aa  323  9.999999999999999e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1082  acriflavin resistance protein  24.35 
 
 		 1044 aa  323  9.999999999999999e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0507  acriflavin resistance protein  24.95 
 
 		 1020 aa  323  9.999999999999999e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.433089  normal  0.988199 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3339  acriflavin resistance protein  25.67 
 
 		 1053 aa  322  1.9999999999999998e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2827  acriflavin resistance protein  24.41 
 
 		 1053 aa  322  3e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0321922 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2485  acriflavin resistance protein  24.93 
 
 		 1029 aa  321  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000175334  normal  0.956638 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4101  acriflavin resistance protein  25.05 
 
 		 1021 aa  321  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.585633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4901  acriflavin resistance protein  24.27 
 
 		 1045 aa  321  5e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.626163  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1917  acriflavin resistance protein  26.89 
 
 		 1035 aa  320  7.999999999999999e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.261287 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1563  acriflavin resistance protein  24.47 
 
 		 1039 aa  320  9e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.324661  normal  0.366734 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1654  transmembrane drug efflux protein  23.98 
 
 		 1039 aa  318  3e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.556775 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3350  acriflavin resistance protein  25.19 
 
 		 1024 aa  318  3e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.497047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1393  acriflavin resistance protein  24.98 
 
 		 1014 aa  318  3e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1123  acriflavin resistance protein  25.24 
 
 		 1021 aa  318  4e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3798  acriflavin resistance protein  24.25 
 
 		 1035 aa  317  5e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1308  AcrB/AcrD/AcrF family protein  24.24 
 
 		 1036 aa  317  6e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5106  acriflavin resistance protein  24.54 
 
 		 1049 aa  317  8e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3774  acriflavin resistance protein  23.24 
 
 		 1050 aa  317  9e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.693497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4121  acriflavin resistance protein  24.38 
 
 		 1035 aa  317  9.999999999999999e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1892  acriflavin resistance protein  24.37 
 
 		 1039 aa  317  9.999999999999999e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.71237  normal  0.251919 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1118  hypothetical protein  25.9 
 
 		 1009 aa  315  1.9999999999999998e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1535  acriflavin resistance protein  26.78 
 
 		 1030 aa  315  2.9999999999999996e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.455491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2172  acriflavin resistance protein  23.66 
 
 		 1016 aa  315  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.244345  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8532  acriflavin resistance protein  25.43 
 
 		 1036 aa  315  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1612  acriflavin resistance protein  24.76 
 
 		 1040 aa  315  3.9999999999999997e-84  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3321  acriflavin resistance protein  24.61 
 
 		 1021 aa  314  4.999999999999999e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.148023  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1002  acriflavin resistance protein  25.24 
 
 		 1028 aa  313  7.999999999999999e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.507874  normal  0.0489892 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0187  acriflavin resistance protein  25.49 
 
 		 1027 aa  313  7.999999999999999e-84  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>