More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1897 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1897  aldose 1-epimerase  100 
 
 		 290 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3303  putative aldose-1-epimerase  58.9 
 
 		 297 aa  329  3e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.575493 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2182  Aldose 1-epimerase  49.32 
 
 		 299 aa  243  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000157648 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2432  aldose 1-epimerase  48.11 
 
 		 301 aa  241  7.999999999999999e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0573284  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3398  aldose 1-epimerase  45.96 
 
 		 294 aa  203  3e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.226465  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4435  Aldose 1-epimerase  42.56 
 
 		 303 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.340797 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2973  Aldose 1-epimerase  44.52 
 
 		 303 aa  194  1e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000377273  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12920  galactose mutarotase-like enzyme  43.43 
 
 		 321 aa  188  7e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0901551  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1083  putative aldose-1-epimerase  42.27 
 
 		 305 aa  188  1e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.145719  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5326  aldose-1-epimerase family protein  38.95 
 
 		 300 aa  186  3e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.6155 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1836  Aldose 1-epimerase  41.92 
 
 		 315 aa  186  6e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1278  Aldose 1-epimerase  41.34 
 
 		 307 aa  185  9e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.265427  normal  0.286232 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4402  aldose-1-epimerase family protein  38.6 
 
 		 300 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8681  Aldose 1-epimerase  40.27 
 
 		 303 aa  184  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626175  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03764  predicted aldose-1-epimerase  38.25 
 
 		 308 aa  181  2e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4107  Aldose 1-epimerase  38.25 
 
 		 308 aa  181  2e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03713  hypothetical protein  38.25 
 
 		 308 aa  181  2e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4264  aldose-1-epimerase family protein  38.6 
 
 		 299 aa  178  1e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4297  aldose-1-epimerase family protein  37.41 
 
 		 295 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4252  aldose-1-epimerase family protein  37.41 
 
 		 295 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4343  aldose-1-epimerase family protein  37.41 
 
 		 295 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2997  Aldose 1-epimerase  39.93 
 
 		 302 aa  173  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040024 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2454  aldose 1-epimerase  40.27 
 
 		 307 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0866  Aldose 1-epimerase  41 
 
 		 306 aa  168  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104082  normal  0.0514904 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0514  aldose 1-epimerase  38.7 
 
 		 327 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.165305  decreased coverage  0.000622322 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1225  Aldose 1-epimerase  38.33 
 
 		 302 aa  165  8e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1267  Aldose 1-epimerase  36.71 
 
 		 301 aa  165  9e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.560353  hitchhiker  0.00115827 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4408  aldose-1-epimerase family protein  37.76 
 
 		 280 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0426  aldose 1-epimerase  37.8 
 
 		 308 aa  161  1e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4230  aldose-1-epimerase family protein  37.06 
 
 		 280 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2489  Aldose 1-epimerase  36.33 
 
 		 308 aa  159  4e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33650  galactose mutarotase-like enzyme  38.14 
 
 		 318 aa  159  4e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1019  Aldose 1-epimerase  37.93 
 
 		 299 aa  158  8e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.584137  hitchhiker  0.000443551 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1674  aldose 1-epimerase  38.7 
 
 		 325 aa  158  8e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.416242  hitchhiker  0.00123529 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0044  Aldose 1-epimerase  38 
 
 		 311 aa  157  1e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0854  Aldose 1-epimerase  36.77 
 
 		 300 aa  144  1e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0393175  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0225  galactose mutarotase  31.92 
 
 		 314 aa  137  1e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00000500571  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05040  galactose mutarotase-like enzyme  36.61 
 
 		 323 aa  134  9.999999999999999e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.556037  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0226  galactose mutarotase  32.99 
 
 		 318 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00706113  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0523  Aldose 1-epimerase  34.72 
 
 		 290 aa  127  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1235  Aldose 1-epimerase  34.68 
 
 		 319 aa  121  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000417318 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1522  Aldose 1-epimerase  33.1 
 
 		 293 aa  115  6e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0559  Aldose 1-epimerase  28.27 
 
 		 262 aa  106  5e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.480763  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5039  Aldose 1-epimerase  29.71 
 
 		 312 aa  103  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1458  aldose 1-epimerase  30.69 
 
 		 263 aa  102  7e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1127  aldose 1-epimerase  28.57 
 
 		 269 aa  100  2e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0176464  normal  0.584187 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1163  aldose 1-epimerase  30.82 
 
 		 323 aa  100  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.887027  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1585  Aldose 1-epimerase  32.24 
 
 		 305 aa  97.8  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.92898  normal  0.309256 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1503  Aldose 1-epimerase  32.31 
 
 		 317 aa  95.5  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.72169 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0656  aldose-1-epimerase  26.23 
 
 		 314 aa  94.4  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.629793  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0696  Aldose 1-epimerase  30.56 
 
 		 306 aa  86.7  5e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00129327 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3046  Aldose 1-epimerase  27.34 
 
 		 345 aa  85.1  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.813423  normal  0.148483 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0702  Aldose 1-epimerase  28 
 
 		 318 aa  80.1  0.00000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27460  galactose mutarotase-like enzyme  35.66 
 
 		 334 aa  79  0.00000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0621  Aldose 1-epimerase  29.05 
 
 		 388 aa  77.8  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.295352  normal  0.0428145 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1930  Aldose 1-epimerase  27.45 
 
 		 316 aa  74.3  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.263285  normal  0.479856 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0628  aldose 1-epimerase  30.88 
 
 		 282 aa  74.3  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.48408  normal  0.247972 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02261  aldose 1-epimerase  30.07 
 
 		 346 aa  73.6  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2260  aldose 1-epimerase  27.56 
 
 		 356 aa  73.2  0.000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00420753  unclonable  0.0000000181907 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0149  Aldose 1-epimerase  30.5 
 
 		 336 aa  72.8  0.000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0125238 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4205  aldose 1-epimerase  32.12 
 
 		 362 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613008  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1039  Aldose 1-epimerase  32.63 
 
 		 357 aa  71.6  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5831  aldose 1-epimerase  28.11 
 
 		 293 aa  71.6  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0718685  normal  0.204267 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1895  aldose 1-epimerase family protein  27.48 
 
 		 306 aa  71.6  0.00000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0912  aldose 1-epimerase  28.51 
 
 		 295 aa  72  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1235  Aldose 1-epimerase  29.33 
 
 		 387 aa  72  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.153244 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4072  Aldose 1-epimerase  32.12 
 
 		 360 aa  69.7  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4184  Aldose 1-epimerase  32.12 
 
 		 360 aa  69.7  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4631  aldose 1-epimerase  28.53 
 
 		 361 aa  69.7  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6030  aldose 1-epimerase  29.09 
 
 		 362 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.808799  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1083  hypothetical protein  34.01 
 
 		 323 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000316766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2336  aldose 1-epimerase  28.26 
 
 		 376 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.360362  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6330  aldose 1-epimerase  29.09 
 
 		 362 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02436  hypothetical protein  24.83 
 
 		 290 aa  66.6  0.0000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1124  Aldose 1-epimerase  24.83 
 
 		 290 aa  66.6  0.0000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2829  aldose 1-epimerase family protein  24.83 
 
 		 290 aa  66.6  0.0000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1187  aldose 1-epimerase  31.52 
 
 		 354 aa  66.6  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.353984 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0726  Aldose 1-epimerase  27.24 
 
 		 328 aa  67  0.0000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2696  aldose 1-epimerase family protein  24.83 
 
 		 290 aa  66.6  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02400  hypothetical protein  24.83 
 
 		 290 aa  66.6  0.0000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2697  aldose 1-epimerase family protein  24.83 
 
 		 290 aa  66.6  0.0000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6508  aldose 1-epimerase  30.81 
 
 		 362 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6331  aldose 1-epimerase  30.81 
 
 		 362 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6742  aldose 1-epimerase  30.81 
 
 		 362 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  normal  0.547611 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1210  aldose 1-epimerase  24.64 
 
 		 347 aa  65.9  0.0000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00282737  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6635  Aldose 1-epimerase  28.48 
 
 		 361 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.779767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0799  aldose 1-epimerase  27.87 
 
 		 397 aa  65.5  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0324  Aldose 1-epimerase  28.28 
 
 		 299 aa  65.1  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.296431 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3760  Aldose 1-epimerase  22.27 
 
 		 290 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00879497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2624  aldose 1-epimerase  28.48 
 
 		 371 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.240433 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0630  aldose 1-epimerase  29.82 
 
 		 356 aa  64.7  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2798  aldose 1-epimerase  30.57 
 
 		 321 aa  64.3  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3963  aldose 1-epimerase  24.03 
 
 		 286 aa  64.3  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.87118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0655  aldose 1-epimerase  29.82 
 
 		 356 aa  64.7  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3707  Aldose 1-epimerase  22.27 
 
 		 290 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3099  Aldose 1-epimerase  31.55 
 
 		 346 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0743555 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2636  aldose 1-epimerase  29.3 
 
 		 382 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0151396  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1611  aldose 1-epimerase  32.35 
 
 		 438 aa  63.2  0.000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0628258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2241  Aldose 1-epimerase  21.48 
 
 		 291 aa  63.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.61015 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4277  aldose 1-epimerase  24.35 
 
 		 289 aa  63.2  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.436668 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>