187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1611 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_1611  amidohydrolase 2  100 
 
 
299 aa  608  1e-173  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4901  amidohydrolase 2  75.26 
 
 
293 aa  403  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0686596  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2836  amidohydrolase 2  66.9 
 
 
291 aa  398  9.999999999999999e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.192303  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4144  amidohydrolase 2  62.37 
 
 
297 aa  384  1e-105  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.46392  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0275  amidohydrolase 2  61.25 
 
 
287 aa  375  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000138051  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0606  amidohydrolase 2  59.93 
 
 
291 aa  367  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.47355 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4401  amidohydrolase 2  60.75 
 
 
288 aa  365  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1417  amidohydrolase 2  64.93 
 
 
289 aa  364  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4537  amidohydrolase 2  61.17 
 
 
295 aa  364  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4678  amidohydrolase 2  63.19 
 
 
289 aa  358  5e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1397  amidohydrolase 2  62.85 
 
 
289 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.70619  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1655  putative amidohydrolase  63.07 
 
 
294 aa  356  1.9999999999999998e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0995  amidohydrolase 2  56.4 
 
 
287 aa  352  4e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1557  amidohydrolase 2  62.5 
 
 
289 aa  350  2e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0376  amidohydrolase 2  64.01 
 
 
286 aa  345  7e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3823  amidohydrolase 2  57.09 
 
 
297 aa  341  1e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4775  amidohydrolase 2  53.54 
 
 
298 aa  328  5.0000000000000004e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4394  amidohydrolase 2  53.54 
 
 
298 aa  327  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247071  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4481  amidohydrolase 2  53.54 
 
 
298 aa  327  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4952  amidohydrolase 2  53.82 
 
 
300 aa  325  5e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4025  amidohydrolase 2  56.9 
 
 
294 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0646692  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2868  amidohydrolase 2  53.98 
 
 
290 aa  305  7e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.341603  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2871  amidohydrolase 2  43.71 
 
 
289 aa  235  8e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1017  amidohydrolase 2  42.16 
 
 
293 aa  229  4e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0756102  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0179  amidohydrolase 2  40.38 
 
 
294 aa  199  5e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2837  amidohydrolase 2  37.77 
 
 
269 aa  182  6e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0364  amidohydrolase 2  34.75 
 
 
312 aa  132  9e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1435  amidohydrolase 2  41.74 
 
 
282 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1278  amidohydrolase family protein  29.7 
 
 
276 aa  130  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00759688  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0918  amidohydrolase 2  31.3 
 
 
265 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000146298  normal  0.0660058 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2856  amidohydrolase 2  38.39 
 
 
270 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.156395 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2819  amidohydrolase 2  41.28 
 
 
282 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2147  amidohydrolase 2  40.55 
 
 
286 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3097  amidohydrolase 2  36.04 
 
 
279 aa  126  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0495  amidohydrolase 2  29.52 
 
 
278 aa  122  5e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4940  amidohydrolase 2  35.27 
 
 
305 aa  120  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207078  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1437  amidohydrolase 2  32.24 
 
 
277 aa  119  7.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4417  amidohydrolase 2  32.7 
 
 
286 aa  118  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3852  amidohydrolase 2  32.23 
 
 
283 aa  117  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1842  amidohydrolase 2  35.02 
 
 
279 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1590  amidohydrolase 2  29.32 
 
 
276 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00255924  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2574  amidohydrolase 2  33.18 
 
 
288 aa  113  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000906856  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2759  amidohydrolase 2  30.15 
 
 
278 aa  113  5e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.82576  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2839  amidohydrolase 2  32.43 
 
 
287 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.975955  normal  0.522178 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3529  hypothetical protein  33.18 
 
 
287 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13544  hypothetical protein  34.67 
 
 
278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.70136e-92  hitchhiker  0.000000875537 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2538  putative amidohydrolase  30.35 
 
 
283 aa  110  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.332826 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3173  amidohydrolase 2  32.57 
 
 
287 aa  110  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.820351  normal  0.79914 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4910  amidohydrolase 2  33.18 
 
 
279 aa  109  6e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.177504 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1757  amidohydrolase 2  34.07 
 
 
293 aa  107  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000243959  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6447  amidohydrolase 2  38.97 
 
 
286 aa  106  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000000469414  unclonable  4.69579e-18 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12326  antibiotic-resistance protein  30.19 
 
 
307 aa  104  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3599  amidohydrolase 2  30.73 
 
 
288 aa  103  4e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0548656  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4198  amidohydrolase 2  31.07 
 
 
293 aa  102  5e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.200057  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5104  amidohydrolase 2  32.59 
 
 
294 aa  102  6e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361285  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8361  amidohydrolase 2  34.4 
 
 
287 aa  99.4  7e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2231  amidohydrolase 2  31.42 
 
 
300 aa  98.2  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211376  normal  0.186133 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8667  amidohydrolase 2  31.51 
 
 
279 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2032  amidohydrolase 2  30.54 
 
 
283 aa  94.4  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4348  amidohydrolase 2  36 
 
 
279 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2684  amidohydrolase 2  27.73 
 
 
287 aa  94.4  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1562  amidohydrolase 2  33.94 
 
 
285 aa  93.2  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.216517  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1776  amidohydrolase 2  35.33 
 
 
277 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.938541  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1823  amidohydrolase 2  35.33 
 
 
277 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.979278  normal  0.694594 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1996  amidohydrolase 2  34.67 
 
 
279 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2701  amidohydrolase 2  31.82 
 
 
291 aa  89.7  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1757  amidohydrolase 2  34.67 
 
 
277 aa  89  9e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.990764  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1297  amidohydrolase family protein  26.79 
 
 
262 aa  85.9  7e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0950172  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5612  amidohydrolase 2  27.8 
 
 
277 aa  85.5  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2575  amidohydrolase  29.07 
 
 
281 aa  82.4  0.000000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.457647 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3788  amidohydrolase 2  30.12 
 
 
313 aa  78.6  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0676519  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3634  putative amidohydrolase  26.33 
 
 
345 aa  78.2  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645114  normal  0.429944 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2642  amidohydrolase 2  28.52 
 
 
338 aa  77  0.0000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.25369  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1607  amidohydrolase 2  31.52 
 
 
332 aa  76.6  0.0000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5107  amidohydrolase 2  27.53 
 
 
258 aa  73.9  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.433963  normal  0.583494 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4553  amidohydrolase 2  27.49 
 
 
344 aa  73.9  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2944  amidohydrolase 2  28.45 
 
 
294 aa  73.6  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.19972  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0928  hypothetical protein  26.91 
 
 
285 aa  73.2  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0561  amidohydrolase 2  28.57 
 
 
283 aa  72.8  0.000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4405  amidohydrolase 2  26.19 
 
 
341 aa  72.8  0.000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.444752  normal  0.290728 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2151  amidohydrolase 2  28.57 
 
 
267 aa  72.8  0.000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2287  amidohydrolase 2  28.62 
 
 
309 aa  71.2  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0025243  decreased coverage  0.0000165 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3150  amidohydrolase 2  26.36 
 
 
334 aa  71.6  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.992513  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2838  amidohydrolase 2  23.61 
 
 
334 aa  69.3  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0085644  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2796  hypothetical protein  28.63 
 
 
340 aa  68.9  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0729  amidohydrolase 2  27.05 
 
 
353 aa  68.2  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.455369 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1748  amidohydrolase 2  27.24 
 
 
347 aa  68.6  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2657  amidohydrolase 2  25.94 
 
 
333 aa  68.9  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.840659  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0984  amidohydrolase 2  35 
 
 
268 aa  68.6  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.127508 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1377  amidohydrolase 2  28.4 
 
 
340 aa  68.9  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.895112  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3998  amidohydrolase 2  26.7 
 
 
310 aa  68.9  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.166388  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2603  hypothetical protein  25.3 
 
 
339 aa  68.2  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43860  Amidohydrolase  28.46 
 
 
283 aa  67.8  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.106274  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0664  amidohydrolase 2  23.61 
 
 
334 aa  67.8  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3105  amidohydrolase 2  24.6 
 
 
317 aa  67  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0508507  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0307  amidohydrolase 2  28.31 
 
 
279 aa  67.4  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.150485 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1504  amidohydrolase 2  28.24 
 
 
340 aa  67  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.315491 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3739  amidohydrolase 2  25.75 
 
 
364 aa  65.1  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3429  amidohydrolase 2  25.34 
 
 
301 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.671238 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2586  amidohydrolase 2  27.37 
 
 
262 aa  65.5  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000259256  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>