More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1592 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_1545  extracellular solute-binding protein  61.04 
 
 		 557 aa  709    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.2137  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1595  extracellular solute-binding protein  61.04 
 
 		 557 aa  709    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0133917  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1592  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 560 aa  1147    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.382923  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1553  extracellular solute-binding protein  50.27 
 
 		 559 aa  601  1.0000000000000001e-171  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.208561  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1676  extracellular solute-binding protein  44.7 
 
 		 636 aa  488  1e-136  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.24706  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3512  extracellular solute-binding protein family 5  43.01 
 
 		 580 aa  462  9.999999999999999e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.290938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0910  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, periplasmic components  42.28 
 
 		 572 aa  460  9.999999999999999e-129  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.293935  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0262  extracellular solute-binding protein family 5  39.85 
 
 		 587 aa  396  1e-109  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.578222  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0488  extracellular solute-binding protein  33.28 
 
 		 576 aa  293  5e-78  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0214  extracellular solute-binding protein family 5  31.68 
 
 		 609 aa  246  6e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000434403  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3658  extracellular solute-binding protein family 5  39.2 
 
 		 366 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.720757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0892  extracellular solute-binding protein  31.57 
 
 		 604 aa  233  8.000000000000001e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0914  extracellular solute-binding protein  31.39 
 
 		 604 aa  231  2e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3400  extracellular solute-binding protein family 5  28.2 
 
 		 567 aa  202  9.999999999999999e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.110204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17760  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  28.81 
 
 		 609 aa  201  1.9999999999999998e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.321388  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2073  extracellular solute-binding protein family 5  29.52 
 
 		 627 aa  199  7.999999999999999e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0694715  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2624  extracellular solute-binding protein family 5  29.63 
 
 		 547 aa  192  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.276954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5780  extracellular solute-binding protein family 5  28.74 
 
 		 548 aa  189  8e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0222518  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6684  extracellular solute-binding protein family 5  27.83 
 
 		 548 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.146405  normal  0.692475 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03423  hypothetical protein  28.11 
 
 		 560 aa  183  8.000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0482  extracellular solute-binding protein  29.34 
 
 		 531 aa  183  9.000000000000001e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0312851  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1397  extracellular solute-binding protein family 5  26.97 
 
 		 567 aa  181  4e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.75572 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002586  (GlcNAc)2 ABC transporter: substrate-binding protein  27.73 
 
 		 560 aa  178  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2745  extracellular solute-binding protein  27.36 
 
 		 551 aa  178  3e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3798  extracellular solute-binding protein family 5  28.4 
 
 		 557 aa  176  8e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0149  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  28.68 
 
 		 556 aa  174  5.999999999999999e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2397  extracellular solute-binding protein  28.01 
 
 		 597 aa  173  6.999999999999999e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0398  extracellular solute-binding protein  27.96 
 
 		 559 aa  173  6.999999999999999e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.333674  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0545  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  26.09 
 
 		 545 aa  172  1e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.00000683285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06390  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.13 
 
 		 552 aa  172  1e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.963018  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0038  extracellular solute-binding protein family 5  27.29 
 
 		 568 aa  171  4e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1398  extracellular solute-binding protein family 5  27.22 
 
 		 562 aa  166  2.0000000000000002e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.986828  normal  0.969327 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0933  extracellular solute-binding protein family 5  27.84 
 
 		 561 aa  161  2e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20180  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26.54 
 
 		 551 aa  160  5e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1485  extracellular solute-binding protein family 5  27.14 
 
 		 579 aa  160  7e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.522952 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0171  extracellular solute-binding protein family 5  27.61 
 
 		 540 aa  158  2e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5668  extracellular solute-binding protein family 5  26.62 
 
 		 557 aa  154  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1900  extracellular solute-binding protein family 5  27.63 
 
 		 569 aa  154  5.9999999999999996e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0147571  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3011  ABC transporter related  25.47 
 
 		 577 aa  152  1e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.631119  normal  0.383065 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0403  extracellular solute-binding protein family 5  28.49 
 
 		 565 aa  152  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.189174  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2512  extracellular solute-binding protein family 5  25.58 
 
 		 565 aa  152  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.012201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2510  extracellular solute-binding protein family 5  27.19 
 
 		 554 aa  150  4e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01310  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  25.83 
 
 		 564 aa  148  2.0000000000000003e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.860675  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1678  extracellular solute-binding protein family 5  26.97 
 
 		 553 aa  147  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.495361  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0853  extracellular solute-binding protein  26.46 
 
 		 625 aa  143  9e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.157029  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1178  extracellular solute-binding protein family 5  26.32 
 
 		 576 aa  142  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0876  extracellular solute-binding protein  26.14 
 
 		 625 aa  140  7.999999999999999e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0197038  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2053  extracellular solute-binding protein  25.89 
 
 		 579 aa  134  6e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0131056  normal  0.653692 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34930  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  25.79 
 
 		 563 aa  133  7.999999999999999e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.953561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3566  dipeptide/oligopeptide-binding protein  25.29 
 
 		 562 aa  131  3e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.672958  normal  0.0864129 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0631  extracellular solute-binding protein  24.79 
 
 		 611 aa  131  3e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.833854  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0273  extracellular solute-binding protein family 5  25.91 
 
 		 630 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000142627  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0328  extracellular solute-binding protein family 5  25.35 
 
 		 540 aa  127  6e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6188  extracellular solute-binding protein family 5  22.93 
 
 		 560 aa  127  6e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.215725  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0162  extracellular solute-binding protein family 5  24.96 
 
 		 620 aa  127  8.000000000000001e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000359667  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0485  extracellular solute-binding protein  26.69 
 
 		 619 aa  126  1e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2501  extracellular solute-binding protein family 5  24.28 
 
 		 608 aa  123  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2760  extracellular solute-binding protein  26.91 
 
 		 544 aa  122  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0906  extracellular solute-binding protein  25.13 
 
 		 659 aa  121  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2749  extracellular solute-binding protein family 5  25.09 
 
 		 645 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.655087  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6144  extracellular solute-binding protein family 5  27 
 
 		 533 aa  118  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.5133  hitchhiker  0.00348679 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1619  extracellular solute-binding protein  24.57 
 
 		 633 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00276535  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7456  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  24.71 
 
 		 563 aa  117  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.388989 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0343  extracellular solute-binding protein family 5  26.24 
 
 		 537 aa  116  8.999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2402  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  27.95 
 
 		 538 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1724  extracellular solute-binding protein family 5  25.5 
 
 		 625 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000147125  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0930  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  25.33 
 
 		 588 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.476779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1038  extracellular solute-binding protein  26.78 
 
 		 524 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0510  extracellular solute-binding protein  26.14 
 
 		 510 aa  114  6e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0306064  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3951  extracellular solute-binding protein family 5  24.47 
 
 		 633 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  25.27 
 
 		 524 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2377  extracellular solute-binding protein  26.85 
 
 		 552 aa  112  2.0000000000000002e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000449683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0450  extracellular solute-binding protein family 5  24.64 
 
 		 519 aa  110  5e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.15126 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0082  extracellular solute-binding protein family 5  24.62 
 
 		 636 aa  110  5e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.5866  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5891  extracellular solute-binding protein family 5  24.24 
 
 		 634 aa  110  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2571  extracellular solute-binding protein family 5  26.51 
 
 		 529 aa  110  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13754  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  27.31 
 
 		 516 aa  109  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6804  extracellular solute-binding protein family 5  24.53 
 
 		 634 aa  108  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.910845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1651  extracellular solute-binding protein  27.11 
 
 		 516 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3133  twin-arginine translocation pathway signal  26.41 
 
 		 529 aa  107  5e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.362143 
 
 
-
 
NC_002936  DET1494  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  28.76 
 
 		 543 aa  107  6e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0931394  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0645  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  25.56 
 
 		 524 aa  107  6e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9144  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  25.1 
 
 		 507 aa  107  6e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.215146  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21790  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  25.74 
 
 		 572 aa  107  6e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0631  extracellular solute-binding protein family 5  25.79 
 
 		 631 aa  107  7e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00116155  normal  0.250691 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0794  extracellular solute-binding protein family 5  28.57 
 
 		 1437 aa  107  7e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0894131  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1284  extracellular solute-binding protein  28.76 
 
 		 543 aa  107  7e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6559  extracellular solute-binding protein family 5  25.09 
 
 		 536 aa  107  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67626  normal  0.403463 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  25.15 
 
 		 565 aa  106  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0901  extracellular solute-binding protein family 5  23.06 
 
 		 675 aa  106  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5662  extracellular solute-binding protein  25.86 
 
 		 544 aa  105  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  26.88 
 
 		 521 aa  105  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.88 
 
 		 521 aa  105  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  26.88 
 
 		 521 aa  105  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1414  extracellular solute-binding protein family 5  26.9 
 
 		 636 aa  105  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  26.88 
 
 		 521 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0531  extracellular solute-binding protein  23.91 
 
 		 626 aa  105  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.716167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0195  extracellular solute-binding protein  26.83 
 
 		 526 aa  105  3e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1411  extracellular solute-binding protein  25.31 
 
 		 559 aa  104  4e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1303  extracellular solute-binding protein  25.93 
 
 		 504 aa  104  5e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.173146  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>