More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1303 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1303  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 504 aa  1036    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.173146  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1344  extracellular solute-binding protein  48.34 
 
 		 506 aa  455  1e-127  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.088373  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1850  extracellular solute-binding protein  44.97 
 
 		 499 aa  425  1e-117  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1988  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  31.65 
 
 		 505 aa  255  1.0000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.693495  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2203  extracellular solute-binding protein family 5  30.63 
 
 		 531 aa  228  2e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0247328 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3131  extracellular solute-binding protein  27.86 
 
 		 508 aa  192  1e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0263  extracellular solute-binding protein family 5  28.71 
 
 		 516 aa  161  3e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0801202  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2555  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, oligopeptide/dipeptide-binding protein  25.41 
 
 		 580 aa  159  1e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2258  solute-binding family 5 protein  25.41 
 
 		 579 aa  159  1e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  27.91 
 
 		 532 aa  156  1e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0788  extracellular solute-binding protein family 5  26.99 
 
 		 576 aa  155  2e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301156 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  24.85 
 
 		 539 aa  154  4e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1935  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  26.74 
 
 		 511 aa  154  5e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  27.06 
 
 		 520 aa  154  5e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2972  extracellular solute-binding protein  26.97 
 
 		 531 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  24.52 
 
 		 546 aa  152  8.999999999999999e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4559  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  26.8 
 
 		 530 aa  152  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1569  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  26.64 
 
 		 511 aa  151  2e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  25.5 
 
 		 534 aa  150  7e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4236  extracellular solute-binding protein  26.89 
 
 		 530 aa  149  8e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.978762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  26.03 
 
 		 538 aa  149  9e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2835  extracellular solute-binding protein  26.77 
 
 		 531 aa  149  9e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.827526 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09061  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, peptide-binding protein  24.62 
 
 		 538 aa  149  1.0000000000000001e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.593779  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1755  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  26.64 
 
 		 511 aa  149  1.0000000000000001e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  26.58 
 
 		 535 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  25.31 
 
 		 540 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1652  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  25.05 
 
 		 511 aa  149  1.0000000000000001e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.2387  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1135  4-phytase  25.76 
 
 		 520 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00134056  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  27.09 
 
 		 528 aa  149  2.0000000000000003e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  25.5 
 
 		 509 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2739  extracellular solute-binding protein family 5  26.72 
 
 		 541 aa  146  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.941667  normal  0.188577 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  25.6 
 
 		 533 aa  146  7.0000000000000006e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1615  extracellular solute-binding protein  26.72 
 
 		 541 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.577375  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1450  peptide ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.58 
 
 		 511 aa  144  3e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000430411  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5110  ABC transporter periplasmic binding protein  26.67 
 
 		 537 aa  144  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.321263  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58350  putative binding protein component of ABC transpor  26.86 
 
 		 537 aa  144  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0381  extracellular solute-binding protein  26.18 
 
 		 531 aa  144  5e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.265556 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2505  extracellular solute-binding protein family 5  26.76 
 
 		 531 aa  144  5e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1604  extracellular solute-binding protein  27.31 
 
 		 525 aa  144  5e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1638  extracellular solute-binding protein  27.31 
 
 		 525 aa  144  5e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.547791 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  25.2 
 
 		 534 aa  143  6e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0841  extracellular solute-binding protein  26.64 
 
 		 531 aa  143  7e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.960995  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3907  extracellular solute-binding protein family 5  26.83 
 
 		 535 aa  143  7e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4558  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein, putative  27 
 
 		 540 aa  143  8e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.44901  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6093  putative dipeptide ABC transporter binding protein subunit  28.48 
 
 		 526 aa  143  9e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.500432  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1552  extracellular solute-binding protein  26.99 
 
 		 551 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560356 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2938  extracellular solute-binding protein  25.98 
 
 		 531 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2411  extracellular solute-binding protein family 5  26.32 
 
 		 531 aa  142  9.999999999999999e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.334082  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  25.16 
 
 		 538 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2309  extracellular solute-binding protein  25.98 
 
 		 534 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2923  extracellular solute-binding protein  25.98 
 
 		 534 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  26.92 
 
 		 544 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2049  extracellular solute-binding protein  24.69 
 
 		 540 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0928  extracellular solute-binding protein  26.35 
 
 		 541 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  26.02 
 
 		 502 aa  140  4.999999999999999e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2650  acetate kinase  25.24 
 
 		 541 aa  140  6e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.76691 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2626  extracellular solute-binding protein family 5  25.34 
 
 		 503 aa  139  1e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.253128  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5114  ABC transporter periplasmic binding protein  25.99 
 
 		 533 aa  138  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0402  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  26.69 
 
 		 528 aa  138  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.882442  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4235  extracellular solute-binding protein  26.84 
 
 		 542 aa  138  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0816  extracellular solute-binding protein  26.12 
 
 		 533 aa  139  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6266  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  26.22 
 
 		 531 aa  138  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.857663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  25.89 
 
 		 541 aa  138  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0973  extracellular solute-binding protein  26.1 
 
 		 532 aa  138  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0924  extracellular solute-binding protein  26 
 
 		 541 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  24.52 
 
 		 521 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  24.52 
 
 		 521 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.52 
 
 		 521 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  24.52 
 
 		 521 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1977  extracellular solute-binding protein  26.8 
 
 		 506 aa  137  3.0000000000000003e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.719795 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2484  extracellular solute-binding protein  25.24 
 
 		 541 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0213722 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4557  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  27.24 
 
 		 535 aa  137  4e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1500  extracellular solute-binding protein  25.57 
 
 		 541 aa  137  4e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0422  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.5 
 
 		 528 aa  137  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.537378  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0885  dipeptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  26 
 
 		 541 aa  137  5e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.575043  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0091  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  26.5 
 
 		 528 aa  137  5e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2005  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  26.5 
 
 		 528 aa  137  5e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0584  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  26.5 
 
 		 528 aa  137  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.542939  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3091  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.5 
 
 		 528 aa  137  5e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0138  extracellular solute-binding protein  26.21 
 
 		 535 aa  137  5e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2283  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.5 
 
 		 528 aa  137  5e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0708849  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0184  extracellular solute-binding protein  25.31 
 
 		 535 aa  137  6.0000000000000005e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.507506 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1661  extracellular solute-binding protein  26.47 
 
 		 511 aa  136  8e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  25.44 
 
 		 565 aa  136  9e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2552  extracellular solute-binding protein  24.86 
 
 		 541 aa  136  9e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0329561 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0114  extracellular solute-binding protein  26.43 
 
 		 530 aa  136  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4293  extracellular solute-binding protein  26.04 
 
 		 541 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.5263  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  24.33 
 
 		 521 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0044  extracellular solute-binding protein family 5  24.72 
 
 		 535 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4250  peptide ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.06 
 
 		 528 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.146199 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4098  extracellular solute-binding protein family 5  24.34 
 
 		 535 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.711695  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70200  putative binding protein component of ABC dipeptide transporter  27.84 
 
 		 526 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4294  extracellular solute-binding protein  26.49 
 
 		 530 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.502669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0815  extracellular solute-binding protein  26.89 
 
 		 532 aa  135  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.17042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3828  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  25 
 
 		 526 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.808847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58390  putative binding protein component of ABC transpor  25.47 
 
 		 533 aa  135  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0168  4-phytase  23.85 
 
 		 535 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3863  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  23.85 
 
 		 535 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4037  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  23.85 
 
 		 535 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03346  hypothetical protein  23.85 
 
 		 535 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>