More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0977 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0977  WD-40 repeat-containing protein  100 
 
 		 580 aa  1167    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.121052  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0958  WD-40 repeat-containing protein  94.83 
 
 		 580 aa  1118    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  27.37 
 
 		 1454 aa  163  7e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  27.49 
 
 		 1523 aa  160  5e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  27.97 
 
 		 1236 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  26.77 
 
 		 696 aa  137  4e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  27.19 
 
 		 1364 aa  131  3e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3206  WD-40 repeat-containing protein  25.44 
 
 		 728 aa  129  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.772589  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  25.99 
 
 		 1363 aa  127  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  25.24 
 
 		 1868 aa  127  6e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  25.84 
 
 		 1789 aa  123  8e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1343  WD40 repeat, subgroup  25.52 
 
 		 1280 aa  122  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365079  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.97 
 
 		 930 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  24.02 
 
 		 1163 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  24.04 
 
 		 947 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.29 
 
 		 1481 aa  117  3.9999999999999997e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  28.49 
 
 		 1878 aa  115  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.94406 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.15 
 
 		 1711 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  25.65 
 
 		 1553 aa  115  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  29.97 
 
 		 1188 aa  115  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  23.87 
 
 		 1474 aa  115  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  22.83 
 
 		 1652 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  26.08 
 
 		 1510 aa  113  8.000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  25.62 
 
 		 1262 aa  112  2.0000000000000002e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  23.64 
 
 		 1214 aa  112  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2355  WD-40 repeat-containing protein  28.91 
 
 		 316 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.861794  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  25.73 
 
 		 1443 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.54 
 
 		 1598 aa  111  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  24.3 
 
 		 1229 aa  110  8.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  27.24 
 
 		 1161 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  27.24 
 
 		 1161 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  25.43 
 
 		 1217 aa  108  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  24.44 
 
 		 1807 aa  108  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  24.74 
 
 		 1247 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  24.35 
 
 		 1221 aa  107  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  35.51 
 
 		 1656 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.44 
 
 		 740 aa  105  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  26.04 
 
 		 505 aa  105  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0373  WD-40 repeat protein  31.71 
 
 		 316 aa  106  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000526871  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0213  WD-40 repeat-containing protein  29.83 
 
 		 316 aa  104  4e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000259833  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  24.11 
 
 		 1193 aa  102  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  26.06 
 
 		 1211 aa  101  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3823  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.11 
 
 		 1617 aa  101  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0782446 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0243  WD-40 repeat-containing protein  26.19 
 
 		 335 aa  102  3e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.87 
 
 		 1267 aa  101  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0103  WD-40 repeat-containing protein  21.56 
 
 		 1209 aa  100  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572371  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2218  WD-40 repeat protein  27.61 
 
 		 317 aa  100  5e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.845961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.16 
 
 		 677 aa  101  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  23.28 
 
 		 1190 aa  100  6e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1325  WD40 repeat, subgroup  22.39 
 
 		 1484 aa  100  9e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4979  WD-40 repeat-containing protein  25.39 
 
 		 578 aa  99  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.363391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  26.54 
 
 		 1766 aa  99  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3934  WD-40 repeat-containing protein  28.4 
 
 		 1599 aa  99  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.146607  unclonable  0.000100505 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2167  WD-40 repeat protein  26.87 
 
 		 316 aa  98.6  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.64 
 
 		 1623 aa  98.6  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.48 
 
 		 1607 aa  98.6  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  28.52 
 
 		 344 aa  98.2  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  23.72 
 
 		 1552 aa  97.4  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  29.64 
 
 		 1714 aa  97.1  8e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4034  WD40 domain-containing protein  30.42 
 
 		 657 aa  96.7  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1121  WD40 repeat, subgroup  23.47 
 
 		 608 aa  96.7  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285866  normal  0.998654 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  23.34 
 
 		 1348 aa  95.9  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1993  WD-40 repeat protein  27.12 
 
 		 316 aa  95.1  3e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.697085 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  27.58 
 
 		 1858 aa  95.1  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.86 
 
 		 1557 aa  94.4  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3295  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.49 
 
 		 1398 aa  94  6e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.39 
 
 		 1609 aa  94  7e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.97 
 
 		 1760 aa  93.6  9e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  25.2 
 
 		 1661 aa  92.8  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3896  serine/threonine protein kinase  27.55 
 
 		 687 aa  92.4  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  22.62 
 
 		 1213 aa  92.8  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6751  WD-40 repeat-containing protein  26.55 
 
 		 540 aa  91.7  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  27.27 
 
 		 344 aa  91.7  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10391  conserved hypothetical protein  25.43 
 
 		 577 aa  91.3  4e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.865472 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.45 
 
 		 1240 aa  91.3  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  26.67 
 
 		 1367 aa  90.9  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  23.64 
 
 		 1357 aa  90.9  6e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.68 
 
 		 1626 aa  90.9  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.25 
 
 		 1599 aa  90.5  7e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0575  Serine/threonine protein kinase-related protein  22.2 
 
 		 1856 aa  90.5  8e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.71 
 
 		 1583 aa  89  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  21.47 
 
 		 1188 aa  89.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.05 
 
 		 1686 aa  89  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  24.77 
 
 		 1176 aa  89  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.87 
 
 		 1684 aa  88.6  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.72 
 
 		 682 aa  88.2  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2226  WD-40 repeat-containing protein  26.79 
 
 		 464 aa  87.8  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797248  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  21.35 
 
 		 1831 aa  87.8  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.21 
 
 		 1547 aa  87.4  7e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  28.57 
 
 		 742 aa  87  8e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1285  WD-40 repeat-containing protein  28.81 
 
 		 1491 aa  87  9e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  26.64 
 
 		 1411 aa  86.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  23.12 
 
 		 1901 aa  85.9  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  23.77 
 
 		 1196 aa  85.9  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5605  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  21.57 
 
 		 1823 aa  85.1  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.899312  normal  0.15288 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  23.39 
 
 		 1208 aa  84.7  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  27.18 
 
 		 1164 aa  84.3  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1541  WD-40 repeat-containing protein  25.67 
 
 		 589 aa  83.6  0.000000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.67824  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.68 
 
 		 676 aa  83.6  0.000000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1508  WD-40 repeat protein  25 
 
 		 1373 aa  82.8  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000517344 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>