72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0680 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0680  C-5 sterol desaturase  100 
 
 		 271 aa  543  1e-153  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0146  fatty acid hydroxylase  51.85 
 
 		 257 aa  222  4e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113209 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3005  fatty acid hydroxylase  36.29 
 
 		 269 aa  172  3.9999999999999995e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0236  C-5 sterol desaturase  37.23 
 
 		 236 aa  141  9.999999999999999e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.652571  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3136  sterol desaturase  41.88 
 
 		 253 aa  140  3e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.868848 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2514  fatty acid hydroxylase  30.71 
 
 		 267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.842442  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05010  C-5 sterol desaturase, putative  31.19 
 
 		 328 aa  106  4e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.549969  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_6297  predicted protein  28.19 
 
 		 185 aa  88.6  1e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.711941  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2347  fatty acid hydroxylase  32.55 
 
 		 262 aa  84  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06506  sterol delta 5,6-desaturase ERG3 (AFU_orthologue; AFUA_6G05140)  25.33 
 
 		 352 aa  77.8  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.194474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14208  predicted protein  30.25 
 
 		 249 aa  73.9  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1692  fatty acid hydroxylase  30.77 
 
 		 248 aa  70.1  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28450  C-5 sterol desaturase (Sterol-C5-desaturase) (Ergosterol delta 5,6 desaturase)  28.86 
 
 		 369 aa  67.8  0.0000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.284899  normal  0.304884 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2491  fatty acid hydroxylase  28.31 
 
 		 344 aa  61.6  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.169325  normal  0.90493 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1983  fatty acid hydroxylase  27.48 
 
 		 272 aa  60.5  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0911  sterol desaturase  27.98 
 
 		 332 aa  60.8  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.186369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02945  sterol desaturase-related protein  31.47 
 
 		 267 aa  59.7  0.00000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2297  fatty acid hydroxylase  29.22 
 
 		 344 aa  59.3  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1393  sterol desaturase  29.86 
 
 		 272 aa  58.2  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.015069  normal  0.782198 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1488  fatty acid hydroxylase  24.63 
 
 		 231 aa  57  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.568753 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03638  conserved hypothetical protein  27.4 
 
 		 257 aa  57  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0179967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5014  sterol desaturase-like protein  27.27 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1382  fatty acid hydroxylase  29.03 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_18900  predicted protein  24.31 
 
 		 283 aa  55.5  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3766  fatty acid hydroxylase  28.83 
 
 		 330 aa  53.9  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.288136  normal  0.422159 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4042  fatty acid hydroxylase  28.83 
 
 		 330 aa  53.9  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.95273  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3403  C-5 sterol desaturase  27.92 
 
 		 326 aa  53.9  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2984  C-5 sterol desaturase  25.32 
 
 		 239 aa  53.9  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0218495  normal  0.0192453 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1140  hypothetical protein  26.67 
 
 		 304 aa  52.8  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.132577  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0427  sterol desaturase-like protein  25.3 
 
 		 295 aa  52  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.27499  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0045  hypothetical protein  30.62 
 
 		 291 aa  51.6  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1012  hypothetical protein  26.94 
 
 		 337 aa  51.2  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4333  sterol desaturase-like protein  25.89 
 
 		 407 aa  51.2  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06973  C-4 methyl sterol oxidase Erg25, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04820)  26.01 
 
 		 302 aa  51.6  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.244737  hitchhiker  0.0000000000000142581 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1390  membrane protein  27.01 
 
 		 267 aa  51.6  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104354  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003512  sterol desaturase  25.77 
 
 		 273 aa  50.4  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0972  putative sterol desaturase  32.66 
 
 		 272 aa  50.1  0.00004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895829 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09275  C-4 methylsterol oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01160)  23.68 
 
 		 259 aa  49.3  0.00007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000567385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2963  putative sterol desaturase  28.02 
 
 		 270 aa  48.9  0.00008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6776  fatty acid hydroxylase  28.38 
 
 		 334 aa  48.9  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.159357 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78360  predicted protein  26.83 
 
 		 305 aa  48.5  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47593  predicted protein  30.08 
 
 		 663 aa  48.1  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3510  sterol desaturase  23.4 
 
 		 259 aa  48.1  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.695011 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03230  sphingosine hydroxylase, putative  28.03 
 
 		 346 aa  47  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1699  sterol desaturase family protein  24.29 
 
 		 196 aa  45.8  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.844125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45494  predicted protein  24.27 
 
 		 348 aa  45.8  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2864  fatty acid hydroxylase  29.45 
 
 		 377 aa  45.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.640766 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02573  conserved hypothetical protein  23.31 
 
 		 313 aa  45.4  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.0000109595  normal  0.411684 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1810  sterol desaturase-related protein  28.66 
 
 		 386 aa  45.4  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0163387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2550  sterol desaturase family protein  27.68 
 
 		 287 aa  45.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.534316 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4808  fatty acid hydroxylase  29.79 
 
 		 408 aa  44.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0968431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3693  YhhN family protein  25 
 
 		 597 aa  44.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.392021 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02255  hypothetical protein  24.34 
 
 		 281 aa  44.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0365  fatty acid hydroxylase  25.14 
 
 		 274 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3261  hypothetical protein  30 
 
 		 264 aa  43.1  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0633506  hitchhiker  0.0000000000915879 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7771  fatty acid hydroxylase  25.85 
 
 		 284 aa  43.5  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.186795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1443  fatty acid hydroxylase  25 
 
 		 264 aa  43.5  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000016954  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02410  C-4 methyl sterol oxidase, putative  26.23 
 
 		 343 aa  43.1  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4137  fatty acid hydroxylase  28.1 
 
 		 374 aa  42.7  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4418  fatty acid hydroxylase  28.76 
 
 		 374 aa  43.1  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3910  fatty acid hydroxylase  29.61 
 
 		 256 aa  42.7  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0633105  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0136  hypothetical protein  22.54 
 
 		 270 aa  42.7  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.45703  normal  0.319961 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2637  fatty acid hydroxylase  28.4 
 
 		 328 aa  42.7  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38826  predicted protein  26.04 
 
 		 282 aa  42.7  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.914013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4620  fatty acid hydroxylase  28 
 
 		 288 aa  42.4  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.405841 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01793  putative C-5 sterol desaturase  25.47 
 
 		 265 aa  42.7  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.14977  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08907  C-4 methyl sterol oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02440)  28.99 
 
 		 291 aa  42.4  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.225916  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7012  fatty acid hydroxylase  30.99 
 
 		 321 aa  42.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1574  sterol desaturase, putative  24.47 
 
 		 264 aa  42.4  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0147058  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0500  YhhN family protein  24.42 
 
 		 597 aa  42.4  0.009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.602107  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74706  membrane-bound non-heme di-iron oxygenase involved in lipid metabolism  26.16 
 
 		 294 aa  42.4  0.009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1104  sterol desaturase-related protein  27.78 
 
 		 278 aa  42  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0432208  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>