More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2239 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_2239  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  100 
 
 		 217 aa  435  1e-121  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0241987  normal  0.443331 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12471  hypothetical protein  48.48 
 
 		 252 aa  189  4e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0490  OmpA/MotB domain-containing protein  43.65 
 
 		 200 aa  107  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0962072  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02680  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)protein  45.69 
 
 		 430 aa  99  5e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.181066  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3216  OmpA/MotB domain-containing protein  39.87 
 
 		 176 aa  99  6e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2675  OmpA/MotB domain protein  37.88 
 
 		 233 aa  97.4  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.242946  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0800  OmpA/MotB domain protein  47.32 
 
 		 362 aa  96.3  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0995  OmpA/MotB domain protein  48.15 
 
 		 179 aa  94.4  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0704  OmpA/MotB domain protein  34.34 
 
 		 217 aa  94  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  48.11 
 
 		 375 aa  93.6  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02523  OmpA family outer membrane protein  45.54 
 
 		 365 aa  93.2  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.654383  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0626  OmpA/MotB domain protein  44.83 
 
 		 366 aa  92.8  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000153451  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0547  OmpA/MotB domain protein  40.35 
 
 		 671 aa  92.4  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  39.26 
 
 		 240 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3949  OmpA/MotB family outer membrane protein  42.59 
 
 		 407 aa  90.9  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243665  normal  0.26275 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0727  OmpA/MotB domain protein  44.55 
 
 		 178 aa  90.5  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  41.03 
 
 		 466 aa  89.7  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  34.9 
 
 		 230 aa  89  5e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  41.44 
 
 		 261 aa  88.2  8e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  40.34 
 
 		 429 aa  87.8  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1255  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  39.34 
 
 		 422 aa  87.4  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.201684  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  38.02 
 
 		 223 aa  86.7  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2198  OmpA/MotB domain protein  35.65 
 
 		 594 aa  86.3  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000013848  decreased coverage  0.000000000020207 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  41.03 
 
 		 344 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0546  OmpA/MotB domain-containing protein  38.13 
 
 		 205 aa  86.7  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.42623 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  38.85 
 
 		 296 aa  86.7  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  41.74 
 
 		 478 aa  85.1  7e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1901  OmpA/MotB domain protein  41.28 
 
 		 335 aa  84.7  9e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000028398  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  45.05 
 
 		 376 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  43.24 
 
 		 420 aa  83.2  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  41.07 
 
 		 447 aa  82.8  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  40.54 
 
 		 263 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3744  OmpA/MotB domain protein  38.74 
 
 		 679 aa  82.8  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000811796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1220  OmpA/MotB  43.86 
 
 		 231 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3028  OmpA/MotB  41.03 
 
 		 213 aa  82  0.000000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.251626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  36.76 
 
 		 239 aa  82  0.000000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6364  OmpA/MotB domain-containing protein  43.33 
 
 		 231 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.1144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  38.21 
 
 		 218 aa  81.6  0.000000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  38.66 
 
 		 264 aa  81.6  0.000000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  39.64 
 
 		 263 aa  81.6  0.000000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  38.84 
 
 		 427 aa  81.6  0.000000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  40.54 
 
 		 262 aa  81.6  0.000000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  37.61 
 
 		 344 aa  81.6  0.000000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  37.61 
 
 		 344 aa  81.6  0.000000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  37.61 
 
 		 345 aa  81.3  0.000000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  38.46 
 
 		 344 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  37.61 
 
 		 344 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  37.61 
 
 		 344 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1107  OmpA/MotB domain-containing protein  40.54 
 
 		 263 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1563  OmpA/MotB domain protein  37.4 
 
 		 231 aa  81.3  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398665  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  36.84 
 
 		 374 aa  80.9  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  40.37 
 
 		 266 aa  80.5  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2042  OmpA/MotB  41.07 
 
 		 286 aa  80.1  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  37.29 
 
 		 224 aa  80.1  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2092  OmpF family protein  40.74 
 
 		 327 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207533  normal  0.0999951 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0181  OmpA/MotB domain protein  36.44 
 
 		 263 aa  80.1  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1022  OmpA/MotB domain protein  38.71 
 
 		 228 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  38.05 
 
 		 210 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1463  OmpA/MotB domain protein  39.68 
 
 		 193 aa  80.5  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.373103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1602  outer membrane protein OprF  38.74 
 
 		 240 aa  79.7  0.00000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2821  OmpA/MotB domain-containing protein  37.4 
 
 		 236 aa  79.7  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3958  OmpA/MotB domain protein  40.54 
 
 		 499 aa  79.7  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.330203 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3238  OmpA/MotB domain protein  39.52 
 
 		 228 aa  79.3  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1741  OmpA/MotB domain protein  35.78 
 
 		 586 aa  79.3  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1985  OmpA/MotB domain-containing protein  35.25 
 
 		 221 aa  79.3  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4257  OmpA/MotB  39.83 
 
 		 215 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4096  OmpA/MotB domain protein  37.41 
 
 		 180 aa  79.3  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.287994  normal  0.208215 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0181  OmpA/MotB domain-containing protein  37.4 
 
 		 224 aa  79.3  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.235186 
 
 
-
 
NC_004310  BR1204  OmpA family protein  35.2 
 
 		 220 aa  79  0.00000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0762  OmpA/MotB domain protein  38.79 
 
 		 236 aa  79  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.420349  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5365  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 		 534 aa  79  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.794185  normal  0.887949 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1167  OmpA family protein  35.2 
 
 		 243 aa  79  0.00000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  37.61 
 
 		 350 aa  78.6  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  36.75 
 
 		 351 aa  78.6  0.00000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  37.61 
 
 		 350 aa  78.6  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1880  outer membrane protein  42.86 
 
 		 375 aa  78.2  0.00000000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000687097  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  39.29 
 
 		 261 aa  78.2  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1802  OmpA/MotB domain-containing protein  42.86 
 
 		 375 aa  78.2  0.00000000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252189  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  39.29 
 
 		 261 aa  78.2  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5262  OmpA/MotB  40.52 
 
 		 575 aa  77.8  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0244  outer membrane protein  32.88 
 
 		 331 aa  77.4  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1604  OmpA family protein  41.82 
 
 		 558 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.395642  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1033  OmpA family protein  37.9 
 
 		 228 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.383964  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0131  OmpA family protein  41.82 
 
 		 542 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2786  OmpA/MotB  33.85 
 
 		 481 aa  78.2  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.187099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 244 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6431  OmpA/MotB domain protein  38.52 
 
 		 449 aa  77.8  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2694  OmpA/MotB domain-containing protein  37.9 
 
 		 228 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.110946 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0728  OmpA/MotB domain protein  41.8 
 
 		 209 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3652  OmpA/MotB domain-containing protein  37.3 
 
 		 166 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.549445  normal  0.986121 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2813  OmpA/MotB domain protein  34.43 
 
 		 221 aa  76.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  42.24 
 
 		 219 aa  77  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3096  OmpA family protein  34.68 
 
 		 222 aa  77  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.625816  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1805  OmpA/OmpF family outer membrane protein  40.18 
 
 		 217 aa  77.4  0.0000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04793  OmpA family protein  38.84 
 
 		 241 aa  77.4  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188001  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  35.86 
 
 		 226 aa  77.4  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2087  OmpA/MotB  40.18 
 
 		 217 aa  76.6  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  31.33 
 
 		 640 aa  77  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0328  OmpA/MotB domain-containing protein  34.43 
 
 		 224 aa  77.4  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0195  OmpA/MotB domain-containing protein  37.1 
 
 		 228 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>